Комментарии 5
А каким образом получают подобные изображения от… живых пациентов?
Биопсия почки? разрезали, взяли материал, зашили.
В основном это пункционная биопсия. Под УЗИ навигацией просто укольчик специальным гаджетом, который получает столбик тканей. Дальше патологоанатомы получают срезы и фиксируют на стекло с последующей окраской материала. Гематоксилин и эозин не самый распространенный краситель для почки, как раз из-за большого количества жира в тканях. Поэтому несколькими красят, помимо классики Г+Э.
Не описаны проблемы с которыми столкнулись. Например отсутствие сканера для стёкол)
А какие "методы нормализации окраски"? Вклад лаборанта можно частично нивелировать используя разделение красителей методом color deconvolution (если не рассматривать флуоресцентную микроскопию), получится 2-3 серых картинки.
Например отсутствие сканера для стёкол)
Автор применял датасет с Cancer Imaging Archive
получится 2-3 серых картинки.
Не понимаю как разделение на каналы может помочь. Вы предлагаете разделить на каналы допустим гемотоксилина и эозина и потом отдельно их анализировать? Или сделать из них 2n тензор вместо RGB? Ну так это проблему не снимет.
Классификация гистологических изображений со светлоклеточным раком почки, используя Keras