Pull to refresh
  • by relevance
  • by date
  • by rating

OpenWorm — международный проект по созданию компьютерной модели червя

Open source *Programming *


OpenWorm — попытка построить полную симуляцию червя, состоящего из 302 нервных клеток и 95 мышечных.
Проект стартовал в начале 2011 года и в настоящее время продолжает свое существование с помощью сотрудничества ученых и программистов из США, России и Европы. Все усилия рассматриваются как первый шаг на пути к имитации больших биологических систем. Для построения модели взят червь C. elegans.
Читать дальше →
Total votes 87: ↑83 and ↓4 +79
Views 56K
Comments 69

OpenWorm: цифровая модель червя-нематоды в браузере

Biotechnologies Crowdsourcing Artificial Intelligence
Крошечная нематода, или круглый червь Caenorhabditis elegans длиной около миллиметра — один из самых изученных организмов на Земле. Это первый многоклеточный организм, геном которого был полностью секвенирован. У C. elegans два пола — самцы и гермафордиты. Взрослая гермафордитная особь состоит всего из 959 клеток, а её нервная система — из 302 нейронов. Все связи между нейронами C. elegans (коннектом) также полностью описаны. Обилие всесторонней научной информации об этом черве и относительная простота его устройства несколько лет назад вдохновили сотрудников лаборатории моделирования сложных систем института систем информатики имени А. П. Ершова СО РАН создать исчерпывающую компьютерную модель C. elegans.

Со временем проект привлёк несколько десятков участников по всему миру, однако продолжал оставаться малоизвестным и недоступным для широкой публики: не так-то просто разобраться в том обилии исходных данных, касающихся устройства червя, и множестве подсистем модели, написанных на разных языках программирования, не говоря уже о том, чтобы установить и запустить всё это у себя на компьютере. В то же время, C. elegans широко используется при изучении биологии, и возможность «погонять» модель червя, с подробностями и в динамике рассмотреть, как он устроен, трудно переоценить. Поэтому команда проекта решила сделать модель доступной онлайн — чтобы любой желающий смог просто зайти на сайт проекта и заглянуть в «матрицу» в которой обитает виртуальный организм. В этом и заключается суть проекта OpenWorm на Кикстартере.


Читать дальше →
Total votes 65: ↑60 and ↓5 +55
Views 22K
Comments 23

Какая связь между червем длиной около миллиметра и OpenCL?

High performance *GPGPU *
image

Недавно на хабре была статья про проект OpenWorm. Проект использует OpenCL для расчета гидродинамики сглаженных частиц как на CPU, так и на GPU. Среди исследователей/разработчиков есть наши соотечественники Андрей Пальянов и Сергей Хайрулин из сибирского отделения Российской академии наук.

Под катом география комьюнити OpenWorm, а так же рейтинг популярности разработки на OpenCL по странам и ссылки на примеры для версии стандарта 2.0
Читать дальше →
Total votes 20: ↑12 and ↓8 +4
Views 7.4K
Comments 3

Цифровую модель мозга червя-нематоды загрузили в робота из Lego

Robotics Popular science Artificial Intelligence

Моделирование работы мозга человека — задача, выполнить которую ученые смогут только в отдаленном будушем (если вообще смогут). Отобразить в цифровой модели все эти миллиарды соединений между нейронами, а также смоделировать обмен информацией пока никому не под силу.

Но это касается мозга человека. А вот упрощенную модель мозга простейшего червя-нематоды уже создали. На Гиках уже публиковалась статья о проекте OpenWorm, участники которого стараются создать цифровую модель червя, как мозг, так и все тело.
Читать дальше →
Total votes 41: ↑37 and ↓4 +33
Views 35K
Comments 30

Концепт переноса сознания червя в робота

Robotics Biotechnologies Artificial Intelligence Brain


Основная задача состоит в реализации нервной системы круглого червя c. elegans в теле робота таким способом, чтобы все поведение контролировалось этой нейронной сетью.
Читать дальше →
Total votes 23: ↑23 and ↓0 +23
Views 14K
Comments 4

OPENTadpole: первое кибернетическое животное

Biotechnologies Artificial Intelligence Brain
image

Здравствуйте, уважаемое сообщество GeekTimes! После своего длительного молчания, я хочу представить свой новый проект. OPENTadpole – приложение, состоящее из полноценного редактора нервной системы головастика лягушки и физической эмуляции тела головастика и внешней среды. Возможность с нуля создать, настроить и отредактировать коннектом животного и немедленно увидеть, как Ваше творение отражается в его поведении.


Total votes 49: ↑49 and ↓0 +49
Views 21K
Comments 34