Комментарии 5
Нашел хороший пример, в котором наглядно видно, как меняются преобразованные в ручную данные.
В данном примере рисунок 3 показывает не сдвинутые риды, просуммированные в окне в 20bp. На рисунке 1 они сдвинуты влево и вправо на 75, просуммированы в окне 20bp и сумма абсолютных величин отложена по оси “Y”. Для рисунка 2 выполнены теже действия, что и для рисунка 1 только окно не 20bp, а 200bp. И пики получившиеся на рисунке 1 объясняются местом где находились модифицированные нуклеосомы.
В данном примере рисунок 3 показывает не сдвинутые риды, просуммированные в окне в 20bp. На рисунке 1 они сдвинуты влево и вправо на 75, просуммированы в окне 20bp и сумма абсолютных величин отложена по оси “Y”. Для рисунка 2 выполнены теже действия, что и для рисунка 1 только окно не 20bp, а 200bp. И пики получившиеся на рисунке 1 объясняются местом где находились модифицированные нуклеосомы.
Жутко интересно и нифга не понятно… )
В статье нет главного — нету четкого указания какая задача биоинформатики решается?
«Сгруппированные данные будут определять место вероятного расположения белка на ДНК, которое мы пытаемся найти с помощью алгоритмов.»
Упоминание какое-то вскольз, хотя по хорошему это основная цель. Но что делает белок на ДНК? Почему он там оказался, и что же и зачем мы ищем?
Упоминание какое-то вскольз, хотя по хорошему это основная цель. Но что делает белок на ДНК? Почему он там оказался, и что же и зачем мы ищем?
Я извиняюсь, я свалил в Майами отдыхать, и вот случайно проверив почту увидел сообщение. Постараюсь ответить более рационально, чем мое состояние на отдыхе :).
Я пытаюсь выдавать информацию, как сам её узнаю, во время работы. Т.е. то что вы видите, а имеено 5-6 статей это те вещи с которыми я столкнулся. Так же я не заметил, никакой информации именно на русском, т.е. даже русские пишут статьи на английском, это смущает.
Я сначала пытался разделить вопросы математики и биологии. Моя жена проверяет все мои статьи, я пытаюсь их сделать доступными на русском, но я плохо учился и она совсем не в моей специальности, и ей я объясняю тоже. В итоге некоторые статьи дют связь между биологией и математикой и информатикой, а некоторые нет.
В данном вопросе мне показалось логичным продолжение тематики секвенирования, и анализа той секвенированной информации.
Чем больше будет вопросов о том, что не понятно, тем больше у меня тем для разъяснения. Я нашел интересные картинки о регуляции процессов в организме, между клетками. И в итоге английское protein of interest, надеюсь, после написания пары статей должно стать понятным: расположением белка на ДНК.
Согласен, что, то количество информации которое я выдаю, мне так кажется, не может быть выражено в одной статье. Я стараюсь свои мысли сгруппировать, но я в этом кручусь, а вы смотрите со стороны, задвайте вопросы я с радостью отвечу либо в статье либо в комментариях.
Данный вопрос, это то как есть, если четко сократить все данные то: анализ секвенированных данных при помощи ChIP-seqю
Я пытаюсь выдавать информацию, как сам её узнаю, во время работы. Т.е. то что вы видите, а имеено 5-6 статей это те вещи с которыми я столкнулся. Так же я не заметил, никакой информации именно на русском, т.е. даже русские пишут статьи на английском, это смущает.
Я сначала пытался разделить вопросы математики и биологии. Моя жена проверяет все мои статьи, я пытаюсь их сделать доступными на русском, но я плохо учился и она совсем не в моей специальности, и ей я объясняю тоже. В итоге некоторые статьи дют связь между биологией и математикой и информатикой, а некоторые нет.
В данном вопросе мне показалось логичным продолжение тематики секвенирования, и анализа той секвенированной информации.
Чем больше будет вопросов о том, что не понятно, тем больше у меня тем для разъяснения. Я нашел интересные картинки о регуляции процессов в организме, между клетками. И в итоге английское protein of interest, надеюсь, после написания пары статей должно стать понятным: расположением белка на ДНК.
Согласен, что, то количество информации которое я выдаю, мне так кажется, не может быть выражено в одной статье. Я стараюсь свои мысли сгруппировать, но я в этом кручусь, а вы смотрите со стороны, задвайте вопросы я с радостью отвечу либо в статье либо в комментариях.
Данный вопрос, это то как есть, если четко сократить все данные то: анализ секвенированных данных при помощи ChIP-seqю
Зарегистрируйтесь на Хабре, чтобы оставить комментарий
Алгоритмы в биоинформатике ч.1