Искусственный интеллект МТИ открыл новый антибиотик

    image

    Сотрудники Массачусетского технологического института (МТИ) синтезировали новый мощный антибиотик. Для этого они использовали алгоритмы машинного обучения, говорится на сайте МТИ. Новое вещество назвали галицином (halicin) в честь бортового компьютера космического корабля из «Космической одиссеи 2001 года» HAL 9000.

    Искусственный интеллект проверяет структуру сотен миллионов химических соединений и выявляет их свойства. Такую задачу перед ИИ поставили, чтобы найти вещества, которые потенциально могли бы стать антибиотиками с механизмом действия, отличным от уже существующих лекарств.

    По словам профессора медицины в Институте медицинской инженерии и науки МТИ Джеймса Коллинза, учёные планировали создать платформу для создания новых препаратов, которая бы использовала возможности искусственного интеллекта. Это станет началом новой эры синтеза антибиотиков, уверен он. Команде удалось получить этим методом первое вещество, которое, возможно, станет мощнейшим антибиотиком из всех когда-либо созданных, говорит Коллинз. Кроме того, ИИ выявил ещё несколько препаратов, которые могут иметь необходимые свойства — их будут проверять в дальнейшем.

    Искусственный интеллект сможет исследовать широкий спектр химических соединений, изучение которых традиционными методами потребовало бы огромных затрат, говорит профессор электротехники и компьютерных наук в Лаборатории компьютерных наук и искусственного интеллекта МТИ Регина Барзилай.

    В последние несколько десятилетий было получено сравнительно мало новых антибиотиков, и практически все они лишь немного отличаются структурно и по механизму действия от разработанных ранее лекарств. Современные методы скрининга довольно дороги и позволяют исследовать слишком небольшое количество химических соединений. Ситуация осложняется ростом устойчивости болезнетворных патогенов к антибиотикам. Коллинз и Барзилай собрали команду, которая разработала компьютерные модели машинного обучения. С их помощью можно будет анализировать большие выборки химических структур и выбирать из них те, которые потенциально смогут убивать микроорганизмы.

    Для обучения ИИ учёные использовали около 2500 соединений, из которых 1700 — одобренные управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) препараты, а остальные 800 — вещества из натуральных продуктов с широким спектром биологической активности. Затем нейросеть изучила 6000 новых соединений, и нашла среди них одну молекулу, которая, как и прогнозировалось, показала высокую антибактериальную активность. При этом структура синтезированного вещества существенно отличается от известных ранее антибиотиков.

    Интересно, что изначально галицин исследовали как лекарство от диабета. Учёные проверили свойства вещества на десятках штаммов бактерий, включая бактерии туберкулёза, клостридии и аэробные бациллы — практически все культуры погибли под воздействием галицина, кроме синегнойной палочки — с трудом поддающегося лечению патогена, вызывающего заболевания лёгких. Более того, лекарство испытали на мышах, заражённых аэробными бациллами — вызываемые ими инфекции поражали американских солдат, дислоцированных в Ираке и Афганистане — и спустя сутки после применения организмы зверьков полностью очистились от бактерий. Также учёные изучили резистентность кишечной палочки к нему — согласно результатам исследования, микроорганизмы не развивали способность игнорировать антибиотик через 30 дней после начала применения. При этом резистентность палочки к используемому обычно ципрофлоксацину по прошествии 30 дней возрастает в 2300 раз.

    Позже галицин проверили на другой компьютерной модели и выяснили, что он, вероятно, будет нетоксичен для человеческого организма. Однако токсичность ещё предстоит проверить в лабораторных условиях, отмечается в статье.

    Согласно предварительным исследованиям, галицин нарушает возможность бактерий поддерживать электрохимический градиент своих мембран. Помимо прочих функций, этот градиент влияет на синтез молекул АТФ, поэтому при его изменении клетки погибают. По мнению учёных из МТИ, патогену будет сложно справиться с препаратами, обладающими подобным механизмом действия.

    Отмечается, что идея использовать искусственный интеллект не нова, однако до сих пор компьютерные модели были недостаточно эффективны. Теперь же нейросети смогут изучать молекулы и прогнозировать их свойства самостоятельно.

    Комментарии 16

      0
      Если все это правда. То нас ждет прорывные медикаментозные решения — для лечения практически всего. Это здорово. Главное чтобы это технику производства новых соединений — не начали применять для наступательного биологического, химического оружия.
        +1

        Новый антибиотик это совсем не про "лечения практически всего". Это просто новый вариант его изготовления.

          +6
          > При этом структура синтезированного вещества существенно отличается от известных ранее антибиотиков.
          Ну нет, это таки про новый класс антибиотиков. Жаль только что через пол года его уже будут тысячами тон скармливать животным и распылять над полями.
            –1
            А в чем проблема таким методом искать лекарство от рака например?
              –1

              Долго и сложно объяснять.

                0
                Проблема в том, что раков множество разновидностей. Причем против некоторых видов лекарства есть уже довольно давно. Хотя работы над «универсальным решением» ведутся, конечно, и даже есть какой-то прогресс (гуглить mr1, car-t).
                  +1
                  Ни в чем. Конечно же такими методами будут искать лекарство и от рака. Другое дело, что метод этот не волшебство и имеет много ограничений. Пройдут годы прежде чем он действительно станет эффективным. Обратите внимание, что эта штука не спрогнозировала новую моллекулу, а заметила антибиотические свойства в уже известной молекуле из базы данных (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4658288/).
                    0
                    Принцип работы всех нейросетей схожий — чтобы они давали результат, им нужна выборка для обучения, причем чем больше, тем лучше. Выборка должна включать как позитивные, так и негативные образцы.
                    В случае с антибиотиками такая выборка есть — есть множество известных формул веществ и их механизмы воздействия на бактерии. А в случае с раковыми заболеваниями достаточной выборки нет, вернее, она весьма «однобокая», состоит из веществ, которые либо не дифференцируют раковые клетки, либо более-менее дифференцируют, но при этом немеренно токсичны. Поэтому нейросетевой метод поиска решений тут не сработает, надо что-то другое.
                  0
                  В первую очередь, несомненно, военные тоже будут всё это делать. На то они и военные.
                • НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
                    0
                    В химии самое сложное — найти экономически оправданный путь синтеза соединения…
                      –8
                      Китайцы внезапно подцепили «коронный» вирус нового образца, МИТовцы запилили новый вид антибиотика… «Меня терзают смутные сомнения… У Шпака магнитофон, у посла медальон...»
                        +13
                        Самое базовое что стоит усвоить — антибиотики действую на живые клетки ( подразумеваем бактерии), к которым вирусы не относятся. В общем случае, антибиотики не действуют на вирусы.
                          +3
                          Действительно. Каюсь, дурак.
                        0
                        Впечатлает, однако, в оригинале сказано:
                        The drug worked against every species that they tested, with the exception of Pseudomonas aeruginosa, a difficult-to-treat lung pathogen.
                          0
                          Проморгал, спасибо, сейчас дополню :)

                        Только полноправные пользователи могут оставлять комментарии. Войдите, пожалуйста.

                        Самое читаемое