В Folding@Home насчитывается уже 23 проекта по исследованию COVID-19. Подключились геймеры

    image

    На прошлой неделе основатели Стэнфордского проекта Folding@Home предложили добровольцам объединить процессорные мощности в общей системе для исследования COVID-19. Данные, поступающие от проекта, будут оперативно направлять в лаборатории по всему миру.

    В рамках проекта распределенных вычислений уже добавлено 23 новых проекта. Folding@Home позволяет исследователям использовать пожертвованные циклы CPU и GPU для имитации сворачивания белка.


    Изначально было добавлено три новых проекта (11741, 11742 и 11743). Затем исследователи из Мемориального онкологического центра Слоана Кеттеринга, Вашингтонского университета в Сент-Луисе и Университета Темпл добавили еще 20 проектов.


    Вот текущие идентификаторы проекта Folding@Home, которые соответствуют исследованию COVID-19: 11741, 11742, 11743, 11744, 11745, 11746, 11747, 11748, 11749, 11750, 11751, 11752, 11759, 11760, 11761, 11762, 11763, 11764, 14328, 14329, 14530, 14531 и 14532.

    Чтобы начать работу с Folding@Home, нужно загрузить клиент Folding@Home и установить его. Клиент будет автоматически настроен для легкого использования ресурсов процессора ПК для выполнения сворачивания белка при входе в Windows. Графический процессор будет использоваться только в том случае, если поддерживается его аппаратное и программное обеспечение. При желании увеличить нагрузку на процессор и графический процессор можно щелкнуть правой кнопкой мыши значок Folding@Home в своей системе Windows и выбрать уровни «Легкий», «Средний» или «Полный». Однако, чем выше интенсивность, тем медленнее будет работать компьютер, тем больше тепла он будет генерировать и тем больше электроэнергии будет использовать.

    image

    Чтобы проверить, над каким проектом работает ПК, или изменить некоторые настройки программы через веб-интерфейс, можно выбрать опцию «Веб-контроль», как показано на рисунке. Это откроет веб-страницу, показывающую текущую работу.

    Между тем модераторы сабреддита «PC Master race» призвали владельцев мощных игровых видеокарт присоединиться к Folding@Home. Компания Nvidia также обратилась к потребителям с призывом предоставить ученым вычислительные мощности своих видеокарт.
    См. также:

    Комментарии 12

      –4
      Вот вся сила хайпа.
      От гриппа мрёт больше и дольше однако никаких призывов от хомяков с «активной гражданской позицией» не было и не будет.
      Проклятый хайп )
        +4

        Умирает от гриппа больше, потому что им заражаются больше в абсолютных числах. Процент смертности от Covid-19 в разы выше, особенно в старшей возрастной группе.

        0
        Стыдно за человечество. Одно правильство, будь то США, Китая, России, Германии, Японии или даже небольшой но богатой Норвегии, совершенно спокойно могли профинансировать закупку супер компьютеров, (другими словами — достаточно компьютерных мощностей) для того чтобы у университетов и других исследовательских лабораторий не было необходимости прибегать к помощи «активной части населения» планеты Земля.

        Человечество отчаянно нуждается в инноватарах уровня Илона Маска в сфере медицины/биологии.
          +1
          Это не нужно. Структуры этих белков получают обычной CryoEM. В них нет ничего сложного.
          +2
          Там по-моему уже многое сделали обычными методами. Антитела, например. уже есть общие для атипичной пневмонии и нового вируса, чего их сворачивать? Статьи с Cryo-EM уже есть.
            0
            Вы бы ссылку привели, с вырезкой и комментариями, тут много людей далёких от «Cryo-EM», но которых эта тема коснётся.
              0
              Не знаю, что комментировать. Вот тут и по ссылкам в статьях уже готовые результаты того, что пытаются вычислять геймеры…

              science.sciencemag.org/content/early/2020/03/03/science.abb2762

              science.sciencemag.org/content/early/2020/02/19/science.abb2507

              www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.19.956581v1.full.pdf
                0
                ничего не понимаю в этом, тут точно тоже самое делают? apps.foldingathome.org/project?p=14531 ну или foldingathome.org/2020/03/10/covid19-update
                  +1
                  Посыл подпроекта, связанного с коронавирусом, как они сами пишут, найти альтернативные конформации и углубления, как потенциальные цели для лекарств/антител. Но! Совершенно непонятно откуда надежда на эти альтернативные конформации. Тем более, что их можно будет таргетировать.

                  По поводу S-белка. Основные конформации найдены по ссылкам выше. Интерфейс с ACE2 также по ссылкам выше. Также давно известно антитело, как я уже писал.

                  Но! Скорее всего, таргетировать надо будет другой участок белка, не тот, который вычисляют, и не тот, для которого есть антитело. То есть, все это не нужно вдвойне.

                  По поводу протеазы еще не читал.

                  Общее впечатление — прожиг электричества при наличии экспериментальных данных.
                    0
                    Хотя я половины ключевых слов не понял, но общий посыл мне понятен. Это надо обдумать. Спасибо. Как прочитаете остальное дайте нам знать.
                      0
                      Как вариант — дать молодым учёным бесплатный доступ к вычислительным мощностям, некий прямой донат, если хотите. Если что-то найдут дополнительное, тоже хорошо.
              0
              Я работаю над 14308, но не над «11741, 11742, 11743, 11744, 11745, 11746, 11747, 11748, 11749, 11750, 11751, 11752, 11759, 11760, 11761, 11762, 11763, 11764, 14328, 14329, 14530, 14531 и 14532.». Как мне ограничить своё участие только этими проектами?
              Нашёл ответ тут habr.com/ru/company/itsumma/blog/492438

              Только полноправные пользователи могут оставлять комментарии. Войдите, пожалуйста.

              Самое читаемое