Comments 32
Остывая, агар передает свое тепло чашке и воздуху в ней. Воздух расширяется, а после остывания сжимается, как бы засасывая атмосферу в чашку. Вместе с ней порой залетают и споры посторонней флоры, вызывая контаминацию (загрязнение или заражение).Давно дело было, точно не помню, но кажется мы давали чашкам застыть в боксе при включенном УФ.
Как итог — вместе с влагой в стерильный термостат попали споры стрептомицетов и аспергиллов, пара спор заселила одну из чашек, и быстро выросла, произведя пару тысяч спор. К понедельнику весь термостат был мокрый, а все чашки заросли.Вы чашки не переворачиваете вверх ногами при выращивании в термостате?
Да, мы тоже оставляем чашки остывать в боксе при включённом УФ. Но, увы, не всегда это помогает. На оптически прозрачных средах ещё срабатывает, а на мутных средах и средах с кальцием уже нет)
Переворачиваем, но это не очень спасает от капающег с потолка термостата конденсата. Плюс если попадут грибы, им ничего не стоит "заползти" по стенке чашки, если слой агара 5мм
И это ещё хорошо, если ты вовремя обнаружил контаминацию. Не знаю как с бактериями и т.д., но при работе с клетками контаминация обнаруживается достаточно быстро, однако при контаминации микоплазмой ты можешь растить свою культуру не подозревая ни о чем. И раз от раза получать невоспроизводимые результаты. И если в лабе нет практики контроля микоплазмы, а особенно если коллектив рукожопы, то микоплазма будет везде. Ты не будешь знать о ней и мучаться со своими экспериментами пока не решишь проверить...
Не знаю как с бактериями и т.д., но при работе с клетками контаминация обнаруживается достаточно быстро, однако при контаминации микоплазмой ты можешь растить свою культуру не подозревая ни о чем.Большинство микоплазм внутриклеточный паразит, то есть в данном случае это уже не контаминация (загрязнение), а заражение культуры. Как если бы бактерий бактериофагами заразить.
В случае с бактериальными культурами все будет сильно зависеть от того, какого типа у нас исследования. Если у нас лабораторные культуры с четко известным маркером (например устойчивость к какому-то антибиотку или способность утилизировать не стандартный субстрат типа нафталина), то очистка культуры от загрязнений достаточно тривиальна на селективной среде, где загрязнители загнутся, а наша культура вырастет. А вот если исследуются какие-то природные пробы без маркеров, то тут уже так просто разделять не получится.
Да, вы правы)
Я работаю в основном с универсальными микрооранизмами или природными изолятами, а к ним особо не примешь селективные среды антбиотиками. К тому же, во время опытов по совместному культивированию среды с аб в принципе не применяются)
Интересно как все в мире бактериальных культур. Буду знать теперь.
По моему опыту самое сложное это понять, что у тебя культура заражена (особенно интересно когда кросс контаминация с другой клеточной линией), а также понять откуда пошло заражение (чаще всего этот шаг невозможен). А очистка культуры или утилизация это уже второе.
Примерно также. Контаминацию какой-нибудь грибной или дрожжевое ересью обнаруживает быстро, уже на следующий день обычно. Но в случае, если выращиваешь какой-нибудь мощный гриб вроде фузариума или быстрорастущую бактерию как бациллюс, то просто не заметишь, пока не прекратится рост основной культуры и контаминант не вылезет наружу, уже испортив образец)
Простите, я, наверное, тупой...
поставила в термостат переувлаженные чашки с семенами [...] Выходные выдались жаркими, [..] растения в тепле начали делать это в два раза сильнее.
Разве задача термостата не в том, чтобы поддерживать внутри заданную температуру, вне зависимости от того, жаркие ли выходные снаружи?
Как итог - вместе с влагой в стерильный термостат попали споры
Разве термостат не герметичен? Как в него могла попасть влага и споры?
1) Жаркие выходные дни я уверен есть у каждого вне зависимости от погоды снаружи, когда хочется рвать волосы на голове и орать слово на букву С.. как Козловский. А материал написан нашим автором вчера вечером о наболевшем и накипевшем.
2)Каким бы герметичным термостат не был, при открытии и закрытии двери туда попадает воздух и одно дело, когда воздух и все вокруг в термостате стабилизированы, а другое дело, когда холодильник путают с термостатом, как было например у меня. Человек положил свой салат в термостат с моими готовящимеся препаратами с клещами. Его не смутило, что на термостате горит 60 градусов и не смутило его тепло, которое там шпарит, все-таки мне казалось 60 градусов ощутимы— это было ошибкой. По итогу открываю дверь, а там баня, пар как в бане— туманом, а препараты и салат можно выкидывать. Человека тоже удивило почему столько влаги в термостате, а вот меня нет, потому что у меня была физиология растений, где мы изучали физиологическую особенность растений выделять влагу при повышении температуры, создавая для них баню разными способами (сухую и мокрую). Тут не салат, но тоже растения, которые очевидно были не стерильны
Да, задача термостата - поддерживать температуру. Но в условиях, когда внутри термостата 24 градуса, а снаружи 40, не спасают даже толстые стенки.
Да и термостат не 100% герметичен, в нем есть вентиляция, плюс люди же открывают дверь, ставя и проверяя чашки.
Конкретно в том случае, вода и посторонние организмы попали с семян, вместе с влагой стекли из чашек с проростками на пол. 24 градуса достаточная температура для небольшого, но постоянного испарения.
С технической части замечу, что термостат обычно делается на нагревание до заданной температуры. А вот на охлаждение нет. И как вы и заметили при 40 снаружи вся температура будет выравниваться к 40, а термостат просто будет сигнализировать тревогу
Не совсем так. У меня на работе хладотермостат стоит. Он внешне как холодильник, только с одной камерой. Он может держать температуру до -20, либо до +50
Не знаю как в России в лабах, но в Сингапуре в лабах все же стараются хоть в чем-то экономить и не покупать излишние функции. Тем более техника что выпускается для лаб сразу имеет +300% к цене. Поэтому у нас и не найдешь универсальных термостатов: либо холодильник, либо печка. И кондиционирование помещений, конечно.
Да, у меня, к сожалению, такой.
Всё охлаждение сводится к прекращению нагрева и включению вентиляции. А с вентиляцией может залететь ещё больше влаги и контаминантов.
Никогда даже близко не была знакома с работой микробиологов. Спасибо Вам огромное за такой подробный экскурс.
Да, используют, но не всегда его можно применить. Например, когда образцы - разные штаммы, или когда сеешь на тестирование антагонистичнской активности. Плюс нужен бокс с хорошей вытяжкой)
Вот когда надо получить рассеводной культуры или моноклоновый изоляы, тогда да - множесвенный посев шпатнлем или лопаткой самое оно)
Всегда было интересно узнать: обычные люди смотрят на плесень и грибок с отвращением, кого-то даже тошнит.
А как относятся к плесени на хлебе люди, которые видят подобное по долгу службы чуть ли не каждый день?
Пишите еще, во имя и ради Петри, Пастера и Хавкина!
на препросмотре
по ссылке:
Так и должно быть. Это анонс-вступление
Мы с Вами почти коллеги. Только я пользуюсь результатами Вашего труда - антибиотиками, вакцинами и прочими вещами, которые без биотехнологии не существовали бы. Спасибо Вам за труд.
С огромным удовольствием прочитал статью, почти впервые на Хабре чувствую себя не лишним и понимающим что же, собственно хотел сказать автор. Буду благодарен Вам за продолжение.
Я тоже иногда разглядываю бацилл, когда берешь после студентов (слава богу аликвоченную по мелким пенициллинкам) среду.
Спасибо. Дам сыну почитать. А то слово "биотехнологииэтакрута!" выучил, а на кухне убраться тщательно - не выучил.
Погодите, а как же вишенка на торте?
Тысячи тысяч микропипетаций.
Очень это "любил".
Доброго времени суток друзья!
Понимаю, что сейчас это не просто норма, но и правило. Но если текст начинается с ошибки, то доверие к нему нулевое. Выделение обращения запятыми, похоже, считается уделом "ботанов" и "душнил" :( Печально.
Дневник Биотехнолога. Краткий экскурс