Как стать автором
Обновить

Комментарии 195

Да, динамика практически везде есть. Прогноза сроков нет.
Прогноза сроков нет.
Не благодарное это дело
Согласен.

Неблагодарное

Очень грубую оценку по населению планеты можно сделать следующим образом.
Условия оценки: время удвоения не меняется, переболеют все (worst case).

Население: 7.7 млрд. (50% = 3,85 млрд.)
Doubling time (Td) грубо в мировых масштабах 9,3 дней, вычисляется из графиков.

По формуле N(t)=N(0) x 2^(t/Td) можно оценить t если взять в качестве N(0) например вчерашнее количество подтвержденных случаев 1 272 901, N(t) = 3,85 млрд. или 50% зараженного населения планеты. Больше нельзя, т.к. реальная форма кривой — сигмоида и там работает уже другая формула.

Получаем 108 дней до 50% заражения или 216 до 100%. Можно взять различные множители для оценки реально зараженных, чтобы оценить дату окончания эпидемии.

M Infected Days-to-50% Date-to-50% Date-to-100%
1 1272901 108 22.07.2020 07.11.2020
2 2545802 98 13.07.2020 19.10.2020
3 3818703 93 07.07.2020 08.10.2020
4 5091604 89 03.07.2020 30.09.2020
5 6364505 86 30.06.2020 24.09.2020
6 7637406 83 28.06.2020 19.09.2020
7 8910307 81 26.06.2020 15.09.2020
8 10183208 80 24.06.2020 12.09.2020
9 11456109 78 23.06.2020 09.09.2020
10 12729010 77 21.06.2020 06.09.2020

Т.е. это оценка сверху по населению всей земли. Еще раз. Должны быть соблюдены условия вверху. Как будет в реальности не понятно.

Как будет в реальности не понятно.

Возможно, что примерно так, как вы написали. Поскольку вакцина в широкие массы пойдет не раньше конца года. Поэтому посылка «переболеют все» верна, за исключением просидевших в самоизоляции до декабря.

Лично я жду не дождусь массового производства тестов на антитела. Во-первых, тогда можно будет реально понять — сколько уже переболело и верны ли неподтвержденные теории о том, что в России коронавирус аж с ноября прошлого года (сам в это не верю и без твердых цифр — не поверю). А во-вторых, людей с иммунитетом можно будет без боязни выпускать работать с населением. Это всю экономику не поднимет, конечно, но хотя бы тех, кому можно дома не сидеть, не будут заставлять это делать…

ЗЫ Я понимаю, что человек с иммунитетом теоретически может служить переносчиком заразы. Но для этого (условно) надо, чтобы в руку имунного высморкался больной и он этой же рукой утер слезы третьему гражданину (без иммунитета). Вероятность есть, но минимальная.
Получаем 108 дней до 50% заражения или 216 до 100%.

Тогда уж 108 + Td дней до 100%, ведь Td — время удвоения
Спасибо, не видел раньше. Там другой принцип заложен, кстати.

Но, кстати, там видно насколько велико расхождение модели с реальностью в Китае и Иране.

Почему то вы не включили Украину. Убитое здравоохранение и огромное количество гастробайтеров как бы намекают что будет вспышка.
Я включил только 20 стран, которые дают в совокупности 90% выявленных заражений на текущий момент. Они дают наиболее информативные графики с точки зрения поиска пика. Ну и ещё Россию включил по просьбе некоторых знакомых соотечественников. Остальные страны при желании можно прогнать самостоятельно, используя приведённый код.
Это ужас, а не прогноз. Гауссовая кривая по времени не является решением никакого дифура.
К сожалению, пик пока ещё не пройден, поэтому трудно делать прогнозы относительно сроков снижения заболеваемости. Но учитывая, что вспышка длится на текущий момент 24 дня, можно ожидать, что в течение недели мы увидим пик и заболеваемость начнёт снижаться. Рискну предположить, что к началу мая ситуация нормализуется (я всегда был оптимистом, надо сказать).

Все не так просто. Сначала вспышка была в Москве и некоторых других транзитных городах с большим числом приезжих и плотностью населения.
Но постепенно болезнь захватывает провинции с низкой плотностью и мобильностью. И там скорость распространения может быть ниже, но продолжительность — больше. Так что, на конец мая я бы не рассчитывал. Хотя бы в июне/июле его пройти.

Скоро узнаем.

Для Китая и Франции полезно почистить данные руками, в обоих есть искажающие выбросы связанные с единичным массовым внесением случаев (китайцы изменили критерии диагностики с ПЦР на КТ, французы пересчитали стариков умерших в домах престарелых).

Надо бы, конечно. Но сглаживание по идее должно это всё убрать.

Аттракцион только начал раскручиваться, эпидемия с нами на многие месяцы.
А аргументировать свое мнение можете?
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Боюсь, что не совсем понимаю, что именно вы имеете в виду. Если вы про конспирологические теории типа «Коронавирус придумали Ротшильды для превращения людей в рабов-зомби», то тут увольте, не верю. Бенефициары коронавируса — ну если только производители медикаментов и мед. оборудования. Еще некоторые, скажем так, публичные люди, которые могут получить очки критикуя тех, кто в данный момент у власти. Антиглобалисты всякие. Больше в голову ничего не приходит. Но все это фигуры, которые явно не тянут на вселенских злодеев, да и возможностей для подобного масштаба операций у них, как мне кажется, нет. Остальные скорее страдают.

Или я вас неправильно понял?
Просто оставьте в покое душевно больных. Это как кричать в пустоту.
Лучше сразу согласиться, что коронавирус придумали жидомассоны в тайных лабораториях ЦРУ, пациент успокоится и ни одна нервная клетка не пострадает.

Ситуация на самом деле очевидная, как 5 копеек. В среднем крупные эпидемии с новой болячкой происходят каждые 15-20 лет. Пандемии 100-150.
Учитывая какую сырую дрянь едят китайцы, а это подразумевает что они охотятся на этих диких животных, не удивительно, что они имеют постоянный контакт с источником болезней. Так же произошло и в этот раз. Мир глобален, особенно Китай с его производственными контактами. Рано или поздно это должно было произойти.

Дальше мои мысли в слух, основываясь на потоке информации, как могло быть гипотетически.
Скорее всего болезнь попала в популяцию людей в середине осени с того самого злосчастного рынка в Ухани. Как сейчас известно, инкубационный период может быть более чем 2 недели, то сначала болезнь не сильно себя проявляла. Затем китайское правительство заметило аномальные смерти от пневмонии и, как нам стало известно позже, начала предпринимать действия чтобы скрыть происшествие. Очевидно, что ведущие разведки мира получили эту информацию, но в силу закрытости Китая не имели прямых доказательств. Поэтому было принято решение попытаться смоделировать ситуацию, чтобы оценить риски и возможные потери. За полтора месяца, до того как Китай больше не смог отрицать и сдерживать болезнь, в Нью Йорке были проведены учения с очень похожим на текущую ситуацию сценарием — в Центре по безопасности здоровья университета Джонса Хопкинса под кодовым названием «Событие 201». Это тот самый университет, который первым сделал сайт мониторинга распространения болезни. По легенде в мире разгорается пандемия из-за нового коронавируса, полученным от свиней, и от которого умирает около 65 миллионов человек. В обсуждение были вовлечены не только представители медицины, но и экономического сектора, корпораций, банковской и политической сферы (как вам?). Оценивался гипотетический ущерб экономике и способы как исправить ситуацию.
Может быть из-за своей чрезмерной уверенности держать ситуацию под контролем мы и имеем то что имеем. Кстати, конечно официально учения ничего общего с пандемией не имеют.
Вот такая небольшая конспирология.
Если США заранее предполагали такое развитие событий и даже провели учения, почему же они оказались так катастрофически не готовы к этой эпидемии?
Хороший вопрос. Почитать бы об этих учениях поподробнее.
Walker2000 Вот ролик на youtube.
Спасибо, посмотрю.
Причин может быть много.
Может быть потому что есть множество сил, которые потерпели бы убытки от предпринятых мер, и они оказывали противодействие. Реальное положение дел стало известно лишь к концу декабря. А на западе это новый год и рождество.
А может из — за западной модели в отличие от Китая и его тоталитаризма. Тяжело вводить меры и придерживаться их.
А может так и надо и «все идет по плану».
А может моя теория неверна и я притянул все за уши.
Насколько я понял, это были не учения в смысле отработки координации действий различных ведомств в случае эпидемии. Это был скорее круглый стол с привлечением представителей бизнеса и правительства, на котором обсуждались последствия вымышленной пандемии. Результаты не пошли в органы власти, похоже.
почему же они оказались так катастрофически не готовы к этой эпидемии?

Они оказались не готовы, если исходить в оценке из общечеловеческих принципов и предполагать, что «они» — едины и имеют одни и те же интересы. Но мотивация может быть иной, могут быть групповые противоречия. Без теорий заговора, ни на что не намекаю — просто рассуждения на тему. Может быть выгодно замести под ковер под шумок накопившиеся проблемы в экономике, пенсионной и медицинской сферах. Передел собственности и тому подобные «милые» вещи, для которых ограниченные людские потери могут быть приемлемыми.

Walker2000
Ну основная идея — сократить количество контактов, чтобы не было резкого всплеска заболеваемости.

Все верно. Но, допустим, пик эпидемии пройден, вакцины еще нет, сам вирус еще бродит по популяции, в малых масштабах. Снимаем все ограничения — рано или поздно он опять взорвется. (Да, фактор приобретенного у части людей иммунитета отрицать не будем, но 1) неизвестна его устойчивость, восприимчивость к мутировавшим версиям вируса 2) те, кто сидели по домам как раз не переболели и не имеют никакого иммунитета.)

Смертность не просто размазывается, она уменьшается таким образом.

Она не «вообще» уменьшается, а только в данный момент времени, см. выше.

Из-за снижения агрессивности вируса на последующих этапах жертв должно быть меньше. По идее смертность упадёт до смертности обычного гриппа.

Для этого вирус (мутировавшие версии) должен широко распространяться по популяции с изоляцией тех, кто болен более смертельной вариацией, чтобы оборвать ее ветвь.
По идее смертность упадёт до смертности обычного гриппа.

Но от гриппа есть прививки. Все опять сводится к растягиванию времени для разработки вакцины.

Jammarra
Какого результата вы ждете от карантина? Того что короновирус исчезнет в популяции?

Пока что, получается, это сводится к выигрыванию времени на разработку вакцины, не более.

Именно лечение для которого бы требовался стационар, а не поддержка на аппаратах тех у кого легкие отказали. И кто все равно помрет.

С чего вы взяли, что люди на ИВЛ все равно умрут?

zavodnoyapl
тебе надо прочитать файл размером 200гб, если ты его целиком в память засунешь, то упадешь по памяти, если ты его будешь читать по 100 метров, то весь прочитаешь без каких либо нагрузок

Вопрос как раз в том, как долго должно быть это ограничение «по 100 метров». Как только вы его снимете — опять упадете по памяти. Значит, ограничение в вашей модели должно быть до тех пор, пока не кончатся коронные больные, т.е. либо пока не создадут вакцину, либо пока все не переболеют. Те, кто сидят дома, переболеть не могут. Так каков срок ограничения «100 метров» — вопрос собеседника в этом.

muhaa
например потому, что он выделяет больше вирусных частиц и за того что при тяжелом течении их в принципе больше и больной кашляет, сопливится еще до того как сляжет с температурой. Или больного везут в больницу, где он заражает врачей и дальше по цепи

Или наоборот, таких больше боятся, более осторожно к ним относятся, изолируют, и обрубают эту ветвь вируса. Все зависит от отношения к больным; учитывая, что на сегодня это уже не неизвестная проблема, с которой везут в обычную больницу, где как раз есть шанс поперезаражать врачей и всех кругом вообще, агрессивная вариация должна останавливаться. Фактор разумности «кормовой базы» вируса (нас) тоже играет роль.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Мне кажется проблема в том, что система управления в США сильно децентрализованная. Это хорошо для развития конкуренции, но плохо для быстрой мобилизации. Плюс Трамп единого вектора не создал, говоря то одно, то диаметрально противоположное. Вот они и не подготовились. Может быть такой разброд и шатание в конечном итоге и окажется наиболее правильной стратегией с точки зрения последствий для экономики.
В среднем крупные эпидемии с новой болячкой происходят каждые 15-20 лет. Пандемии 100-150.
Учитывая какую сырую дрянь едят китайцы, а это подразумевает что они охотятся на этих диких животных, не удивительно, что они имеют постоянный контакт с источником болезней. Так же произошло и в этот раз.

«Испанка» столетней давности, кстати, также имела китайское происхождение.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Понятно, что из-за пандемии кто-то выиграет, кто-то проиграет. Но это не означает, что те, кто больше всего выиграет, тот это всё и устроил.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Не могу согласиться. ВИЧ гораздо менее заразен, чем новый вирус. И новый вирус уже перегрузил систему здравоохранения в нескольких странах. Поэтому это не просто нагнетание, а вполне реальная опасность.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Ну основная идея — сократить количество контактов, чтобы не было резкого всплеска заболеваемости. Это приносит и пользу (снижает пик заболеваемости и смертности) и вред (одновременно гробит экономику). Причем чем больше пользы, тем больше и вреда, как ни обидно. И сколько это продлится, никто не знает. Как-то так…
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Если бы никто ничего не делал, больницы бы уже были переполнены, смертность зашкаливала. Это реальная пандемия.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Смертность не просто размазывается, она уменьшается таким образом. Если не размазывать — больные по коридорам лежат, интенсивной терапии на всех не хватает, врачи начинают умирать. Если размазать — больницы работают в штатном режиме и спасают, кого можно спасти. Почитайте здесь, вроде всё логично и понятно: habr.com/ru/company/vdsina/blog/491800
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Локальные вспышки тоже бывают. И в отдельном городе мест в больницах начинает не хватать. Эта же пандемия может сделать так, что не хватит места сразу во всех больницах в стране. Вот, собственно, и отличие.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
ты же айтишник!
Пример, тебе надо прочитать файл размером 200гб, если ты его целиком в память засунешь, то упадешь по памяти, если ты его будешь читать по 100 метров, то весь прочитаешь без каких либо нагрузок :)
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
>> Как только карантин снимут, все опять вернется к тому с чего начали.

А китайцы с корейцами то и не знают! Надо им рассказать.
Вот почему-то у них не возвращается. Я честно говоря, не понимаю почему.
По тому же, почему не возвращается оспа с 1977. Но оспе такое сделали в масштабе всей планеты, а коронавирусу только в Китае.
Оспа пропала после массовой вакцинизации. Международная программа была принята в 1967. То есть для полного искоренения оспы потребовалось 10 лет. А на настоящий момент вакцины от коронавируса нет. И стойкий иммунитет у переболевших под вопросом.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Как вам такой план:
1. Снижаем число социальных контактов.
2. Снижается нагрузка на стационары.
3. Меньше потерь от нехватки рук, нехватки оборудования, от разнообразных внутрибольничных инфекций и прочих причин связанных с перегрузом.
4. Выигранное время используем для изучения заболевания, поиска наилучшей терапии и препаратов способных сократить продолжительность и остроту заболевания.
5. Параллельно пытаемся устранить бутылочные горлышки системы здравоохранения, увеличить число мест, наладить производство и поставку необходимого.
6. Так же благодаря п.1 цепочка передачи вируса растягивается, увеличивается число новых штаммов, отбор при этом направлен в сторону более легких форм, дополнительное время и тут нам на руку.
7. Теплое время года, даже если не окажет прямого влияния на вирус, то смягчит фон, сократив число осложняющих заболеваний дыхательных путей и уменьшив нагрузку на систему от больных такими заболеваниями.
8. Не исключено, что приведенные меры и факторы сами по себе окажутся достаточными, чтобы сделать вирус неопасным, или позволят начать возвращаться на работу наиболее устойчивым к нему людям. А если все сложится неблагоприятно, у нас будет значительно больше информации по всем фронтам, включая экономику, чтобы принять решение, что опаснее, болезнь или результаты продолжающегося карантина.

Смерть большого числа людей тоже опасна для экономики, напрямую и опосредовано. И пока есть возможность для маневра ей стоит воспользоваться, чтобы попытаться решить проблему с минимальным числом жертв или отложить сложное решение на момент с меньшим числом неизвестных. Это выглядит более разумным, чем альтернатива.

Еще, надо заметить, лечат не от вируса, лечат от повреждений им вызванными, а они могут быть различными и требовать индивидуальной терапии. И отказ легких вопрос растяжимый, например, если нужно ИВЛ — это крайне острая форма протекания, множество больных в нем не испытывает нобходимости, но им может быть при этом показан кислород, а без него риск серьезного повреждения легких. То есть, тут не переживайте, определено есть ради чего не доводить до перегруза.
Лично мне всё нравится в предложенном плане. В принципе, большинство стран по нему и пошли. Я бы ещё добавил отслеживание и изоляция очагов (как делали в Японии и Корее) между пунктами 1 и 2.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Локдауны и изоляции всех мастей искусственно «растягивают удовольствие», разве нет?
Так и есть. На одной чаше весов человеческие жизни, на другой мировая экономика. Чем дольше растягивается удовольствие, тем больше падает мировой ВВП, но тем больше сохраняется жизней благодаря работающей системе здравоохранения.
На одной чаше весов человеческие жизни, на другой мировая экономика.

Не совсем так.
На одной чаше весов человеческие жизни сейчас, на другой человеческие жизни потом. Выбор так себе.
Из-за снижения агрессивности вируса на последующих этапах жертв должно быть меньше. По идее смертность упадёт до смертности обычного гриппа.
Вирус как заболевание вызывает существенно меньше опасений за жизнь и здоровье, нежели «протокол его лечения» :(

В целом, хотелось бы вас поблагодарить за такие простые расчёты… было очень любопытно посмотреть что-то именно подобное. Спасибо.
Не могу не согласиться. Экономику просто сдали в утиль за ненадобностью.
Жертвы потом — это в т.ч. жертвы остановленной экономики. Кризисы всегда приносят жертвы. А плюс ещё жертвы наркологии (и не только в России народ от такой изоляции спивается), люди с пошатнувшейся от такого психикой и т.д.

Я думаю, это имелось ввиду.
И это, к сожалению, неизбежно.

Ворвусь из будущего и скажу что он был прав.

Видно, что сейчас эпидемия в сумме по миру и почти везде прекратила экспоненциальный рост. Жизненно важно сейчас понять причину этого замедления. И это интересная тема для обсуждения.

Мы знаем, что первая волна началась и пока закончилась в восточной Азии.

Допустим, логично, что во вторую волну попали активно посещаемые страны — Италия, Испания, Франция, Великобритания и США. Не очень понятно почему в этот список совсем не попала Германия, хотя попали Англия и Испания. И не очень понятно почему в этот список попал Иран.
Вторая волна уже в основном вышла из экспоненциального роста (пока непонятно что с США и Англией).

Дальше, по идее должна быть третья волна — Германия, скандинавские страны, восточная Европа, Россия, Индия страны Африки и Южной Америки и другие. Эта волна по количеству жертв может быть самой впечатляющей.

Самый важный вопрос для смягчения третьей волны — почему вирус останавливается в странах второй волны а не заражает 70% населения, убивая сотни тысяч и больше.

Я бы предложил 3 версии объяснения наблюдаемого сегодня замедления распространения:

1. Всеобщая вирусо-фобия, карантин и социальная изоляция подавляют распространение вируса и он останавливается заразив небольшой процент населения.
2. На самом деле летальность вируса очень не высока (допустим, 0.1%) и он заваливает больницы только благодаря скорости распространения. После того как он заражает процентов 30 населения (самых общительных), иммунность населения в совокупности с карантином приводит к прекращению распространения вируса.
3. Есть множество штаммов вируса с разной степенью проявления симптомов и летальностью. Как только больных с симптомами начинают быстро находить и изолировать, бессимптомные варианты получают преимущество в эволюционной борьбе и успешно и незаметно заражают большую часть населения. Дальше опять, эпидемия прекращается из за всеобщего иммунитета и частично карантина.

Если верить в пункт 1 — все плохо. Карантин — это очень дорого и как только карантин снимут все может начаться вновь.
Пункт 2 выглядит не очень правдоподобно, хотя такое может быть.

Для меня пункт 3 самый интересный, если бы эта версия оказалась возможной с точки зрения биологии.
Это объясняло бы как Корея и Китай держат эпидемию под контролем: они создали систему, которая быстро изолирует людей с тяжелыми симптомами, но не мешает распространяться бессимптомным вариантам вируса, которые «прививают» население.
Еще можно объяснить почему и Италии все пошло так плохо. Вероятно, там никто в начале эпидемии не искал и не изолировал тяжелых больных. Их только лечили врачи, которые заражались самыми жесткими вариантами вируса и сами разносили эти тяжелые штаммы. Т.е. каким-то образом, они дали эволюционное преимущество самым агрессивным штаммам.

Еще интересно, что если вирус действительно настолько изменчив в части летальности, то успешное выявление и изоляция тяжелых больных в самом начале эпидемии позволяет перевести эпидемию в стране на более легкие формы вируса.
Как ни странно, дальше, эпидемия этой легкой формы будет выглядеть идентично тяжелой: в определенный момент начнется экспоненциальный рост количества умерших от вируса (они же умершие «с вирусом») и зараженных (тестируют в основном тех кто с симптомами). Но дальше если это легкий вирус, то все эти жертвы — только вершина айсберга и эпидемия угаснет унеся несколько тысяч человек. А если тяжелая — это не вершина а начало айсберга, дальше эпидемия будет расти экспоненциально до десятков и сотен тысяч погибших.
Пункт 3 — вполне реален, вирус действительно пассивируется при прохождении через людей.

В свою очередь — версия 4. Легко болеющими намного меньше выделяют вирус, а меньшая инфицирующая доза приводит к более легкому течению.

По мне так верны 2, 3 и 4. Карантин — всего лишь смягчает распространение.
> Карантин — всего лишь смягчает распространение.
Правда, но вполне возможно мы как раз смягчение распространения и наблюдаем. Карантин уменьшает R0.

Хотелось бы верить что правильный вариант 2. Думаю скоро узнаем при достаточно массовом тестировании на антителе. Но думаю скорее всего к сожалению 1.

3 — штаммы достаточно известны, так что не думаю. Но если такое случится будет самый удачный для всех результат.
3 — штаммы достаточно известны, так что не думаю. Но если такое случится будет самый удачный для всех результат.
В статьях, что мне удалось нагуглить обычно рисуют адски сложное дерево мутаций этого вируса с сотнями ветвей, каждая из которых обнаружена чаще у симптомных или безсимптомных больных.
И есть много странностей, вроде внезапной остановки эпидемии в Китае. Как им удается сдерживать эпидемию, если этот вирус теперь вообще везде? Теории насчет выдуманной эпидемии, сокрытия жертв в Китае или ложных жертв в Европе не выглядят убедительно. Если вирус меняется, то очень важно не провоцировать его на изменения в худшую сторону и в через месяц-два все закончится не доходя до 100 000 умерших, что в сущности ничто в масштабах всего мира.
Можете ссылочкой поделиться?
на различие симптомных или безсимптомных больных ссылки нет, но есть ссылка для понимания количества мутаций в вирусе www.gisaid.org/epiflu-applications/next-hcov-19-app
Любопытная картина. Спасибо.
Я ошибся по тяжести симптомов похоже никто пока не смог оценить эти мутации. Та попытка что была (S и L форма) активно критикуется.
Штаммы постоянно мутируют, уже выделилась S-форма. Так что уже случилось.
Ученые очень критикуют это разделение.
Вот здесь подробности.
>>Не очень понятно почему в этот список совсем не попала Германия
Потому что первую вспышку начавшуюся в январе с прямого завоза из Китая там отловили и задушили в зародыше.
По поводу пункта 3. Имеющиеся данные по мутациям вируса, пока говорят о том что фенотип вируса не поменялся. Есть одна мутация, которая затронула сам белок, который цепляется к клетке жертвы, но на свойства вируса эта мутация никак не повлияла.
Мутации у вирусов идут постоянно. Но при этом эпидемиологи с вирусологами говорят, что закрепляются мутации, связанные со снижением агрессии вируса. Ему невыгодно убивать носителей. Собственно, по этой причине человечество пока вирусами не выкошено. То, о чём Вы пишете, просто было отловлено и исследование более подробно.
Ему невыгодно убивать носителей.
Может оказаться, что штамм с более тяжелыми симптомами в то же время является и самым заразным. Например потому, что он выделяет больше вирусных частиц и за того что при тяжелом течении их в принципе больше и больной кашляет, сопливится еще до того как сляжет с температурой. Или больного везут в больницу, где он заражает врачей и дальше по цепи. Тогда тяжелые мутации вируса получают преимущество и вирус наоборот начинает все больше убивать ностителей (после того как они всех заразили и больше не нужны).
Идея в том, чтобы находить и изолировать все пути распространения для самых тяжелых случаев, а легкие напротив не трогать. Так можно теоретически вывести в масштабах человечества безобидную версию вируса, которая всем даст иммунитет.
А по факту, скорее всего так и получается. Бессимптомные мутации гуляют свободно, их никто не выявляет и не лечит.
Я пишу лишь о том, что конкретно у данного вируса на данный момент было выявлено определенное количество мутаций, была установлена географическая привязка, но на агрессию вируса это никак не повлияло. О закреплении мутаций можно говорить на длительном отрезке времени, 3 месяца это ничто. То что вы пишите это может случиться через месяц, год, два, но пока не случилось.
Но вы правы, у вирусов, как и у бактерий выявляется тенденция к большей эволюционной выгоде для менее летальных штаммов.
Видно, что сейчас эпидемия в сумме по миру и почти везде прекратила экспоненциальный рост. Жизненно важно сейчас понять причину этого замедления.
Исчерпаны возможности тестирования. Количество заражённых скорее всего продолжает расти экспоненциально, а вот чтобы поддерживать такой же рост количества протестированных, ресурсов уже не хватает.
Не думаю. Если бы заражение продолжалось по экспоненте, то просто бы отказались от тестирования, диагностировали бы вирус по симптомам. Так делали в Китае на определенном этапе. Рост скорее прекратился по причине всеобщей самоизоляции.
. Рост скорее прекратился по причине всеобщей самоизоляции.

Тогда вам придётся либо предсказать следующую волну, либо как-то объяснить её отстутствие.
Вторая волна хороша видна на графике Ирана. Почему её не случилось в Китае и Корее не совсем понятно. Возможно из-за незаметной естественно приобретенного иммунитета от бессимптомных штаммов вируса. Надо ещё отметить, что в Китае ограничительные меры пока не полностью сняты. У меня знакомый из Пекина говорит, что разрешили выходить на работу только половине сотрудников. Остальные на удалёнке сидят.
В Иране она как раз не сильно выражена.

Тоже обратил внимание, что во многих странах есть 2 пика с разницей примерно 5-7 дней. А в Италии их даже 3.

Либо это связано с уик-эндами на тестирование, либо какая-то хитрая особенность, связанная со своевременностью и жесткостью ввода карантина.
Либо это связано с уик-эндами на тестирование
Скорее, не на тестирование, а на передачу данных (не все пункты передают). Но, думаю, это правда, потому что в Италии и Германии есть хорошо заметные периодичные еженедельные всплески. В России и США таких всплесков нет (или я их не заметил).
Всплески могут быть связаны с особенностями распространения. Заражение распространяется не равномерно от каждого к нескольким другим, а очагами — от одного сразу ко многим. Всплески на графиках могут появляться, когда протестированы сразу много людей из одного или нескольких очагов. А график Франции — одна большая загадка. Такое впечатление, что лаборатории копят данные неделю, а потом куда-то передают одним днём. Ну и выходные дни никто не отменял, конечно. Они могут вносить свой вклад.

С Францией всё проще, они просто отдельно собирали статистику по домам престарелых а потом бахнули одним днём. Но да, я строю (исключительно для личного пользования) очень непрофессиональные графики по пяти странам, и только для Франции пришлось применять бОльшее сглаживание, чтобы график не выглядел удавом, запутавшимся в своих кольцах.

Похоже на то.
Пункты 1, 2, и 3 могут быть и совместны.

Например, вроде как Китай уже пересматривает общую летальность до 1.4%, что на фоне рендомизированного тестирования Исландцев с их 50% бессимптомных, и сильной заразностью вируса — вполне может свидетельствовать о том, что общее количество иммунизировавшихся постепенно достигает критического значения. А естественная эволюция вируса движется в сторону меньшей летальности, на фоне того, что всех с симптомами активно изолируют и возможность беспрепятственно распостраняться по популяции получают только откровенно безобидные штаммы.
Да, похоже на то, что всё это в совокупности работает.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Ага, это сейчас самая распространенная ошибка. На самом деле, смотреть надо на графики количества умерших. Они тоже объективны не на 100% (от вируса или с вирусом, кто-то умер дома без анализов), но все равно графики смертности гораздо точнее отражают ситуацию.

А как именно они отражают ситуацию?

Умерших почти всех будут тестировать. Да, это не даст процента летальности, но позволит оценить общие тенденции, если считать летальность постоянной величиной

А как именно они отражают ситуацию?
Позволяют оценить стадию развития эпидемии в сравнении с другими странами или во времени, если исходить из предположения что летальность примерно постоянна.
Т.е. например, если число заболевших растет линейно а смертность экспоненциально, значит просто закончились тесты. Или если в одной стране заболевших в 10 раз больше чем в другой, но умерших столько же — вероятно просто во второй не тестируют.

Можно еще интереснее. В Белоруссии сейчас 8 умерших. Допустим, летальность вируса при наличии ИВЛ и кучи врачей вокруг — 0.5%. Тогда это соответствует 8/0.005 = 1600 зараженных. Но не сегодня, а дней 10-15 назад, когда они заболели.
Значит сегодня уже раза в 4-8 больше. Т.е. 6-12 тысяч зараженных. Это почти каждый 1000-ый белорус и все не знают что у них коронавирус и продолжают заражать других…
Этот расчет мы несколько недель назад в офисе сделали для Италии и тоже получили каждого 1000-го итальянца, когда они утверждали что у них от силы сотни или тысячи зараженных.

Тут ещё засада со смертями от оторвавшихся тромбов и внебольничной пневмонии неизвестной этиологии. Хотя, сейчас, насколько я знаю, всех с пневмонией у нас жестко тестируют

Согласно нашему ведущему эпидемиологу, внебольничные пневмонии постафактум анализируются на предмет причин их возникновения. В них коронавирус не спрячешь.
Засада в том, что коронавирус провоцирует развитие тромбоза.

Знакомая из горячей зоны пишет, что у них ежедневно умирает 5-6 человек. Но большей части пишут «тромбоэмболия» или какой-другой диагноз. Хотя спровоцировал эти случаи как раз COVID-19. А до дистресс-синдрома или цитокинового шторма не всегда доходит.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь

Я бы даже сказал что куда более информативен не сырой график смертей, а региональная разница между 2020 и среднем значением 2015-2019 за один и тот-же месяц. Если к примеру в городе N эта разница +500 человек или +10% (я условно) то можно эти цифры отдать именно короновирусу. Проблема в том что непонятно где эти достаточно детальные данные брать.

Эти данные важны чтобы понять, насколько реально высока смертность от коронавируса в сравнении с обычными цифрами по смертности. Я же старался понять именно данные по коронавирусу. Дело в том, что власти сейчас смотрят именно на них и стараются уменьшить пик. И чем быстрее это произойдёт, тем с меньшими потерями выйдет экономика из всей этой катавасии. Собственно, данная статья и логика, в ней изложенная, по сути преследует именно такую цель. Понять, насколько быстро можно ожидать спада.
только смерти идут с задержкой, поэтому пик заболеваемости так не увидишь (все поймут, что нужно сидеть дома и никуда не выходить, когда будет уже поздно)
Справедливо. Этот показатель только для анализа задним числом.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
А это в каком районе Германии происходит?
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Наверное, есть различия от района к району. Под Дюссельдорфом довольно серьезно всё, насколько знаю от бизнес-партнёров. Производства многие остановились.

[сплетня] Моя жена работает в госпитале. Моя дочь волонтер в другой больнице. Обе говорят — у нас сейчас 1-2 тяжелых в стационаре, и 3-5 легких. У них есть знакомые которые так-же работают в медицине либо волонтерят, и такова уж ирония как раз в Дюссельдорфе и Эссене. Там ситуация мрачнее — в госпиталях изолировоны целиком этажи. Но не все, а насколько я слышал, из 5 один занят, остальные пока готовятся к приему. Но на словах такие настороения что при текущем темпе через две недели емкость тех госпиталей будет исчерпана, и новые заболевшие из южных и западных регионов будут перемещены к нам в центр. [конец сплетни]

Спасибо за информацию. Думаю, ситуация у них не такая драматичная, как в Италии, но тоже очень серьезная.

В Дрездене всё так же как в посте выше. Множество народу продолжает ходить на работу, а кое-где до сих пор продолжают ездить в командировки.

Скажите, вам что нужнее шашечки или ехать? Немецкая медицина справляется в актуальных условиях. Вводить ЧС и всех поголовно одевать в маски ради видимости борьбы? Немцы довольно разумный и рациональный народ, реагируют взвешенно и адекватно. Я не согласен с тем что по-прежнему полно праздного народа — в магазинах двухметровая разметка, которую насколько я вижу люди соблюдают, в банк вообще впускают поперсонно, очередь находится наулице. Общепит закрыт, спортивные, культурные мероприятия отменены. Люди больше сидят дома, спортом занимаются на улице, автотрафик заметно слабее. О работе — я четвертую неделю с 10-го марта работаю из дома, мой шеф не стал ждать никаких команд, сказал все — кто хочет берите свои компьютеры и мониторы и работайте из дома, все вопросы по телефону. Сейчас все по домам, в офисе только бухгалтер потому что она работает с бумагами, которых тонны. По работе замечаю расслоение в плане рабочих часов: раньше было для всех 8:00-17:00 и час паузы, а сейчас одна половина коллег передвинула рабочий график 5:00 — 14:00 а другая половина на 11:00-20:00, кому как удобно, договорились только о том что в 12:00-13:00 желательно быть готовым к рабочему брифингу, в остальном делай свои 40 часов в неделю как тебе удобно. И зачем вам видеть полицию? Полиция работает, пожарка, спасатели, медики тоже. Я каждый день 2 часа провожу на улице — бег, прогулка, парк, трек, пару раз вижу "тихие" машины полиции, раз-два в неделю вижу/слышу сирены медиков и пожарных. Это те службы которым сейчас вообще не до шуток, какой показной активности можно от них хотеть?

НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь

Это правда — есть и каменный век. Я оказался однажды в такой, проработал там 4 месяца и ушел в другую, вакансию в которой специально эти 4 месяца ждал. Но считаю такой "слив" логичным, зачем героически превозмогать если можно без этого обойтись? Две трети Германии — частный бизнес, море возможностей. Про нагрузку на медиков, и как изменится ситуация — это очень важный, очень актуальный и очень трудный вопрос. Практически все правительства всех стран вспышку пролюбили, есть пара стран где ну не так плохо по сравнению с другими, это те самые исключения которые подтверждают правило. И правило похоже такое — весь мир, все люди, вероятно, переболеют. Наши медики и спасатели — наш самый ценный ресурс, если с ними случится то что было в Италии и сейчас происходит во Франции и Испании, тогда и Германия сорвется. Надеюсь что этого не призойдет и надеюсь что наши меры направлены именно на то чтобы пройти пик мягко.

Он по сути является необязательным.


А карантин не обязательно должен быть обязателен.( с пустыными улицами и бронемашинами) Это все зависит от ситуации и желания, (порой достаточно учебным заведениям прекратить работу) а так пока система здравоохранения справляется то можно обойтись легкой формой.
Насчет Германии не совсем верно. Вчера число активных случаев (число заболевших за вычетом завершенных) впервые снизилось. Так же перед этим наблюдался пятикратный период снижения числа новых случаев. При этом, это уже был спад второй волны.

Это, конечно, не показатель — может быть еще и третья волна. Но всё-таки.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
А как насчет проверки данных по заболевшим и умершим? чтобы выявить «подтасовки» данных.

Пока не понял, как это сделать. Но идея стОящая.

Прокомментируйте пожалуйста что произошло в Канаде 1 Апреля? На графике отрицательное количество выздоровевших.

Это косяк таблицы ВОЗ. Там встречаются выпадающие дни и отрицательные значения.
Предлагаю делать дополнительный анализ аномалий по умершим и заболевшим (не от COVID-19) в странах пропорционально рейтингу коррупции и авторитарности за этот год.
И где-то еще анализировать наличие тестов на вирус в странах.
Лично у меня не вызывают доверия графики Китая, особенно когда стабильно держится число выздоровевшихся.
Полностью поддерживаю. Можете взять мой код и дополнить его и выложить в виде отдельной статьи. На соавторство претендовать не буду )
Не учтено масса параметров. Нельзя так просто взять эти числа и посчитать, надо было ручками внеси правки учитывающие политические, национальные, методов подсчета и тестирования и т.п. ошибки. Вангую, и Испания и Италия на спад пойдут только в середине мая. У нас пик только к концу апреля будет или даже позже
Предлагаю Вам этим и заняться ) Вообще построение реалистичной модели распространения вируса — это задача для междесциплинарной команды специалистов и суперкомпьютера. И даже в этом случае результат не гарантирован. В домашней обстановке за выходные такое не провернёшь )
Единственный минус такого анализа — достоверность данных стран. В России оч сложно сдать тест на вирус. Тестировали не всех и не всегда только тех, кто приехал из других стран. Да и для статистики ставят пневмонию, а не коронавирус. Как и китай, который говорит о 14 зараженных в день на 1.4 миллиарда, но в 7 миллионом гонконге заболевших аж 50 человек.
Официальные данные по коронавирусу неточны и обрывочны. Тут основной вопрос — являются ли данные о количестве заболевших страны репрезентативной выборкой генеральной совокупности страны в целом? Если являются и не будет сильных отклонений в ходе течения заболевания, мой прогноз по стране сработает. В противном случае — нет.
Все верно, опытным путем узнаем. Но мой коммент скорее относился к лживости некоторых режимов. Не знаю как верить Китаю с 14 заражениями в день на 1.4 миллиарда
>> В России оч сложно сдать тест на вирус. Тестировали не всех и не всегда только тех, кто приехал из других стран.

В большинстве стран Европы вас просто пошлют если вам менее 60-65 лет, нет заранее диагностированных диабета/сердечно сосудистых заболеваний/не было химиотерапии или вы не премьер министр Англии. Оттуда и цифры в 10% уерших от заболевших в большинстве европейских стран кроме Германии (там ОК с тестированием). Потому что по факту заболевшие это не заболевшие, а протестированные, а протестированные это только люди из групп риска с симптомами плюс Борис Джонсон и жена Трюдо.

В Голландии единственный способ быть протестированным, если вы младше 65 и без предистории болезней — плюнуть в полицейского.
Да, тоже прочитал сегодня, что с тестами практически по всему миру напряженка. И собственно, поэтому по всем странам одинаково искаженная картина. Нигде не учитываются легкие или совсем бессимптомные случаи заражения. А их должно быть прилично. Возможно, сильно больше подтверждённых тестами.
В Германии официально карантин (хотя это больше похоже на режим самоизоляции) до 20 апреля, что примерно совпадает с вашими графиками. Но я не понимаю какой тогда смысл в карантине вообще, если после 20 апреля все выйдут на работу/на улицу и перезаражаются, потому что очевидно что истребить вирус к тому времени не получится. В итоге будет огромное число заражений через неделю, с которыми больницы уже не будут справляться.
Единственное объяснение, что большая часть населения уже переболела в легкой форме, но это маловероятно.
Я думаю картина прояснится, когда начнут массово делать тесты (100к в день). Тогда примерно будет понятно, какой процент из случайной выборки уже переболел.
Есть мнение, что спад в Корее и Китае — результат естественной иммунизации населения от контактов с бессимптомными носителями. Там вторичной волны нет, хотя по идее должна была быть. Возможно и в Европе её не будет.
Верно. Причем тесты нужны не только тем, кто жалуется на симптомы, а всем подряд. Это будет репрезентативная выборка.
В идеале да. К сожалению, это не получается не у всех стран. В России, например, пока довольно сложно сдать тест, если нет направления из больницы. Да и муть с этими тестами какая-то. Общее количество тестов, согласно Роспотребнадзору, довольно большое. Но, поскольку все говорят, что сдать его практически нереально, верится в эти цифры с трудом.
Если бы собрать данные когда и как каждая страна ввела действия, результат получился бы куда интереснее. В том числе для предсказания эффективности разных подходов.
А вот с этим не могу не согласиться. Надо было собрать, но не успел. Выходные выделил на написание кода и статьи не всё успел включить, что хотелось.
Я у себя строил графики аппроксимации экспонентами численных данных по количеству случаев, до момента карантина в Италии и Китае и после. То же так себе прогноз, но после карантина видно заметное уменшение показателя экспоненты. Я таким образом пытался сравнить скорости роста по разным странам.
Интересно еще посмотреть параметр фактор роста, не заметил у вас. Отношение кол-ва на текущий день к предыдущему. Скажем так скорость изменения посмотреть у разных стран.
"
Да, можно откладывать отношения текущего дня к предыдущему. Тоже была такая идея. У меня попроще всё здесь. Экспонента, кстати, хорошо апроксимирует только начало кривой. Потом она загибается вправо и становится логистической функцией. Это если люди самоизоляцию соблюдают, чего в России, похоже, не происходит. Вот, посмотрите тут пример. towardsdatascience.com/covid-19-infection-in-italy-mathematical-models-and-predictions-7784b4d7dd8d. Мне кажется, аппроксимация логистической функцией наиболее точно будет отражать действительность. Время если будет, попробую по аналогии сделать. Основная интрига — это угадать точку перегиба. По факту пока она не образуется, какие-либо прогнозы количественные делать ни у кого не получается.

Про экспоненту согласен. Если апроксимировать целиком. Но я делал кусочную аппроксимацию, примерно как на рисунке(это Москва). Да, чем дальше тем меньше экспонента повторяет, но для сихронизации параметра сравнения (я для себя взял показатель экспоненты для разных стран) подходит. Можно переходить и к полиномам, но тогда зависимость между начальной экспонентой и полиномом не наглядна. Но мой подход чисто эмпирический и основан только на фактических данных. Даже режим самоизоляции и дисциплина может искажать любые прогнозы, хоть линейные, хоть нелинейные. Но есть ощущение, что после опреленного порога, эта точка перегиба так или иначе появляется.

image
Вот это крутая визуализация, спасибо.
Я ещё такой пользуюсь, это у нас местная в Литве, скорость роста случаев (коефициент).

Картинка

Это важный показатель. В принципе можно и по нему тренд построить, должно работать примерно также, как по дневному количеству вновь заразившихся.

У вас расчеты не опираются на климатическую или сезонную составляющие, и следовательно, не могут быть верны, на мой взгляд.

Расчётов у меня не богато. Я просто достроил линии тренда на кривых подтверждённых случаев заражений и нашёл на них пару точек. Это не модель, которая рассчитывает заражение в зависимости от каких-то переменных. Это просто анализ тренда того заражения, которое уже сложилось по факту. Понятно дело, что оно такое получилось из-за влияния множества составляющих. В том числе и упомянутых Вами.

Дык это понятно, что это не мат модель. А не боитесь что это могут подхватить разные дремучие первоканалы и растиражировать под заголовком "Ученые из России рассчитали конец/спад пандемии COVID19 по всему миру"? Ведь заглавие благоволит.

Не думаю, что первоканалам до моей скромной публикации есть дело ) Существуют и более интересные источники для передовиц. Например, Сбербанк давно уже всё посчитал. Правда никого не посвящает в результаты почему-то )
www.rbc.ru/society/04/03/2020/5e5f9dd89a7947b328a7de22
>> У вас расчеты не опираются на климатическую или сезонную составляющие,
Нет там климатической зависимости. В Милане в марте было +20 и много солнечного ультрафиолета, которых в Англии не каждый год в июле бывает. И люди очень неплохо мрут и там и там. И на Филипинах, и в Индонезии, где днем +30, ночью +28.
Вроде как вирус значительно быстрее разрушается на поверхностях при высокой температуре. Читал пару дней назад, что для него самый оптимум +4 градуса, выше — хуже. Плюс основной способ передачи — именно с поверхностей. Всё это должно означать, что климатическая составляющая всё же присутствует.
Ну тогда у меня три варианта.
1. Тысячи человек на Филиппинах, в Индонезии, Малайзии и прочих экваториальных странах не заразились, это все ошибки ПЦР, сотни умерших в тропиках — фейк. Индия напрасно сидит в локдауне, там нет 5к заболевших и 150 умерших.
2. Все люди в тропиках заразились трогая дверные ручки в кондиционированных супермаркетах, где всегда +17 и холодно без свитера. Я поверю в это для Сингапура. Но не для Филипин, Индии и Индонезии.
3. Вирусу насрать на температуру. Он прекрасно заразит вас и при +5 на входе в московское метро, и при +20-25 (как у большинства людей дома, а в Италии и Испании — на улице в марте) и при +30 как в описанных тропических странах.
Вирусу насрать на температуру.

Откуда такие смелые утверждения? Тем более когда мы не имеем ни малейшего представления о реальном числе заразившихся(потенциальных разносчиках вируса) и не имеем понятия как именно заразились люди попавшие в статистику. Добавьте еще сюда китайские цифры, которые никак не сходятся с тем что наблюдается в Европе и США. Короче говоря ваши выводы голословны.

Ну холодные страны — болеют. Флорида, калифорния, Иран — тоже.
Делаем выводы что диапазон удобных для вируса температур вполне широк.

То что удобно для вируса, так это носители которые ходят на работу, ездят в метро, ходят в магазины и желательно кучкуются в закрытых помещениях как сельди в бочках. В вышеописанной ситуации, будь вирус даже неустойчив к ультрафиолету(от слова вообще), распространения эпидемии было бы не избежать.


Климатические факторы важны только при введении карантина и ограничения свободного передвижения потенциальных разносчиков вируса.

Есть и четвертый вариант: во многих жарких странах хуже с санитарией, поэтому малое время жизни вируса компенсируется отсутствием других барьеров. Т.е. условно говоря в северной стране вирус живет на поверхности трое суток, за это время контактным образом себе на руки перенесли заразу трое, двое из них помыли руки, ничего не касаясь, один — занес заразу в организм. В жаркой стране — вирус живет на поверхности 10 часов, за это время этой точки коснулись 10 человек, из которых 7 ели что-то грязными руками или просто почесали, условно, нос.

Вирусу насрать на температуру. Он прекрасно заразит вас и при +5 на входе в московское метро, и при +20-25

Так не в «заразит-не заразит» вопрос. А в том, как долго он будет вне тела жить на поверхности.
Так не в «заразит-не заразит» вопрос. А в том, как долго он будет вне тела жить на поверхности.

Спасибо что пояснили, а то ведь народ и вправду не в состоянии сделать 2*2. Статистика в эту сторону например во Франции просто сшибает с ног, только 1 француз из 5 моет руки после туалета(речь даже не идет про выход на улицу). Та же картина в Германии или Италии.

Не совсем понятен комментарий. Причем мытьё рук после туалета и коронавирус? Как это следует из статистики заражений?

Это пояснение, что срок жизни вируса на поверхностях разных материалов важен на территории популяций, напрямую взаимодействующих с этими поверхностями и не соблюдающих элементарных правил личной гигиены.


У нас есть два индивидуума, А и Б, А грызет ногти, неважно где он находится и никогда не моет рук, Б регулярно моет руки. Какой из двух подвержен заражению? А вот теперь представьте что у вас популяция где 9 и 10 это А и вирус очень живуч, как это повлияет на скорость распространения эпидемии?

Делать выводы о том, что наиболее заразившиеся страны не соблюдают правила гигиены вряд ли обосновано. Соблюдение привычных мер гигиены раньше работало, теперь появился новый вирус, и эти меры стали недостаточными. Вот и всё.
Делать выводы о том, что наиболее заразившиеся страны не соблюдают правила гигиены вряд ли обосновано.

Если вы заметили, то я никаких выводов не делаю просто от себя, есть факты и статистика. А корреляция это или просто совпадение я судить не берусь, ибо рановато пока делать выводы.


Утверждать обратно противоположное я бы тоже не стал, вирус может быть и новый, но вот пути распространения у него стары как мир. Посмотрите статистику и динамику распространения кишечного гриппа(Gastroenteritis, передается бытовым путем как covid19) в Европе и США. Вот вам статейка про пред-эпидемическую ситуацию (289 обращений на 100000 жителей) с Gastroenteritis и Flu на начало 2020 года во Франции.


За то что в странах Европы и США существует благоприятная почва для распространения различных вирусов бытовым путем, говорят цифры по эпидемиям предыдущих лет.

Нет там климатической зависимости.

Довольно таки смелое утверждение. Давайте возьмём, к примеру, труд под названием "Under the Weather: Climate, Ecosystems, and Infectious Disease." В главе 4 под названием "Climate Influences on Specific Diseases", в подразделе про грипп, ясно говорится след:


It is reasonable to assume that the disease transmission cycle is influenced by climate, but the actual driving mechanisms are not well understood and have been the subject of few quantitative studies.

Т.е мы ни черта не понимаем как климат влияет на грипп(в целом имеет схож мех распространения с covid19), который по планете гуляет более двухсот лет, но мы осознаем зависимость распространения с клим. условиями и временем года.


И люди очень неплохо мрут и там и там.

А причем здесь собственно коэффициент фатальности и темпы распространения вируса?

Заранее прошу прощения, я недостаточно слежу за тенденциями вируса в мире чтобы делать какую-либо оценку статьи. Но вцелом, при прочтении возникло несколько вопросов:


  1. Сколько стран по примеру южной кореи прошло пик и вышло на стабильный процент заражений? Сколько таких "полных" кривых было проанализировано?
  2. На основе чего была выдвинута эта гипотеза:
    confirmed_top.loc[country, 'end_date'] = (datetime.strptime(confirmed_top.loc[country, 'peak_date']+'20', "%d.%m.%Y").date() + timedelta(confirmed_top.loc[country, 'days_to_peak'])).strftime('%d.%m.%Y')
    Если кратко: завершение эпидемии = дата пика эпидемии + время от начала до пика + 20 дней. Откуда 20 дней? Влияет ли на время завершения количество зараженных?
  3. Дата пика для стран которые его не прошли совпадает с последней проанализированной датой. Вероятнее всего это проблема какой-нибудь проверки в скрипте. И понимающий человек это просто проигнорирует. Но хорошо бы хоть как-нибудь об этом упомянуть, потомучто просто предсказываю что найдется автор который сошлется на эти прогнозы как на "авторитетный источник" во всей этой истерии.

Спасибо за статью.

Спасибо, что так подробно вникли в детали.

1. Пока есть только две страны, которые вышли на устойчивый минимум ежедневных заражений — Китай и Южная Корея. И там и там продолжительность от старта заражений до пика составляла примерно две недели. Столько же понадобилось, чтобы перейти от пика к минимуму.
2. 20 — это не количество дней, посмотрите повнимательнее. '20' — это просто пара символов, которые прибавляются к году, чтобы получилась полная дата в виде строки, которую можно преобразовать в формат datetime. Моя вина, что я в спешке использовал длинные выражения, они плохо читаются, каюсь.
3. Так и есть. Пока пик не пройден, максимум на графике — крайняя правая дата. Это есть в тексте «Осталось находить начало всплеска заболевания (красная стрелка) и пик заболеваемости (зеленая). С пиком всё просто — это максимум на сглаженных данных. При этом, если максимум приходится на крайнюю справа точку графика, значит, пик ещё не пройден. Если максимум остался левее — скорее всего пик остался в прошлом.»

Я не очень доверяю фундаментальному анализу. Предпочитаю по старинке методом аналогов. Испанка почти три года бушевала. И здесь делов на пару лет, мне кажется. Одну волну Вы может и описали, но во всех пандемиях до этого было несколько волн. Если только с вакциной что-то получится.

Моя статья больше соответствует духу технического анализа ) Испанка давно была, много чего изменилось в медицине и средствах массовой информации. Поэтому я бы бОльший коэффициент предложил. Продолжительность эпидемии должна быть короче не в 1,5, а в 3 раза, например. А то и ещё покороче.
Я последовательно запускаю три скрипта. Таблицы могу видеть, но графики последние у меня не строятся. Как это сделать — не очень понимаю. Вижу, что там функция, но без применения. В Питоне только стартую.

Помогите, пожалуйста, разобраться.
Нужно поставить ipywidgets и включить его. Вот тут написано как: ipywidgets.readthedocs.io/en/stable/user_install.html.

Либо в последнем скрипте поменяйте

interact
def plot_by_country(country = countries):

На

for country in countries:

И он понастроит 21 график подряд.
Видел несколько дашбордов по COVID-19, но не нашёл пока главного — прогноза времени спада эпидемии

Вот, например, даже недельной давности:
celado-ai.ru/blog/Covid-Disease-Peak-Forecast-in-Moscow
Любопытные расчёты, не видели их раньше. Насколько понимаю, они в качестве входных данных берут тоже статистику от ВОЗ. Но здесь прогнозируется количество заразившихся в Москве, мне же хотелось получить более глобальную картину. И понять не количество заразившихся, а время, когда это количество пойдёт на спад. К сожалению, пока не пройдём пик заболеваемости на определенной территории, мои расчёты не смогут предсказать спад.

Но их выводы вполне обнадёживают: «Пик новых заболевших в день будет примерно 9 апреля, пик находящихся в стадии болезни — 17 апреля. Новые случаи прекратятся лишь к концу апреля. Всё это в условиях строго карантина».
И понять не количество заразившихся, а время, когда это количество пойдёт на спад.

Так там есть и время, когда пойдёт на спад. Это когда наклон на последнем графике перестаёт увеличиваться и начинает снижаться.

К сожалению, пока не пройдём пик заболеваемости на определенной территории, мои расчёты не смогут предсказать спад

Первый график по ссылке как раз о том как предсказывать не имея данных о дате пика
Да, понятно. Сбили с толку обрывающиеся в момент пика графики. Любопытный анализ. Скоро узнаем, сбылись их предсказания или нет.
Если бы эти циферки еще что-нибудь значили.

Они сильно зависят от выборки. От того, сколько тестов, каких и кому делается.
Если не делать тесты вообще, то и заболевших нет.
Сделали больше тестов в штуках, получили больше случаев. Сколько всего, или какой процент от популяции не известно с точностью хотя бы по порядку величины.
Да, цифры не идеальны, но пока это единственное, на что можно опереться.
Кривая несимметрична. Есть граждане сидящие по домам, есть курьеры, контактирующие каждый день с десятками людей, есть те, кто сейчас вышел на посевную. Одну часть общества самоизоляцией защитим, в другой вирус «пересидит», и потом перекинется на тех, кто выйдет с самоизоляции. Реальная модель слишком сложна.

Если упрощать, для прогноза правильно использовать хотя бы уравнения классической, (не учитывающей массовую, но временную, самоизоляцию!), SIR-модели:
image
Благодарю за наводку, посмотрю. Пока на скорую руку сделал модель по данным, которые были под руками.

Я думаю, вам неплохо бы почитать литературу по моделям эпидемий. Даже на популярных сайтах печатают более детальные и глубокие прогнозы. Вот, например: https://42.tut.by/679251 Это белорусский сайт, и прогноз для Беларуси. Сам прогноз сделал какой-то профессор из США (наверное, с белорусскими корнями), который как раз работал раньше в Центре по контролю и профилактике заболеваний США. Так или иначе, даже в этой статье можно найти много интересного.


Вот, например, какие там картинки:
image

Я и не заявлял, что мои расчёты претендуют на какую-либо глубину. У меня стояла конкретная задача на основании имеющихся данные разобраться в текущей ситуации, что и было сделано. Я опубликовал это решение, чтобы и другие люди, которые немного пишут на Python, смогли повторить этот путь и сделать свои собственные выводы, возможно, пойти дальше. К сожалению, в отличие от профессионалов в области распространения эпидемий (увы, я не «какой-то профессор из США»), у меня нет ни соответствующей подготовки, ни времени, чтобы порадовать Вас более глубоким анализом.
Большое спасибо за модель, все очень наглядно и кстати
Благодарю за отзыв )
Я для себя считаю «прогресс» карантина по простой формуле (умершие + выздоровевшие) / всего заболевшие. Ведь из болезни можно выйти только двумя этими путями. И когда количество вышедших из болезни равно количеству заболевших, фактически progressbar=100%
А если наложить динамику этого прогресса по дням, тогда получаются интересные графики. По такой логике очень наглядно видно как плавно и целенаправленно к 100% шел Китай, как резко в позитив стартовала Корея, как не удается Ирану выйти с уровня 30-40% уже много недель и как далеко до пика США и Португалии.
Можете помочь с визуализацией этих графиков? Пытался запитонить, но красиво не получилось. А хочется поделиться находкой.

image

Пики под 100% в начале объяснимы малой выборкой — 2 выявленных случая, оба выздоровевшие, но впереди еще только начинается массовое тестирование, выявление новых больных и откат к дну прогресса пандемии в стране. Это же было в Китае в конце января, это повторилось и у нас в марте
Интересный подход, спасибо, что поделились. Но на текущем этапе мне более информативной показалась производная.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Согласен.
НЛО прилетело и опубликовало эту надпись здесь
Была бы интересна статисика о том какие болезни в комбинацией с короновирусом дают летальный исход. Очевидно, что если есть проблемы связанными с легкими, то тут высока вероятность, что будут проблемы вплоть до летального исхода. Но хотелось бы этот список расширить или узнать по статистике. Аллергия, ВИЧ + короновирус, есть ли статистика?
Не встречал, но думаю, что такая статистика скоро появится в медицинских статьях.
Спасибо за работу. Сам пытаюсь найти прогноз по-лучше. Я пользуюсь работой Института показателей и оценки здоровья США (это часть Университета Вашингтона). Он работает на грантах Фонда Билла и Мелинды Гейтс. covid19.healthdata.org/united-states-of-america
Можно выбрать страну (России пока нет). Цель данного исследования оценить потребность в койках на пике волны эпидемии. (Интересно было посмотреть на Швецию и Финляндию, например).
Добрый день! Спасибо за оценку. Меня больше интересовали сроки спада, чем общее количество заразившихся. А с заразившимися вообще труба. Насколько я понял, рабочей методики прогнозирования их количества просто нет. Думаю, в России только Яндекс совместно с сотовыми операторами может как-то более-менее оценить.
Очень приятно, спасибо )

Кажется, пора обновлять статью с учётом того, что колокола уже два…

Зарегистрируйтесь на Хабре, чтобы оставить комментарий

Публикации

Истории