Как стать автором
Обновить

Решение проблемы обнаружения центральной линии сосуда

Блог компании Inobitec Алгоритмы *Обработка изображений *Математика *Софт
Recovery mode

Суть задачи


В процессе медицинской диагностики может возникнуть необходимость исследовать сосуды пациента. Такое исследование называется ангиографией. С появлением томографов в дополнение к классической ангиографии появились методы МРТ и КТ ангиографии, которые в отличие от традиционной ангиографии, дающей только плоскую картинку в одной проекции, позволяют получить полное трехмерное представление сосудов. Для проведения таких исследований пациенту в кровь вводится контраст — специальное вещество, делающее сосуды на снимках более яркими. В зависимости от предполагаемого диагноза, врач или оценивает общую картину, или пытается найти конкретные участки сосудов, в которых возникли проблемы. Если участок сосуда сужен и пропускает меньше крови, чем должен, то это место называется стенозом.


Одна из задач врача — найти стенозы и оценить, насколько они опасны. Задача же разработчика, как обычно, облегчить работу конечного пользователя. Для этого необходимо построить полную 3D модель стенок сосуда и провести их первичный анализ. Это является большой и интересной задачей, однако, в её основе лежит более простая и известная проблема — построение центральной линии сосуда.
Читать дальше →
Всего голосов 43: ↑42 и ↓1 +41
Просмотры 8.9K
Комментарии 15

Сегментация томографических данных

Блог компании Inobitec Программирование *Работа с 3D-графикой *Визуализация данных *


Зачем это нужно


Для чего выполняется томографическое исследование? В большинстве случаев ради медицинской диагностики, иногда — в научных целях. Цель медицинской диагностики — выявить патологию, либо получить о ней дополнительную информацию, либо же убедиться, что её нет. Каким образом это достигается? В большинстве случаев путем последовательного ручного анализа срезов, сгенерированных томографом. Зачастую этого вполне достаточно. Но в некоторых случаях получить достаточно информации только на основе анализа плоских срезов невозможно или картина получается неполной: например, при поиске патологий сосудов или анализе некоторых переломов. Также, иногда необходима информация о взаимном расположении различных органов: особенно это актуально при планировании предстоящих операций. Получить такую информацию только на основе плоских срезов, в большинстве случаев, затруднительно. Тогда приходит на помощь трехмерная реконструкция томографических данных.
Читать дальше →
Всего голосов 10: ↑10 и ↓0 +10
Просмотры 6.5K
Комментарии 11

Продвинутый подход к обнаружению границ на примере стенок сосуда

Блог компании Inobitec Алгоритмы *Обработка изображений *Софт

Интересная информация


На рисунке ниже изображена трехмерная реконструкция сердца, полученная в результате работы современного томографа:


Для масштаба указана толщина луковицы аорты — 3.2 см, подумать только! Однако, когда у людей возникают проблемы с сердцем из-за сосудов, то речь, как правило, идет вовсе не о таких больших. На изображении видно, что сердце окружено более мелкими сосудами, и некоторые из них ответвляются прямо из крупных артерий. Это так называемые коронарные артерии, которые питают кровью непосредственно сердце. Если в них происходит сужение просвета (стеноз), например, из-за образования кальция, то уменьшается поток крови. Когда стеноз ярко выражен, то случается некроз ткани, другими словами инфаркт. Далее я расскажу о нашем подходе к вычислению границ сосудов, который в результате позволяет автоматически находить сужения и давать им оценку.
Читать дальше →
Всего голосов 30: ↑30 и ↓0 +30
Просмотры 6.7K
Комментарии 37

Автоматическая сегментация дыхательных органов

Блог компании Inobitec Работа с 3D-графикой *Алгоритмы *Обработка изображений *Визуализация данных *

Ручная сегментация легких занимает около 10 минут и требуется определенная сноровка, чтобы получить такой же качественный результат, как при автоматической сегментации. Автоматическая сегментация занимает около 15 секунд.


Я предполагал, что без нейронной сети удастся получить точность не выше 70%. Также я предполагал, что морфологические операции – это только подготовка изображения к более сложным алгоритмам. Но в результате обработки тех, хоть и немногочисленных 40 образцов томографических данных, что есть на руках, алгоритм выделил легкие без ошибок, причём после теста на первых пяти случаях алгоритм уже не претерпевал значительных изменений и с первого применения правильно отработал на остальных 35 исследованиях без изменения настроек.


Также нейронные сети имеют минус – для их обучения нужны сотни обучающих образцов лёгких, которые придётся размечать вручную.


Читать дальше →
Всего голосов 28: ↑24 и ↓4 +20
Просмотры 6.3K
Комментарии 8

Automatic respiratory organ segmentation

Блог компании Inobitec Работа с 3D-графикой *Алгоритмы *Обработка изображений *Визуализация данных *

Manual lung segmentation takes about 10 minutes and it requires a certain skill to get the same high-quality result as with automatic segmentation. Automatic segmentation takes about 15 seconds.


I assumed that without a neural network it would be possible to get an accuracy of no more than 70%. I also assumed, that morphological operations are only the preparation of an image for more complex algorithms. But as a result of processing of those, although few, 40 samples of tomographic data on hand, the algorithm segmented the lungs without errors. Moreover, after testing in the first five cases, the algorithm didn’t change significantly and correctly worked on the other 35 studies without changing the settings.


Also, neural networks have a disadvantage — for their training we need hundreds of training samples of lungs, which need to be marked up manually.


Read more →
Всего голосов 11: ↑10 и ↓1 +9
Просмотры 1.6K
Комментарии 1

WebRTC через Kurento: опыт тестирования и внедрения

Блог компании Inobitec JavaScript *Google Web Toolkit *Разработка систем связи *Управление разработкой *

В этой статье я поделюсь опытом работы с технологией WebRTC и медиасервером Kurento на этапе тестирования и внедрения. Расскажу с какими проблемами я столкнулся и как их решил. Я не расскажу о том как разработать приложение с нуля, но приведу много полезных ссылок. Уверен, что мой рассказ будет полезен тем, кто собирается работать с WebRTC.
Читать дальше →
Всего голосов 15: ↑13 и ↓2 +11
Просмотры 9.8K
Комментарии 17

Альтернативный метод транспедикулярной фиксации или как штангенциркуль может заменить целый рентгеноаппарат

Блог компании Inobitec Визуализация данных *Здоровье


В настоящее время операции на позвоночнике перестали быть чем-то эксклюзивным и выполняются практически во всех отделениях нейрохирургии и во многих травматологических отделениях стационаров. Термин “нестабильность позвоночника” давно вышел за пределы лексикона узкого круга спинальных хирургов. И хотя данное понятие иногда трактуется слишком широко, нестабильность позвоночного сегмента, как патологическое явление, существует. В этой статье пойдет речь об одном интересном методе, позволяющем упростить операцию на позвоночнике.
Читать дальше →
Всего голосов 19: ↑17 и ↓2 +15
Просмотры 6.8K
Комментарии 14

Device Manager. Обновление и мониторинг

Блог компании Inobitec C++ *IT-инфраструктура *Qt *Софт

Как уже говорилось ранее, DeviceManager — программная прослойка, которая используется для постановки заданий устройствам и получения результатов их выполнения. Сегодня речь пойдёт об организации процесса обновления программы и осуществления мониторинга рабочих мест, так как без этого проблематично развивать продукт и осуществлять его поддержку.

Читать дальше →
Всего голосов 3: ↑3 и ↓0 +3
Просмотры 2.3K
Комментарии 2