Comments 156
Спасибо, вы взорвали мне мозг. ©
особенно этим:
ATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATTCTTGTTGAATTAGATGGTGATGTTAATG
GGCACAAATTTTCTGTCAGTGGAGAGGGTGAAGGTGATGCAACATACGGAAAACTTACCCTTAAATTTAT
TTGCACTACTGGAAAACTACCTGTTCCATGGCCAACACTTGTCACTACTTTCGGTTATGGTGTTCAATGC
TTTGCGAGATACCCAGATCATATGAAACAGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCTGAAGGTTATGTAC
AGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACACGTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGA
TACCCTTGTTAATAGAATCGAGTTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGATGGAAACATTCTTGGACACAAA
TTGGAATACAACTATAACTCACACAATGTATACATCATGGCAGACAAACAAAAGAATGGAATCAAAGTTA
ACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGATGGAAGCGTTCAACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCC
AATTGGCGATGGCCCTGTCCTTTTACCAGACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCGAAAGAT
CCCAACGAAAAGAGAGACCACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTACACATGGCATGG
ATGAACTATACAAATAA
особенно этим:
ATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATTCTTGTTGAATTAGATGGTGATGTTAATG
GGCACAAATTTTCTGTCAGTGGAGAGGGTGAAGGTGATGCAACATACGGAAAACTTACCCTTAAATTTAT
TTGCACTACTGGAAAACTACCTGTTCCATGGCCAACACTTGTCACTACTTTCGGTTATGGTGTTCAATGC
TTTGCGAGATACCCAGATCATATGAAACAGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCTGAAGGTTATGTAC
AGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACACGTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGA
TACCCTTGTTAATAGAATCGAGTTAAAAGGTATTGATTTTAAAGAAGATGGAAACATTCTTGGACACAAA
TTGGAATACAACTATAACTCACACAATGTATACATCATGGCAGACAAACAAAAGAATGGAATCAAAGTTA
ACTTCAAAATTAGACACAACATTGAAGATGGAAGCGTTCAACTAGCAGACCATTATCAACAAAATACTCC
AATTGGCGATGGCCCTGTCCTTTTACCAGACAACCATTACCTGTCCACACAATCTGCCCTTTCGAAAGAT
CCCAACGAAAAGAGAGACCACATGGTCCTTCTTGAGTTTGTAACAGCTGCTGGGATTACACATGGCATGG
ATGAACTATACAAATAA
Черт, я был уверен, что занес это в черновики :( Что ж, пусть будет так.
В этом месте я плакал
ACCCAGATCATATGAAACAGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCTGAAGGTTATGTAC
AGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACACGTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGA
TACCCTTGTTAATAGAATCGAGT
ACCCAGATCATATGAAACAGCATGACTTTTTCAAGAGTGCCATGCCTGAAGGTTATGTAC
AGGAAAGAACTATATTTTTCAAAGATGACGGGAACTACAAGACACGTGCTGAAGTCAAGTTTGAAGGTGA
TACCCTTGTTAATAGAATCGAGT
Да, у меня тоже кажись мозг сломалсяяяяяяяяяяя…
последовательность нуклеотидов, кажется еще в школе проходят. :)
Одно дело проходить, а другое дело, когда понимаешь, что люди реально с этими простынями букв работают :)
Для облегчения чтения этого всякие программы, кстати есть полезные (можно размечать области, искать участки гомологии, отделять структурные элементы друг от друга). Но все равно код первичен.
Для облегчения чтения этого всякие программы, кстати есть полезные (можно размечать области, искать участки гомологии, отделять структурные элементы друг от друга). Но все равно код первичен.
Безусловно Вы правы. Кстати видел на одной из кафедр медуниверситета iMac с какимто ультранавороченным (и дорогим, ~10k если не врали) софтом именно для этого. Правда не понял и половины из того что объяснял мне человек, с ним работающий…
А статья интересная, да. Завтра покажу другу — кандидату, как раз молодому светилу от генетики, предвкушаю интересную беседу.
А статья интересная, да. Завтра покажу другу — кандидату, как раз молодому светилу от генетики, предвкушаю интересную беседу.
Хе-хе, не удивительно. Код похож BrainF*ck :)
Хабракат?
очень круто, жду продолжения.
Прочел один раз… надо будет перечитать еще раз или два минимум. Но на самом деле оч. даже интересно, хоть и странно видеть подобный материал на IT-ресурсе.
Еще!
интересно. продолжайте. :)
хоть и не увлекаюсь этим, но прочитал с удовольствием (сессия, не к экзаменам же готовиться;)
жду следующих статей.
надеюсь и по IT тематике тоже будут:)
спасибо
жду следующих статей.
надеюсь и по IT тематике тоже будут:)
спасибо
говорят, что математики имеют склонности к музыке.
айтишники, выходит, к биологии?
и знаете что… мне это действительно интересно! =)
айтишники, выходит, к биологии?
и знаете что… мне это действительно интересно! =)
Сама работа ДНК и наследственного аппарата очень интересна с точки зрения информатики, может быть об этом тоже как-нибудь напишу. Это же редкий пример когда программа только и делает, что исполняет сама себя разными способами :)
UFO just landed and posted this here
Не согласен.
Жена юрист…
Жена юрист…
UFO just landed and posted this here
Курс правоведения в университете у нас вел юрист, специализирующаяся в области телекоммуникаций, и она нам сама рассказала, что ей понять технические особенности сотовых сетей очень сложно, а нам, радиотехникам, изучить юриспруденцию в разы легче. Видимо сильно влияет практичный, инженерный подход к вещам.
ЗЫ Да, и мне ещё со школы интересная и химия и генетика, особенно как работают ретро-вирусы :)
ЗЫ Да, и мне ещё со школы интересная и химия и генетика, особенно как работают ретро-вирусы :)
Опыт учебы на юрфаке мне подсказывает, что все-таки не очень. :)
Скорее, врачи и юристы.
И тем, и другим нужно дедуктивное мышление (из общих законов выводим действия в данной конкретной ситуации).
А в науке нужно мышление индуктивное (от фактов к теории).
И тем, и другим нужно дедуктивное мышление (из общих законов выводим действия в данной конкретной ситуации).
А в науке нужно мышление индуктивное (от фактов к теории).
я в десятом классе второе место на окружной олимпиаде по биологии занял)
при том, что первого не было — никто не занял
при том, что первого не было — никто не занял
Спасибо, ждемс продолжения!
из пожеланий что хотелось бы еще узнать о генных манипуляциях для людей непосвященных:
— вредны ли генно-модифицированные продукты и существует ли способ определить вредность…
— если стал известен ген (у человека) который отвечает за интересующую нас функцию (например Рост), есть ли и какие способы подавлять/способствовать влиянию этого гена на человека (в текущей жизни, а не у потомков в последующих поколениях)
— так сказать «на пальцах» про стволовые клетки и что это и как они становятся нужными видами клеток/органами
— вредны ли генно-модифицированные продукты и существует ли способ определить вредность…
— если стал известен ген (у человека) который отвечает за интересующую нас функцию (например Рост), есть ли и какие способы подавлять/способствовать влиянию этого гена на человека (в текущей жизни, а не у потомков в последующих поколениях)
— так сказать «на пальцах» про стволовые клетки и что это и как они становятся нужными видами клеток/органами
ПРО ГМО действительно интересно!!! С удовольствием бы почитал!
ГМО — Генетически модифицированные организмы, если кто не понял :)
Ну попробуйте.
1. В общем смысле не вредны, но тема интересна всякими неочевидными аспектами поведения трансгенных организмов в биоценозах. Я подумаю, можно ли это будет изложить популярно.
2. Ага, понял. Хорошая тема и очень сложная, кстати. Не факт, что я смогу по ней хорошо объяснить, подумаю над этим.
3. Еще одна сложная тема. Расскажу про генные каскады :) Самая «программистская» из всех, кстати.
2. Ага, понял. Хорошая тема и очень сложная, кстати. Не факт, что я смогу по ней хорошо объяснить, подумаю над этим.
3. Еще одна сложная тема. Расскажу про генные каскады :) Самая «программистская» из всех, кстати.
Про ГМП конечно интересный вопрос, но мне кажется что ответ на него почти очевиден, если подумать, чем отличается для нашего желудка обычные клетки от г.м.
Они вредны только с экономической точки зрения, т.к. производство конечного продукта дешевле в итоге.
Именно поэтому раздувается мегапиар на тему, что это вредно и ставятся всякие маркеры типа «нет ГМО».
Если встать на точку зрения сторонников запрета ГМО, то можно прийти к экстремуму, что вредно всё антропогенное и мы должны жить в пещерах, как в каменном веке.
Именно поэтому раздувается мегапиар на тему, что это вредно и ставятся всякие маркеры типа «нет ГМО».
Если встать на точку зрения сторонников запрета ГМО, то можно прийти к экстремуму, что вредно всё антропогенное и мы должны жить в пещерах, как в каменном веке.
С экономической точки зрения ГМП как раз полезнее, т.к. как иначе прокормить всё растущее население земли?
С экономической точки зрения все, что снижает себестоимость конечного продукта, полезно. А конечная цена — зависит от платежеспособного спроса. Т. е. чтобы у потребителей (широких масс, если мы говорим о с-х) было чем заплатить за все разнообразие продуктов. А чем сегодня платит потребитель — прежде всего квалифицированной рабочей силой (неквалифицированная фактически дотируется государством и прямой прибыли не приносит), плодами интеллектуального труда. Для чего необходимы не только хлеб и вода, но и…
Байки о вреде ГМО распространяют производители, позиционирующие себя как «экологичные». Для особо озабоченных потребителей. Обычная война старого и нового (извозчики против машин), в которой всегда рано или поздно побеждает новое.
Байки о вреде ГМО распространяют производители, позиционирующие себя как «экологичные». Для особо озабоченных потребителей. Обычная война старого и нового (извозчики против машин), в которой всегда рано или поздно побеждает новое.
— к генно-модифицированному растению нужно относится как к абсолютно новому виду. Исследовать его съедобность /несъедобность, полезность/вредность. И вредность, если она будет, будет относится только к этому растению, а не генно-модифицированным растениям в целом. Существуют необоснованные опасения что чужие гены встроенные в растение априори опасны, ядовиты, могут проникать в человека при поедании растения. При поедании абсолютно все равно съели вы муху с помидором, или съели помидор с генами мухи. В обоих случаях в желудок попадают одинаковые гены и одинаково разлагаются. Вероятно, что и белки попадут одинаковые. Но существует вероятность, что ген мухи в помидоре будет вести себя по другому, чем в самой мухе (эффект положения). Поэтому мухопомидор нужно рассматривать как новое растение, похожее на помидор с мухами :). Абсолютно нормальный мутант :)
— В некоторых случаях можно выключать и включать гены. Но тут лучше специалисты объяснят про регуляцию да экспрессию. Но тема эта сложная. Еще можно сделать вирус который встраивается в ДНК и кодирует гормон роста или производство морфин. Правда такое грубое вторжение ни к чему хорошему не приведет. И думаю, что, например, превратить человека в муху нереально — слишком большие изменения в физиологии и организм не выживет, если даже такой процесс получится запустить.
— В некоторых случаях можно выключать и включать гены. Но тут лучше специалисты объяснят про регуляцию да экспрессию. Но тема эта сложная. Еще можно сделать вирус который встраивается в ДНК и кодирует гормон роста или производство морфин. Правда такое грубое вторжение ни к чему хорошему не приведет. И думаю, что, например, превратить человека в муху нереально — слишком большие изменения в физиологии и организм не выживет, если даже такой процесс получится запустить.
Вообщето я имел ввиду подавление генов не с целью превратить человека в муху, а в целях лечения генных заболеваний или отклоненений, или в идеальном случае — увеличения срока человеческой жизни (где-то читал что возраст отмеренный человеку зашит в каком-то гене)…
Но в целом, ход ваших мыслей мне понравился ;-)
Но в целом, ход ваших мыслей мне понравился ;-)
мегакруто, требуем продолжения
С удовольствием почитал бы таких статей еще.
в общеобразовательных целях полезно, вдруг в кроссфорде будет
Спасибо!
Здорово! Спасибо!
Ждем не дождемся нанороботов.
Уже что-то подобное замутили здесь: lenta.ru/news/2009/01/06/walking/
Как я понимаю, он шагает с помощью ДНК по белку, но ведь еще не вечер? :)
Прокомментите пожалуста.
Уже что-то подобное замутили здесь: lenta.ru/news/2009/01/06/walking/
Как я понимаю, он шагает с помощью ДНК по белку, но ведь еще не вечер? :)
Прокомментите пожалуста.
Статья понравилась, только интересно, как все-гаки любители умудряются заниматься этим в домашних условиях? Ведб наверняка требуется недешевое оборудование, препараты, которые не так просто достать простому человеку. Или на западе уже продаются какие-нибудь наборы юного генетика?
Забыл указать цены на приборы и реактивы. Вообще-то из совершенно необходимых вещей тут амплификатор, центрифуга для переосаждения ДНК и камера для фореза, этот комплект потянет тысячи на две долларов (если брать старые модели б/у), но умельцы это могут сделать на коленке (пожалуй, кроме центрифуги).
Я уже где-то читал про выделение нужного гена, только там было слишком много слов, которых я не понял. В этот раз было очень увлекательно. Спасибо. С нетерпением жду продолжения.
Очень интересно как эту полоску внедрить в елку :)
Очень интересно как эту полоску внедрить в елку :)
после слова «молекула» пришел тихий ужас =) не силён я в био… ну разве что луковицу ийодом поливать =)
Прочитал с огромным удовольствием, жду продолжения :)
Очень интересно.
По возможности продолжайте.
PS У djvu в посте 7 января 2009, 22:55 достаточно интересные вопросы (особенно второй), но воможно для начала стоит закончить с начатой темой.
Спасибо!
По возможности продолжайте.
PS У djvu в посте 7 января 2009, 22:55 достаточно интересные вопросы (особенно второй), но воможно для начала стоит закончить с начатой темой.
Спасибо!
Достаточно адекватно на понятном языке. Спасибо!
Пара замечаний:
1. В каждой моей клетке обычно 46 или 92 линейные молекулы ДНК (хромосомы) и до нескольких сот кольцевых (митохондриальная ДНК).
2. При описании реакции «писуар» лучше указать, что праймеры одноцепочечные и что синтез идёт только в одном направлении.
Пара замечаний:
1. В каждой моей клетке обычно 46 или 92 линейные молекулы ДНК (хромосомы) и до нескольких сот кольцевых (митохондриальная ДНК).
2. При описании реакции «писуар» лучше указать, что праймеры одноцепочечные и что синтез идёт только в одном направлении.
1. Безусловно, апдейтну пост. Просто для целей генной инженерии обычно мы оперируем количеством молекул, несущих компию гена, а их именно две и я не акцентировал внимание на других хромосомах.
2. Там одно за другое потянет, мне кажется это бы вышло за рамки такой краткой статьи. Если кто подробно интересуется, лучше в википеди почитать, там хорошо описано.
2. Там одно за другое потянет, мне кажется это бы вышло за рамки такой краткой статьи. Если кто подробно интересуется, лучше в википеди почитать, там хорошо описано.
Весьма занимательно.
Очень живо написано, действительно стало понятней.
Здорово! Хочу ещё.
Ничего не понял, но очень интересно =)
Супер! Жду продолжения
Хочу к Вам!!! =)
Более алгоритмизированно это описано здесь www.keldysh.ru/papers/2005/prep57/prep2005_57.html
Интересно.
Интересно.
Очень интересно, спасибо.
Спасибо за очень интересную статью!
П.С. А еще меня ужасно смешили игры вида «Вставил ген краба — получил клешню вместо руки». Теперь они будут смешить меня еще громче :)
П.С. А еще меня ужасно смешили игры вида «Вставил ген краба — получил клешню вместо руки». Теперь они будут смешить меня еще громче :)
Да, это самая главная ошибка тех, кто этим не занимается. На самом же деле манипуляция с генами происходит на гораздо более элементарном уровне и до клешни вместо руки там еще очень, очень далеко.
Мы умеем манипулировать теми признаками, которые могут быть изменены работой максимум нескольких генов, но не десятков и сотен.
И еще, намного проще разрушить какую-то функцию (как говорят биологи, нокаутировать ген), чем создать какую-то новую.
Мы умеем манипулировать теми признаками, которые могут быть изменены работой максимум нескольких генов, но не десятков и сотен.
И еще, намного проще разрушить какую-то функцию (как говорят биологи, нокаутировать ген), чем создать какую-то новую.
>И еще, намного проще разрушить какую-то функцию (как говорят биологи, нокаутировать ген), чем создать какую-то новую.
Сразу же приходят в голову ассоциации вида: человечество на данном этапе как неандерталец с дубиной, ворвавшийся в информационный центр, забитый серверами. В состоянии порубать, сжечь и раскромсать что угодно, а вот разобраться (иуж тем более повторить) — силы не те. :(
Сразу же приходят в голову ассоциации вида: человечество на данном этапе как неандерталец с дубиной, ворвавшийся в информационный центр, забитый серверами. В состоянии порубать, сжечь и раскромсать что угодно, а вот разобраться (иуж тем более повторить) — силы не те. :(
Так оно по сути и получается :)
Классика: www.metodolog.ru/00373/00373.html
Очень советую прочесть всем.
Классика: www.metodolog.ru/00373/00373.html
Очень советую прочесть всем.
Офигенно! Продолжайте!
Ребят, ниче не понял, честно. Но жутко заинтерисовало (с раннего детства люблю биологию). Пишите еще!
UFO just landed and posted this here
Вирус можно собрать икусственно, причем вообще, полностью с нуля. Если приводить аналогию с программами, то клетка — это полноценная ОС. Даже самая простая ОС все равно крайне сложна биологически, поэтому до сих пор живой клетки не синтезировали, хотя есть целый проект на эту тему.
Вирус же представляет собой простую программу заточенную под конкретную ОС и содержит совсем мало команд.
Вирус же представляет собой простую программу заточенную под конкретную ОС и содержит совсем мало команд.
Вот так «на пальца» программистам и надо объяснять биологию. Все образно и понятно :)
спасибо
узнал много нового
жду продолжения! (8
узнал много нового
жду продолжения! (8
UFO just landed and posted this here
Надо. Это позволяет быть разносторонним человеком. Тягу к знаниям лично я считаю это просто базовой ценностью, ну т.е. это хорошо просто потому что это хорошо :)
Ведь все равно чтобы реально все это проделывать на практике, придется учиться минимум 2-3 года как теоретически, так и практически. Здесь очень много подводных камней.
Зато люди будут представлять как процесс происходит с точки зрения тех, кто реально с ним работает, а не с точки зрения журналистов, прости господи :)
Ведь все равно чтобы реально все это проделывать на практике, придется учиться минимум 2-3 года как теоретически, так и практически. Здесь очень много подводных камней.
Зато люди будут представлять как процесс происходит с точки зрения тех, кто реально с ним работает, а не с точки зрения журналистов, прости господи :)
UFO just landed and posted this here
Каждый человек должен знать границы своего уровня компетентности и спорить только внутри него. Спорить снаружи него — бессмысленно, лучше уж книжку по теме почитать. В то же время это не должно мешать интересоваться чем-то и за пределами этого круга, просто не нужно думать, что ты во всех темах являешься специалистом, которому есть что сказать.
Спасибо, отличная статья! Вы прямо разожгли во мне интерес! С нетерпением жду продолжения.
охренительно!
Немного не понимаю как работает этот фрагмент — GTATTGATTTTAAAGAA
Дык всё элементарно:
* GTA: «Grand Theft Auto» — Grand theft Auto
* TT: Можно трактовать двояко: то ли это тульский Токарев, то ли Audi TT. Неоднозначно как-то…
* GAT: если посчитать, что gat — пистолет на американском сленге, то TT (предыдущий пункт)— всё так и Токарев
* TTT — процесс срельбы из этого самого Токарева
* AAA — вопли раненного
* GAA — радость стрелявшего.
Судя по всему, описание какого-то квеста из GTA.
* GTA: «Grand Theft Auto» — Grand theft Auto
* TT: Можно трактовать двояко: то ли это тульский Токарев, то ли Audi TT. Неоднозначно как-то…
* GAT: если посчитать, что gat — пистолет на американском сленге, то TT (предыдущий пункт)— всё так и Токарев
* TTT — процесс срельбы из этого самого Токарева
* AAA — вопли раненного
* GAA — радость стрелявшего.
Судя по всему, описание какого-то квеста из GTA.
спасибо! очень интересно! прочёл на одном дыхании!
О!!! Вот ради таких статей и читаю Хабр! Жду продолжения!
Огромное спасибо! Статья супер. Обязательно, продолжайте.
Если можно вопрос. В школе, к сожалению, всего этого не учил, навёрстываю сейчас.
Если правильно понял в одной молекуле ДНК может содержаться несколько генов. В каждой клетке бутявки находится две ДНК и в каждой из них множество генов. То есть, выделить ДНК гена bl1 означает, что мы воссоздаём какой-то определённый фрагмент ДНК бутявки, верно?
Если можно вопрос. В школе, к сожалению, всего этого не учил, навёрстываю сейчас.
Если правильно понял в одной молекуле ДНК может содержаться несколько генов. В каждой клетке бутявки находится две ДНК и в каждой из них множество генов. То есть, выделить ДНК гена bl1 означает, что мы воссоздаём какой-то определённый фрагмент ДНК бутявки, верно?
самый главный вопрос — можно ли все это реализовать в домашних условиях? то есть при наличии «паяльника и прямых рук» (можем собрать любую печку/холодильник программируемый) и обычного микроскопа из магазина (ну пусть за 30 тыр)
Может отдельный блог создать? Кармы уже хватает.
Пожалуй так и сделаю.
Предлагаю название «Биотехнологии».
Оказывается, такой блог уже есть :) habrahabr.ru/blogs/biotech/
Переношу туда.
Переношу туда.
хорошая статья — достаточно неплохо и интересно написано, чего не скажешь о многих последних пуликациях на хабре. с удовольствием прочитаю продолжение.
ещё, просто интересно, а где вы работаете? :)
Спасибо за ликбез!!! ждем продолжения :)
Прочитал на одном дыхании! Мегареспект и квадроуважуха от меня. В частности за стиль изложения ;-)
Кое-что не понял в силу своего ума, а кое-что — будто бы из-за того что оно мало освещено. Вот примеры.
/* Мы выбиваем из шефа командировку на побережье Мальдивских островов, где только и водится пресловутая бутявка морская (Butiavka marina). */
А откуда известно что она подходит для выделения гена? Ладно если она светится, но если её свойства не такие видимые?
/* Ловим ее, толчем в порошок, заливаем последовательно разными химическими гадостями чтобы из всей массы тканей в растворе остались только молекулы ДНК. */
Мне непонятно как это (принципиально) работает. Чем характерны эти гадости, что только ДНК и оставляют? :-о
Кое-что не понял в силу своего ума, а кое-что — будто бы из-за того что оно мало освещено. Вот примеры.
/* Мы выбиваем из шефа командировку на побережье Мальдивских островов, где только и водится пресловутая бутявка морская (Butiavka marina). */
А откуда известно что она подходит для выделения гена? Ладно если она светится, но если её свойства не такие видимые?
/* Ловим ее, толчем в порошок, заливаем последовательно разными химическими гадостями чтобы из всей массы тканей в растворе остались только молекулы ДНК. */
Мне непонятно как это (принципиально) работает. Чем характерны эти гадости, что только ДНК и оставляют? :-о
Ага… с бутявки вроде как всё и начиналось. Если так, первый вопрос закрыт.
Один из основных методов выделения ДНК основан на обработке экстрактов клеток раствором додецилсульфатом натрия (ДСН, SDS) — молекулы ДСН имеют длинный гидрофобный хвост, который проникает вглубь белков, а гидрофильная головка способствует растворению получающегося комплекса и освобождению ДНК от упаковывающих её белков. С ДНК ДСН не взаимодействует, поэтому ДНК остаётся в растворе. После очистки раствора от деградированных белков (центрифугированием) ДНК высаждается из раствора ледяным спиртом (этиловым или изопропиловым).
Про бутявку мы узнаем обычно из чужих статей.
Выделение ДНК происходит по следующим реакциям:
1. Сначала добавляется детергент+ литический агент (чтобы клетки разрушить), либо просто детергент. Молекулы клетки в этом случае разбиваются из своих комплексов и переходят в раствор. В качестве литического раствора может применяться обычная щелочь.
2. центрифугирование и удаление нерастворимых фракций.
3. Добавляют фенол/хлороформ для того, чтобы белки выпали в осадок.
4. Центрифугирование и удаление выпавших в осадок белков.
5. Дополнительная очистка, если нужно.
6. Добавление этилового или изопропилового спирта, выпадение ДНК в осадок. Сливаем надосадочную жидкость и поучаем препарат.
А подробно протоколы есть тут: molbiol.ru/protocol/
Выделение ДНК происходит по следующим реакциям:
1. Сначала добавляется детергент+ литический агент (чтобы клетки разрушить), либо просто детергент. Молекулы клетки в этом случае разбиваются из своих комплексов и переходят в раствор. В качестве литического раствора может применяться обычная щелочь.
2. центрифугирование и удаление нерастворимых фракций.
3. Добавляют фенол/хлороформ для того, чтобы белки выпали в осадок.
4. Центрифугирование и удаление выпавших в осадок белков.
5. Дополнительная очистка, если нужно.
6. Добавление этилового или изопропилового спирта, выпадение ДНК в осадок. Сливаем надосадочную жидкость и поучаем препарат.
А подробно протоколы есть тут: molbiol.ru/protocol/
Интересно.
Скажите, а есть разница между
ATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATT и
ATGAGTAAGGGGGAGGAGCTTTTTACGGGGGTTGTTCCTATT?
(Надеюсь я не ошибся при перекодировании:)
Хотя еще более интересен механизм ограничения роста. Как яблоко знает что оно круглое, а огурец вытянутый. Где это хранится и как работает? Вот что занимает меня в биологии в последнее время. Может Вы знаете известен ли это механизм ученым, или у меня есть шанс прославится :)
Скажите, а есть разница между
ATGAGTAAAGGAGAAGAACTTTTCACTGGAGTTGTCCCAATT и
ATGAGTAAGGGGGAGGAGCTTTTTACGGGGGTTGTTCCTATT?
(Надеюсь я не ошибся при перекодировании:)
Хотя еще более интересен механизм ограничения роста. Как яблоко знает что оно круглое, а огурец вытянутый. Где это хранится и как работает? Вот что занимает меня в биологии в последнее время. Может Вы знаете известен ли это механизм ученым, или у меня есть шанс прославится :)
Вы уже не первый задаете этот вопрос. Я расскажу о регуляции развития как только закончу с этой темой.
Насчет разницы между последовательностями. Это зависит от того, что за последовательности и какую функцию несут. Геном имеет свойство вырожденности, наиболее сильно проявляющееся в той части ДНК, которая непосредственно кодирует белки. То есть один и тот же смысл можно записать разными буквами.
Если вы имели ввиду вырожденность триплетного кода (т.е. при кодированиии белков), то где-то ошиблись, последовательности не совпадают ;)
Насчет разницы между последовательностями. Это зависит от того, что за последовательности и какую функцию несут. Геном имеет свойство вырожденности, наиболее сильно проявляющееся в той части ДНК, которая непосредственно кодирует белки. То есть один и тот же смысл можно записать разными буквами.
Если вы имели ввиду вырожденность триплетного кода (т.е. при кодированиии белков), то где-то ошиблись, последовательности не совпадают ;)
Эх ошибся таки
Ага. Именно это и имел. Интересно различается ли действие генов если они кодируют один и тот же белок, но разными последовательностями.
Значит люди в белом выяснили механизм роста и формирования формы. Эх пропала моя нобелевская :(
Ага. Именно это и имел. Интересно различается ли действие генов если они кодируют один и тот же белок, но разными последовательностями.
Значит люди в белом выяснили механизм роста и формирования формы. Эх пропала моя нобелевская :(
>Интересно различается ли действие генов если они кодируют один и тот же белок, но разными последовательностями.
Если последовательность белка в итоге получается та же самая то не различаются.
Другое дело, что в гене есть не только кодирующая часть, но и некодирующие, несущие служебную информацию. Вот различия в тех частях могут повлиять на то, будет белок синтезироваться или нет, а если будет, то в каких случаях, несмотря на то, что это будет все тот же белок.
Если последовательность белка в итоге получается та же самая то не различаются.
Другое дело, что в гене есть не только кодирующая часть, но и некодирующие, несущие служебную информацию. Вот различия в тех частях могут повлиять на то, будет белок синтезироваться или нет, а если будет, то в каких случаях, несмотря на то, что это будет все тот же белок.
Я буду давать наглядные и понятные обычным людям примеры для описания сложных процессов — Спасибо тебе суперЧеловек)
Спасибо за статью, хотя не могу не отметить досадную ошибку.
>>На каждой стадии наращивания эффективность составляет порядка 99%.
>>На каждой стадии наращивания эффективность составляет порядка 99%.
Комментарий почему-то отправился
Спасибо за статью, хотя не могу не отметить досадную ошибку.
>>На каждой стадии наращивания эффективность составляет порядка 99%.
>>представьте, что нам нужно сделать молекулу длиной в 1000 букв?
>>Тогда применяя банальную арифметику окажется, что доля верных молекул составит 0,99^1000=0,00004
Это не банальная арифметика, а теория вероятности, которая гласит, что предыдущие эксперименты не влияют на вероятности следующих.
Проще говоря, если эффективность составляет 99% на каждой стадии экперимента, то из 1000 букв неверными будут 1%, а 99% будут верными, как и положено.
Другое дело, если бы вы ставили вопрос: какая вероятность того, что все 1000 букв подряд будут верными — вот тогда она будет составлять 0,99^1000=0,00004
Спасибо за статью, хотя не могу не отметить досадную ошибку.
>>На каждой стадии наращивания эффективность составляет порядка 99%.
>>представьте, что нам нужно сделать молекулу длиной в 1000 букв?
>>Тогда применяя банальную арифметику окажется, что доля верных молекул составит 0,99^1000=0,00004
Это не банальная арифметика, а теория вероятности, которая гласит, что предыдущие эксперименты не влияют на вероятности следующих.
Проще говоря, если эффективность составляет 99% на каждой стадии экперимента, то из 1000 букв неверными будут 1%, а 99% будут верными, как и положено.
Другое дело, если бы вы ставили вопрос: какая вероятность того, что все 1000 букв подряд будут верными — вот тогда она будет составлять 0,99^1000=0,00004
Крайне интересно! Продолжайте.
Можно было назвать цикл статей: «Генная инженерия — это просто!».))
Можно было назвать цикл статей: «Генная инженерия — это просто!».))
Сразу вспомнила родной универ и практику.
P.S. Кроме вырожденности генетического кода есть еще альтернативный сплайсинг и прочие радости жизни
P.S. Кроме вырожденности генетического кода есть еще альтернативный сплайсинг и прочие радости жизни
мне вот интересно — будет ли в конце елка? =) так что продолжайте!
Хорошоя статья и понятная, что очень важно. Но хотелось уточнить, как происходит отсеивание ДНК от молекулы? Тоесть они ведь все на биологической основе и по-идее на саму ДНК эти химические вещества должны так-же действовать. Разрушается ли какая часть ДНК при этом «отсеивание»?
Это всё конечно мысле на основе более чем дилитанских знаний в этой области, так что просьба сильно не бить! :-)
Это всё конечно мысле на основе более чем дилитанских знаний в этой области, так что просьба сильно не бить! :-)
Сама ДНК обычно в процессе манипуляций (отсеивание от белков и других молекул клетки) рвется на части длиной 10-100 тысяч пар оснований (ее начальная длина обычно миллионы и сотни миллионов), но это не мешает, так как процессы тут статистические и если уж какая-то молекула ДНК порвалась в области нашего гена, то в растворе всегда есть те, которые в этом месте остались целыми.
наткнулся на внятную картинку ДНК котрая связывает упомянутый выше код «ATGAGTAAAGGAG...» с привычной обывателю двойной спиралью с перемычками:
www.scq.ubc.ca/wp-content/dna.gif (через тег img картинка не отображается… :( )
www.scq.ubc.ca/wp-content/dna.gif (через тег img картинка не отображается… :( )
Здорово! Только вопрос к вам — вы начинаете оперировать понятием «ген» и не даете его примерного определения:) Отсюда же неясна связь гена с молекулами ДНК:)
За статью спасибо, с нетерпением жду продложения!
За статью спасибо, с нетерпением жду продложения!
вопрос — а разве ДНК в геле не разрушается связываясь с бромистым этидием?
И еще, вспомнил что есть игра по этому поводу: www.old-games.ru/game/1552.html
И еще, вспомнил что есть игра по этому поводу: www.old-games.ru/game/1552.html
Пишите еще, весьма приятно такое почитать :) Еех, когда-то и я стажировался в молбиол-лаборатории… :) но жизненная дорожка пошла в несколько другом направлении…
Тут ребята по проблемам молекулярной биологии общаются www.molbiol.ru/
Хорошая статья. Ждем продолжения!
Не понял только про ПЦР. Есть молекула началом гена (20-30 букв), есть молекула с концом гена (20-30 букв). Как получается нужный кусок в сотню генов между началом и концом? Каким-то образом копируется с молекулы ДНК бутявки?
Не понял только про ПЦР. Есть молекула началом гена (20-30 букв), есть молекула с концом гена (20-30 букв). Как получается нужный кусок в сотню генов между началом и концом? Каким-то образом копируется с молекулы ДНК бутявки?
Потрясающе интересно и хорошо написано! Спасибо огромное.
Пошёл после Вашей статьи читать в энциклопедии про ПЦР: "… основан на многократном избирательном копировании определённого участка ДНК при помощи ферментов..."
А существует какое-то объяснение почему так происходит?
Ну т.е., если я правильно понял, то, разбавив раствор праймерами и «стройматериалами», мы запускаем реакцию в результате которой праймеры достраиваются до полных генов, так?
Есть какое-то объяснение или хотя бы детальное описание этого механизма достройки? Попытался найти сам, но в итоге понял что даже не знаю в какую сторону копать.
Пошёл после Вашей статьи читать в энциклопедии про ПЦР: "… основан на многократном избирательном копировании определённого участка ДНК при помощи ферментов..."
А существует какое-то объяснение почему так происходит?
Ну т.е., если я правильно понял, то, разбавив раствор праймерами и «стройматериалами», мы запускаем реакцию в результате которой праймеры достраиваются до полных генов, так?
Есть какое-то объяснение или хотя бы детальное описание этого механизма достройки? Попытался найти сам, но в итоге понял что даже не знаю в какую сторону копать.
Вас интересует общая схема реакции или именно механизм присоединения нуклеотидов к растущей цепи днк?
Если первое, то общая схема реакции есть в википедии.
Если второе, то грубо говоря фермент — полимераза ползет по матричной цепи ДНК и строит около нее комплиментарную цепь. Если хотите найти подробнее, то ищите по слову taq polymerase (taq — это одна из полимераз использующаяся в ПЦР), но там уже будет заморочная химия.
Если первое, то общая схема реакции есть в википедии.
Если второе, то грубо говоря фермент — полимераза ползет по матричной цепи ДНК и строит около нее комплиментарную цепь. Если хотите найти подробнее, то ищите по слову taq polymerase (taq — это одна из полимераз использующаяся в ПЦР), но там уже будет заморочная химия.
Спасибо за хорошую статью!
Sign up to leave a comment.
Генная инженерия от A до Z