Хочу поделиться еще одним способом решения такой проблемы, как запуск более одного mysql-server на одном linux-сервере. Я думаю, что некоторые из вас уже пробовали это делать, запуская руками, например, вот так:

 mysqld_safe --defaults-file=...my2.cnf... &

Я считаю этот подход не совсем правильным хотя бы потому, что корректно завершить такой запущенный mysql-сервер получится не всегда. Можно ещё, конечно, использовать mysqld_multi, но лично я предпочитаю полностью «изолировать» друг от друга инстансы. Именно поэтому я и предлагаю вам в своей публикации использовать в помощь систему инициализации.