s0ko1ok

Да, на моем сайте я выложил исходники по секвенатору. Планирую в нем также совместить и ДНК- синтезатор.

Код теперь доступен на моем сайте:
sokolov.expert

А там дозировка, вообще, по моему не столь важна. За счет терминатора к каждой цепочки прикрепится только 1 нуклеотид.

То, что от места клапана до места пересечения будет мертвая зона, в которой будет оставаться реагент, и загрязнять подаваемый от другого клапана.

Перед этим мне хотелось бы быстро и дешево получать данные для обработки, из того что я хочу.

Хотелось бы более подробно узнать про реакционные колонки.

Использовать как праймеры для пцр, Интегрировать в другой организм с помощью, например, вирусного вектора.

Где-то можно взглянуть на их внутренности?

Да, но может делать только короткие последовательности. Где-то до 200 нуклеотидов. Более длинные обычно копируются из чего-нибудь живого с помощью ПЦР и вставляются куда надо с помощью CRISPR/Cas9.

Можно ссылочку на такие клапаны?

Энкодеры есть на самом синтезаторе, можно взять их. Конкретно на клапане — стоит две оптопары и два диска, через которые они просвечивают. Я так понимаю, люфта можно избежать, если клапан находится на одной оси с шаговиком.

Флюидика — жидкостная система подачи реагентов.
Роторный клапан — клапан, в котором ротор при в вращении переключает соосный вход на любой из радиальных выходов в статоре. Вот здесь есть схема его работы.
Энкодер нужен для точного совмещения каналов подачи реагентов в статоре и роторе.

это тоже выросло из собственных увлечений и это самообразование

Несколько вопросов:
— Где планируете брать расходники (неспецифические и праймеры)?
— Как планируете накапливать ДНК (есть ли у вас амплификатор)?
— Есть ли механизм подачи/отмывки реагентов на чип?
— Какую длину рида планируете достичь?
— Какую скорость чтения планируете достичь?

1) По началу использовать родные. Праймеры не проблема синтезировать, последовательности известны.
2) Есть самодельный амплификатор.
3) Система подачи реагентов разрабатывается
4,5) Все как у родного прибора.

Из оборудования у меня было: Осцил ds-203 (на фото), микроскоп Биомед металлургический (можно было использовать и более простой), ну и паяльная станция. Работа помогла только микроскопом.
Лабораторий таких, по крайней мере в Москве, довольно много.

Привет -) Заезжай в гости -)