Как стать автором
Обновить

ScienceHub #03: Синтетическая микробиология

Блог компании ПостНаука
Продолжая ездить по лабораториям и смотреть, как идут в будущее отечественные ученые, мы заглянули к микробиологу, генетику, Константину Северинову, и он поведал нам о том, какие сейчас наиболее активные течения в биологии, какие вскоре понадобятся ученые в этой области и какого рода задачи они будут решать.
Читать дальше →
Всего голосов 26: ↑25 и ↓1 +24
Просмотры 5.2K
Комментарии 5

Технологии больших данных в работе с бактериями микробиоты. Лекция в Яндексе

Блог компании Яндекс Исследования и прогнозы в IT
Мы часто говорим о задачах, которые лежат на стыке той или иной классической науки и анализа данных. В сегодняшнем докладе эта идеология представлена воочию — большую часть доклада читает учёный, а о конкретных методах и инструментах рассказывает программист.


Под катом — расшифровка и основная часть слайдов.

Всего голосов 42: ↑42 и ↓0 +42
Просмотры 6.7K
Комментарии 2

Cello — язык программирования живой клетки

Блог компании iCover.ru Научно-популярное Биотехнологии Нанотехнологии Здоровье
Приветствуем вас на страницах блога iCover! Технология программного кода «Cello», разработанная совместной группой ученых Массачусетского технологического института (MIT), Бостонского университета и Национального института стандартов и технологий позволяет прописывать в ДНК клеток бактерий требуемый набор свойств и создавать биологические схемы с нужными логическими параметрами, работающие прямо внутри живой клетки.

image
Подробнее
Всего голосов 25: ↑21 и ↓4 +17
Просмотры 28K
Комментарии 53

Волосы, перья и чешуя имеют общего предка

Блог компании Dronk.Ru Научно-популярное Биотехнологии
Группа ученых из Швейцарии сумела доказать, что волосы, чешуя и перья гомологичны и произошли от общего предка — рептилии. Теоретические предпосылки и результаты экспериментов были подробно освещены на страницах журнала Science Advances и кратко — в пресс-релизе, представленном от имени Университета Женевы. Сегодня мы расскажем о том, что послужило доказательством столь смелого утверждения и какой вывод для дальнейших исследований позволяет сделать проделанная работа.

image
Подробнее
Всего голосов 30: ↑20 и ↓10 +10
Просмотры 13K
Комментарии 18

Что такое антибиотики

Биотехнологии


Весна — время простудных заболеваний, поэтому многие из нас держат в аптечке упаковку антибиотиков «на всякий случай». Согласно опросу ВЦИОМ за 2011 год 48% женщин и 43% мужчин, а это почти половина россиян, считают, что вирусы, так же, как и бактерии, неустойчивы к антибиотикам.

Давайте же разберемся, что за зверь такой этот антибиотик, и для кого он опасен.
Читать дальше →
Всего голосов 51: ↑49 и ↓2 +47
Просмотры 43K
Комментарии 107

Полимеразная цепная реакция и Владивосток

Биотехнологии


В общем, мы тут лазили по Филиппинам и искали хитрые бактерии. Потом поехали в Исландию с химиками, и они рассказали про экспедиции биологов в горы за термофильным бактериями (которые живут около горячих источников) — и оказалось, что вся эта история была нужна для полимеразной цепной реакции. Мне стало дико интересно, какое отношение лаборатория с анализами крови имеет к геотермальному источнику, и сейчас я расскажу вам эту волнующую историю.

Значит, у нас вчера во Владивостоке Роспотребнадзор и Дальневосточный федеральный университет открыли учебный центр по ПЦР. Я сгонял туда вместе с журналистами и нашёл нормальных безумных учёных, которые всё на пальцах объяснили. Потому что именно это они там и будут делать — учить вьетнамцев и китайцев. В основном — учить бороться с биоугрозой.
Читать дальше →
Всего голосов 69: ↑67 и ↓2 +65
Просмотры 17K
Комментарии 59

Первый бактериальный геном, спроектированный при помощи компьютера

Научно-популярное Биотехнологии Здоровье Будущее здесь
Перевод


Caulobacter crescentus – безопасная бактерия, живущая в пресной воде по всему миру

Все известные геномы организмов хранятся в базе данных, принадлежащей Национальному Центру Биотехнологической Информации в США. Сейчас в базе данных есть запись: Caulobacter ethensis-2.0. Это первый в мире полностью компьютерный геном живого организма, разработанный учёными из ETH Zurich. Нужно подчеркнуть, что, хотя геном Caulobacter ethensis-2.0 был физически получен в форме очень большой молекулы ДНК, соответствующий организм ещё не существует.
Caulobacter ethensis-2.0 основан на геноме хорошо изученной и безопасной пресноводной бактерии Caulobacter crescentus, которая встречается в природе в родниковой воде, реках и озёрах по всему земному шару. Не вызывает никаких заболеваний. Caulobacter crescentus также является модельным организмом, обычно используемым в исследовательских лабораториях в целях изучения жизни бактерий. Геном этой бактерии содержит 4000 генов. Учёные ранее показали, что лишь примерно 680 из этих генов имеют решающее значение в выживании бактерии в лаборатории.
Читать дальше →
Всего голосов 31: ↑28 и ↓3 +25
Просмотры 8.3K
Комментарии 22

Микробиота. История изучения и методы исследования

Блог компании «Атлас» Научно-популярное Биотехнологии Здоровье
Мы получили много комментариев к последней статье и решили с Атласом дополнить серию материалом о том, какие еще есть методы изучения микробиоты. В конце статьи добавили, что нужно помнить об исследованиях бактерий кишечника на сегодняшний день, чтобы они не навредили вашему здоровью.


Автор иллюстраций Rentonorama
Читать дальше →
Всего голосов 15: ↑15 и ↓0 +15
Просмотры 7.3K
Комментарии 10

Игра в бога: искусственные организмы

Блог компании ABBYY Читальный зал Научно-популярное Биотехнологии Будущее здесь
Что-то вроде тизера. Ксеноморфы существуют. Учёные создают ксеноморфов. Учёные создают ксеноморфов из соображений безопасности. Я сам в шоке. Под катом подробнее об этом (а это, кстати, совершенно официально называется ксенобиология) и о много другом, чем занимаются современные биологи. Не всё ж вам про COVID-19 читать!

Это первая часть текста, написанного по мотивам эпизода подкаста про искусственные организмы.


Читать дальше →
Всего голосов 36: ↑35 и ↓1 +34
Просмотры 13K
Комментарии 51

Старый DVD-привод превращается… в лазерный микроскоп

Блог компании ITSumma Разработка под Arduino *Производство и разработка электроники *Периферия DIY или Сделай сам


В наше время DVD-приводы постепенно выходят из употребления, мало кто уже покупает диски или записывает их сам, а старые диски постепенно деградируют, ведь химическое покрытие на болванках не вечное.

Но для ненужного привода есть полезное применение. Например, из него можно смастерить лазерный микроскоп на Arduino (примечание: по факту требуется две лазерные головки, то есть два ненужных привода).

Это оптический микроскоп, который использует для сканирования образца сфокусированный лазерный луч.
Всего голосов 133: ↑129 и ↓4 +125
Просмотры 52K
Комментарии 19

Вирусный мегаполис: кто живет в нашем ЖКТ

Блог компании ua-hosting.company Читальный зал Научно-популярное Биотехнологии Здоровье


Наша планета во многих аспектах уникальна, особенно если говорить про ее обитателей. На Земле обитает настолько великое многообразие видов, что даже ученые не могут прийти к общему умозаключению в оценке их числа. Кто-то считает, что видов около 5 миллионов, а кто-то смело заявляет про миллиард. Кого же на Земле больше всех? Людей, конечно, много, но даже муравьи, несмотря на свои скромные габариты, обходят нас в этом соревновании — порядка 1 квадриллиона муравьев (около 12 000 видов). Однако есть существо, которое превосходит даже муравьев. И это вирус. Группа ученых из института Сенгера (Великобритания) провели глобальное исследование, в ходе которого определили 140000 видов вирусов, обитающих в пищеварительной системе человека. О каких именно вирусах идет речь, что нового показало данное исследование, и как оно может повлиять на будущее вирусологии? Ответы на эти вопросы мы найдем в докладе ученых. Поехали.
Читать дальше →
Всего голосов 23: ↑22 и ↓1 +21
Просмотры 6.1K
Комментарии 3

Я живу, а они — умирают: бактерии в моем теле

Научно-популярное Здоровье
Из песочницы

Одна из самых значимых книг по проблеме долголетия людей «Этюды оптимизма» была написана великим русским  естествоиспытателем, лауреатом Нобелевской премии И. И. Мечниковым. В своей работе он впервые предположил, что причиной страданий человека могут быть микробы кишечника, которые при неправильном их соотношении образуют яды, отравляя организм. Книга была написана еще в начале прошлого века. За 120+ лет наука ушла далеко вперед, теперь мы знаем, какие микробы ответственны за гнилостные процессы и можем контролировать их количество. Но мы всё ещё в начале большого пути по исследованию того микромира, который существует в нас и определяет не только наше физическое, но и психическое, и духовное здоровье.

Когда я говорю «мы», я имею в виду учёных в целом и учёных-биологов из Новосибирского Академгородка в частности, одним из которых я и являюсь. Мы рассматриваем микробиоту, то есть совокупность всех микроорганизмов, населяющих человека, как целостный метаболически активный орган. Этот орган подвижен в своем составе и зависим от множества факторов — состояния здоровья человека, его диеты, качества продуктов, климата, образа жизни и даже социального окружения. Лично я живу с идеей «причинения пользы» людям через эту научную область — я вижу, как культура заботы о микробиоме улучшает качество жизни здоровых людей и облегчает состояние больных. Научно-прикладной фундамент этой темы мы с коллегами прорабатываем с 1992 года, работая над живыми пробиотиками серии «Биовестин». Здесь я хочу рассказать подробнее о том, как и зачем восстанавливать и поддерживать этот орган под названием микробиом — и, возможно, посеять в вас живой интерес к моей теме.

Читать дальше
Всего голосов 27: ↑22 и ↓5 +17
Просмотры 16K
Комментарии 107

Ахиллесова пята коронавируса

Блог компании Маклауд Научно-популярное Биотехнологии Здоровье
Перевод
Вирус SARS-​CoV-2 критически зависит от особого механизма, обеспечивающего синтез его белков. Коллаборация под руководством исследовательской группы из Высшей Технической Школы Цюриха (ETH Zurich) докопалась до молекулярного устройства этого процесса и показала, что его можно ингибировать специальными химическими соединениями, тем самым существенно подавляя репликацию вируса в инфицированных клетках. 


Видео: Said Sannuga, Cellscape.co.uk / ETH Zurich, The Ban Lab 

Вирусы используют ресурсы инфицированной клетки для репликации и дальнейшего заражения других клеток, и при помощи того же механизма болезнь перекидывается на других особей. Важнейший этап в жизненном цикле вируса – синтез новых вирусных белков, выстраиваемых на основе инструкций из вирусного РНК-генома. Клеточная фабрика белков, рибосома, начинает клепать вирусные белки по этим «чертежам». 

Когда клетка здорова, рибосома движется вдоль РНК в строго размеренном темпе, считывая три нуклеотида РНК за шаг. Такой трехбуквенный код определяет соответствующую аминокислоту, которая прикрепляется к наращиваемому белку. Почти не случается такого, чтобы рибосома сдвинула один или два нуклеотида РНК вперед или назад, отступив от этого правильного трехчастного паттерна. Если такой сдвиг в рибосоме (его называют «сдвиг рамки считывания») все-таки происходит, то он приводит к ошибкам в считывании генетического кода.
Всего голосов 46: ↑43 и ↓3 +40
Просмотры 11K
Комментарии 8

Биологический антагонизм. Микробы против микробов

Научно-популярное Биотехнологии Биология

«Выживает сильнейший», «жизнь – это борьба», «выживать – значит, бороться» - это первое или одно из первых правил природы, которое мы слышим со школьной скамьи. И действительно, наблюдая за окружающим нас миром лично или через голубые экраны мы день за днем отмечаем бесконечное противостояние: животных между собой за еду или партнера, растений за место под солнцем, животных и растений за право съесть или быть съеденным, живых организмов с болезнями, непогодой, неживой природой и человеком. Но, глубже погружаясь в изучение мира, мы понимаем, что борьба – далеко не единственный и не ведущий механизм в природе, хотя и входящий в пятерку важнейших.

Однако есть случаи, когда противостояние выходит на первый план. У животных поздних таксономических групп на исход столкновения сильное влияние оказывают возраст и пол животного, его «бэкграунд» (прошлое, детский возраст, опыт, перенесенные лишения и болезни), в конце концов, климатические условия и подручные средства. Скажете, какие могут быть подручные средства у тигра? Ландшафт и наличие деревьев тоже считается. Но у микробов нет подручных средств. Их противостояние носит почти что чистый характер – организм против организма, колония клонов против колонии клонов. Сюжет, достойный блокбастера космических масштабов. Об этом и пойдет речь сегодня.

Читать далее
Всего голосов 8: ↑8 и ↓0 +8
Просмотры 5.1K
Комментарии 27

Пища будущего: одноклеточный белок против сои

Блог компании ua-hosting.company Научно-популярное Биотехнологии Экология Будущее здесь


Население планеты Земля неустанно растет. На данный момент насчитывается порядка 8 миллиардов людей. У каждого из них есть свои индивидуальные потребности и желания, но есть и такие, что применимы ко всем, независимо от страны, религии, пола или возраста. Это первичные потребности человека, т.е. физиологические: воздух, вода, пища, сон и секс. Очевидно, что без воздуха долго не протянешь, в отличие от последнего пункта. Однако вопрос обеспечения пищей постоянно растущую популяцию нашего вида становится все острее и острее. Как говорится, у нас есть все, вот только всего на всех не хватает. Пока одни ученые думает о колонизации и последующем терраформировании других планет, другие сосредоточены на новых сельскохозяйственных культурах, новых методах выращивания пищи, ее обработки и хранения. Группа ученых из Гёттингенского университета (Германия) считают, что будущее не за новым сортом кукурузы или картофеля, а за микроорганизмами. Используя солнечные панели им удалось вырастить микробный белок. Данный метод, по их словам, намного эффективнее, стабильнее и экологичнее, чем выращивание классических культур. Какие именно микроорганизмы использовались в разработке, насколько сложен процесс, и сколько продукта, полученного таким методом, нужно, чтобы накормить человека? Ответы на эти вопросы мы найдем в докладе ученых. Поехали.
Читать дальше →
Всего голосов 17: ↑17 и ↓0 +17
Просмотры 7.1K
Комментарии 19

Анаэробы. Не ругательство, но честь

Научно-популярное Биология

Все чаще в научной литературе всплывают статьи о микроорганизмах и их применении в медицине, промышленности и сельском хозяйстве. Но все реже в абзацах с характеристикой и классификацией микробных культур встречаются слова «аэробный» и «анаэробный». Почему так происходит? Все дело в неоднозначности т.н. традиционных наименований.

Анаэробы (от греч. αν — отрицательная частица, греч. αέρ — «воздух» и греч. βιοζ — «жизнь») – общее собирательное наименование организмов, способных жить в условиях частичного или полного отсутствия кислорода. Многие из них получают энергию окислением не кислорода, а другого субстрата (химического, биологического вещества или минерала). Так, существуют серобактерии, азотобактерии и железобактерии, использующие для дыхания окисление соединений серы, азота и железа соответственно.

Читать далее
Всего голосов 12: ↑11 и ↓1 +10
Просмотры 5.2K
Комментарии 26

Приключения титина: микробный синтез мышечных волокон

Блог компании ua-hosting.company Научно-популярное Здоровье Химия Биология


Многие годы человек использует искусственные полимеры для создания различных устройств, предметов быта, одежды, строительных материалов и т.д. Без них сложно представить современный мир таким, каким он есть сейчас. И как бы ни хотелось, чтобы все вокруг было природным, достичь такой экологической утопии невозможно. Ведь если делать что-то из природного материала, значит его нужно где-то добыть. Другими словами, где-то прибыло, а где-то убыло. Посему ученые со всех уголков планеты тратят уйму времени на создание искусственных материалов, которые по своим свойствам и характеристикам будут практически идентичны своим натуральным эквивалентам. К примеру, исследователи из университета Вашингтона в Сент-Луисе (США) разработали методику синтеза мышечных волокон, в котором участвуют бактерии. Как работает методика, насколько натуральными кажутся полученные волокна, каковы их свойства, и где их можно применить? Ответы на эти вопросы мы найдем в докладе ученых. Поехали.
Читать дальше →
Всего голосов 11: ↑11 и ↓0 +11
Просмотры 2.2K
Комментарии 0

Знакомство с невидимками

Читальный зал Научно-популярное Биология

После работ Везалия и Гарвея анатомия и физиология сформировались как самостоятельные науки. Принципиальное строение и функции человеческого тела стали понятны учёным. Однако для окончательного понимания учёным надо было выяснить, из каких мельчайших самостоятельных единиц состоят тела животных и растений. Долгое время для этого не существовало необходимых инструментов и методик.
Всё изменилось после изобретения микроскопа. Учёным открылся удивительный мир микроструктур организма и невидимый мир микроскопических живых существ.
Но микроскоп появился не с помощью волшебной палочки. Созданию этого прибора предшествовала длительная и кропотливая работа.
Итак, начнём наш рассказ.

Читать далее
Всего голосов 67: ↑64 и ↓3 +61
Просмотры 12K
Комментарии 11

Вопросы российскому микробиологу: о коронавирусе, лабораторных животных, госфинансировании и не только

Научно-популярное Здоровье Биология

Младший научный сотрудник московской лаборатории экспериментальной микробиологии ФГБНУ НИИВС им И.И. Мечникова Ольга Афанасьева согласилась ответить на некоторые вопросы редакции «Хабра», касающиеся её работы и пандемии коронавируса. «Хабр» спросил, с чем именно работает Ольга, откуда идёт финансирование проектов, об её взаимодействии с лабораторными животными, требованиях к ней как к научному сотруднику и не только. Часть вопросов взята из комментариев читателей «Хабра» к новостям или статьям схожей тематики. Кроме того, Ольга согласилась ответить на новые вопросы читателей из комментариев к статье.

Читать далее
Всего голосов 20: ↑18 и ↓2 +16
Просмотры 5.9K
Комментарии 8

За 2 тысячи лет микробиота кишечника человека стала на 39 % беднее

Научно-популярное Здоровье

Международная команда исследователей из 28 учёных изучила палеофекалии с хорошо сохранившейся ДНК возрастом от тысячи до 2 тысяч лет. Исследователи реконструировали древние микробные геномы и сравнили их с микробными геномами живущих людей. Выяснилось, что за 2 тыс. лет человек потерял 39 % микробиоты кишечника. 

Читать далее
Всего голосов 14: ↑13 и ↓1 +12
Просмотры 6.4K
Комментарии 15
1