Как стать автором
Обновить

Биокомпьютер на основе ДНК смог вычислить квадратный корень из множества чисел вплоть до 900

Время на прочтение2 мин
Количество просмотров13K
imageФото: Markus Tisse/Flickr

Чунлей Го из Университета Рочестера в штате Нью-Йорк совместно с коллегами разработали компьютер, который использует 32 цепи ДНК для хранения и обработки информации. Он способен вычислить квадратный корень из 1, 4, 9, 16, 25 и т. д. вплоть до 900.

До последнего времени биокомпьютерам не удавалось провести сложные математические операции. Десятибитная программируемая логическая схема на основе 32 цепей ДНК смогла справиться с этой задачей.
Читать дальше →
Всего голосов 27: ↑27 и ↓0+27
Комментарии5

Учёные из РФ и США «увидели» случайные петли в хромосомах

Время на прочтение3 мин
Количество просмотров6.6K

Международная группа учёных из «Сколтеха», Массачусетского технологического университета и других ведущих научных организаций России и США представил физическую модель свёрнутого в петли полимера. Точное аналитическое решение этой модели позволило учёным воспроизвести универсальные особенности упаковки хромосом из экспериментальных данных. Теоретическая работа позволит исследователям понять, как петлевая экструзия влияет на биофизические свойства хромосомы, и определить параметры этих петель. Статья с результатами исследований уже опубликована в журнале Physical Review X.

Читать далее
Всего голосов 14: ↑14 и ↓0+14
Комментарии2

Biomemory выпустила за $1000 карту для хранения данных на основе ДНК, в контейнере которой хранится один килобайт данных

Время на прочтение2 мин
Количество просмотров2.8K

Стартап Biomemory выпустил в продажу по цене $1000 за комплект из двух одинаковых карт для хранения данных на основе ДНК, в контейнере каждой из которых хранится всего один килобайт данных. Производитель обозначил «минимальную» продолжительность жизни этой информации в 150 лет при условии правильного хранения и расшифровки с помощью секвенатора ДНК.

Читать далее
Всего голосов 4: ↑4 и ↓0+4
Комментарии5

Сайт генетических тестов признал утечку данных 6,9 млн пользователей

Время на прочтение2 мин
Количество просмотров2.1K

Платформа генетических тестов 23andMe подтвердила, что в результате её взлома произошла утечка данных. Хакеры получили информацию о 6,9 млн пользователей.

Читать далее
Всего голосов 8: ↑8 и ↓0+8
Комментарии2

Учёные выяснили, что клетки опухоли мозга передают генетическую информацию с помощью вирус-подобных частиц

Время на прочтение4 мин
Количество просмотров1.3K

Учёные из МФТИ с коллегами выяснили, что клетки глиомы — опухоли мозга — могут обмениваться генетической информацией с помощью вирус-подобных частиц. Они формируются при участии белка вирусного происхождения, который образует капсидные контейнеры для мРНК. Результат исследования поможет разобраться в биологии развития глиом — наиболее распространённой и опасной формы рака головного мозга. Работа опубликована в журнале Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — General Subjects. Работа выполнена при поддержке Российского научного фонда.

Читать далее
Всего голосов 2: ↑2 и ↓0+2
Комментарии0

Google AI научился предсказывать опасность генетических мутаций

Время на прочтение2 мин
Количество просмотров1.9K

Исследователи Google DeepMind, подразделения искусственного интеллекта компании-гиганта, представили инструмент, позволяющий предсказывать, могут ли определённые генетические мутации стать пагубными; это может помочь в исследованиях редких заболеваний.

Полученные результаты — это «ещё один шаг к признанию того влияния, которое ИИ оказывает на естественные науки», — заявил Пушмит Кохли, вице-президент по исследованиям Google DeepMind.

Инструмент фокусируется на так называемых «миссенс-мутациях», когда в генетическом коде нарушается одна буква. В геноме типичного человека в среднем насчитывается 9000 таких мутаций; они могут быть безвредными или вызывать такие заболевания, как муковисцидоз или рак, а также нарушать развитие мозга.

Читать далее
Всего голосов 6: ↑5 и ↓1+4
Комментарии0

Биологи извлекли ДНК растений из трёхтысячелетнего кирпича

Время на прочтение2 мин
Количество просмотров3K

Команда исследователей успешно извлекла ДНК из древнего глиняного кирпича, и обнаружила в нём следы разнообразных растений, произраставших в то время в этой местности. Исследование опубликовано в журнале Nature Scientific Reports.

Согласно выгравированной надписи, кирпич был привезён из древнего города Калху на территории современного северного Ирака, где он являлся частью дворца Ашшурнасирпала II, царя Ассирии в IX веке до н.э. Поскольку археологи достаточно точно знают время начала строительства дворца, они могут датировать этот кирпич конкретным десятилетием — между 879 и 869 гг. до н.э.

Читать далее
Всего голосов 12: ↑11 и ↓1+10
Комментарии9

Новосибирские учёные открыли новый вид дефектов ДНК и способ их исправления

Время на прочтение2 мин
Количество просмотров3K
Учёные Института химической биологии и фундаментальной медицины (ИХБФМ) СО РАН открыли новый вид повреждения ДНК, препятствующий чтению и копированию генетической информации, и выявили механизм их «ремонта». В перспективе эта работа даст новые возможности для создания лекарств, повышающих чувствительность раковых клеток к лечению. Результаты исследования, поддержанного грантом РНФ, опубликованы в международном журнале Nucleic Acids Research.

Одно из мутагенных и токсичных для клетки повреждений ДНК, при котором одно из азотистых оснований, (аденин, гуанин, тимин или цитозин), из которых построена ДНК, теряется, известно уже около полувека. Такие повреждения называются апурин-апиримидиновыми сайтами, или АП-сайтами. Однако учёные выявили, что эти повреждённые элементы в структуре ДНК могут легко реагировать с другими молекулами в живой клетке. Например, АП-сайты охотно образуют сшивки с разными белками, так называемые ДНК-белковые сшивки, которые отличаются большими размерами, из-за чего мешают и копированию, и чтению генов.

Уточняется, что дефекты в системе репарации ДНК-белковых сшивок вызывают тяжёлые наследственные заболевания, например, синдром Рюйс-Алфс, при котором ускоряется старение организма. Более того, сшивки белков с АП-сайтами происходят не только спонтанно, но и под действием некоторых противоопухолевых средств.
Читать дальше →
Всего голосов 10: ↑9 и ↓1+8
Комментарии3

Метод RESI позволяет рассматривать объекты в световой микроскоп с ангстремным разрешением

Время на прочтение6 мин
Количество просмотров2.2K

Рассмотреть объекты с ангстремным разрешением? Различить две комплементарные цепочки ДНК в двойной спирали? Заниматься структурной биологией в живой клетке? И все это с помощью светового микроскопа? Сегодня это стало реально! Говорим о cutting-edge методе флуоресцентной микроскопии сверхразрешения RESI, недавно разработанном биофизиками из Института биохимии Макса Планка.

Читать далее
Всего голосов 11: ↑11 и ↓0+11
Комментарии2

ИИ предсказывает эффекты CRISPR на геном

Время на прочтение1 мин
Количество просмотров2.1K

Ученые создали модель глубокого обучения TIGER (Targeted Inhibition of Gene Expression via guide RNA design), предсказывающую, работу CRISPR, нацеленных на РНК. Инструменты используются для изменения генов путем воздействия на РНК, а не на ДНК. Исследователи объединили модель с CRISPR-скринингом (обнаружение мутантных частей ДНК/РНК и их изменение) для контроля активности генов. Целью было усилить воздействие на РНК-мишень и свести к минимуму непредвиденные эффекты.

Читать далее
Всего голосов 2: ↑1 и ↓10
Комментарии5

Биологи отредактировали гены тараканов при помощи CRISPR

Время на прочтение2 мин
Количество просмотров1.4K

Японские учёные отредактировали гены тараканов при помощи усовершенствованной технологии генной модификации CRISPR. Новый метод позволяет вводить материал для редактирования генов во взрослых самок, в которых развиваются яйца, а не в эмбрионы.

Читать далее
Всего голосов 5: ↑5 и ↓0+5
Комментарии1

Открыт новый фундаментальный механизм хранения информации в ДНК

Время на прочтение5 мин
Количество просмотров84K
image
Максим Никитин в лаборатории

Исследователь из России открыл механизм «молекулярной коммутации» ДНК, который меняет наше представление об одной из главных парадигм биологии. Более 70 лет считалось, что ДНК хранит и обрабатывает информацию за счёт структуры двойной спирали – однозначно соотвествующих друг другу (комплементарных) молекулярных цепей. Руководитель направления «Нанобиомедицина» Университета «Сириус», заведующий лабораторией МФТИ Максим Никитин экспериментально доказал, что для эффективной обработки генетической информации ДНК совершенно не обязательно образовывать двойную спираль. ДНК может хранить и передавать информацию за счёт слабоаффинных взаимодействий, реализующихся в том случае, когда молекулы имеют низкое сродство друг к другу. Более того, он показал, что короткая ДНК, даже максимально некомплементарная гену, может регулировать его работу.

Результаты исследования опубликованы в одном из самых авторитетных научных журналов Nature Chemistry. Открытый фундаментальный феномен может быть ключом к познанию природы самых разнообразных процессов: от неразгаданных тайн генетики, сложных заболеваний, мгновенной памяти и старения до вопросов возникновения жизни на Земле и её эволюции. Кроме этого, он позволит качественно улучшить специфичность генной терапии и безопасность ДНК/РНК вакцин за счёт выявления и снижения побочных реакций на препараты во время лечения.
Читать дальше →
Всего голосов 23: ↑21 и ↓2+19
Комментарии19

Учёные создали «мягкий» вариант метода CRISPR для редактирования генов

Время на прочтение2 мин
Количество просмотров951

Учёные из Калифорнийского университета в Сан-Диего разработали новый вариант редактирования генов на основе технологии CRISPR. Они утверждают, что их метод обеспечивает более «мягкий» и безопасных подход к изменению генов с меньшим количеством нежелательных побочных мутаций.

Читать далее
Всего голосов 5: ↑5 и ↓0+5
Комментарии0

Учёные создали из ДНК наноробота, пригодного для наблюдения за клеточными процессами

Время на прочтение2 мин
Количество просмотров2K

Кликабельно

Созданием наноробота на основе ДНК, который позволит наблюдать за невидимыми невооружённым глазом процессами, занимаются французские учёные. Наноробот позволит изучать механические усилия, прилагаемые на микроскопическом уровне, что чрезвычайно важно для понимания различных биологических и патологических процессов. Процесс создания робота, которого учёные назвали «нано-лебёдкой», описаны в работе, опубликованной в журнале Nature Communications.

Механические воздействия играют важнейшую роль во многих клеточных процессах. К примеру, тактильное ощущение работает благодаря воздействию на особые клеточные рецепторы (за это открытие в нынешнем году дали Нобелевскую премию). Кроме прикосновений, эти механорецепторы отвечают за регулирование ключевых биологических процессов: создания кровеносных сосудов, дыхания, распознавания звуковых волн в ухе, и т.п.
Читать дальше →
Всего голосов 8: ↑7 и ↓1+6
Комментарии3

Лаборатория ИИ «Сбербанка» и Центр ИИ ВШЭ представили ИИ-инструмент для поиска фрагментов ДНК

Время на прочтение2 мин
Количество просмотров854

Лаборатория искусственного интеллекта (ИИ) «Сбера» и Центр ИИ ВШЭ совместно представили ИИ‑инструмент для поиска фрагментов ДНК. Исследователи изучили роль Z‑флипонов (функциональные геномные элементы, закодированные вторичными структурами ДНК) в геномных процессах и проанализировали связь этого элемента с геномными мутациями, ассоциированными с заболеваниями.

Читать далее
Всего голосов 8: ↑8 и ↓0+8
Комментарии0

ИИ научили точно определять возраст древних останков по ДНК

Время на прочтение1 мин
Количество просмотров936

Международная исследовательская группа под руководством Лундского университета в Швеции разработала ИИ, который может точно определять возраст человеческих останков.

Читать далее
Всего голосов 3: ↑3 и ↓0+3
Комментарии1

Хроническая нехватка сна разрушает иммунные стволовые клетки

Время на прочтение2 мин
Количество просмотров4.8K

Исследователи из Школы медицины Икана Медицинского центра Маунт-Синай выяснили, что хроническое недосыпание может негативно повлиять на иммунные клетки, что впоследствии может вызвать воспалительные и сердечно-сосудистые заболевания. Риск увеличивается, если человек недосыпает 1,5 ч. в сутки. 

Читать далее
Всего голосов 18: ↑17 и ↓1+16
Комментарии3

Учёные составили «генетический портрет» семьи алтайских неандертальцев

Время на прочтение2 мин
Количество просмотров1.1K

Международная группа учёных во главе со специалистами немецкого Института эволюционной антропологии (EVA) расшифровала геномы 13 неандертальцев из двух пещер на Алтае и составила «генетический портрет» неандертальской семьи из отца, дочери-подростка, ее двоюродного брата и бабушки. 

Читать далее
Всего голосов 7: ↑7 и ↓0+7
Комментарии0

Петербургские учёные придумали, как повысить точность программ для расшифровки ДНК и РНК

Время на прочтение3 мин
Количество просмотров839
image

Учёные нашли способ повысить точность программ для расшифровки ДНК, РНК и других биополимеров. Для этого они придумали и опробовали метод, с помощью которого можно сделать эффективнее компьютерные алгоритмы для секвенирования (дешифровки) пептидов. В основе алгоритма — новый способ валидации, который оценивает надёжность результатов расшифровки биополимеров с неизвестной ранее структурой. Разработка поможет учёным в проведении исследований и фармацевтическим компаниям в создании современных лекарственных средств.

Над научным проектом работали исследователи подведомственного Минобрнауки России Санкт-Петербургского государственного электротехнического университета «ЛЭТИ», Алферовского университета и Санкт-Петербургского государственного университета. Исследование проведено в рамках госзадания Минобрнауки РФ. Результаты опубликованы в одном из международных научных журналов.
Читать дальше →
Всего голосов 2: ↑2 и ↓0+2
Комментарии1

Учёные из УрФА НИЦ УрО РАН и ИБГ РАН нашли эффективную систему редактирования участков ДНК коров

Время на прочтение2 мин
Количество просмотров879

Совместная группа учёных Уральского федерального аграрного (УрФА) НИЦ УрО РАН из Екатеринбурга и Института биологии гена (ИБГ) РАН из Москвы провели исследования способов модификации участков ДНК коров. Группа нашла эффективную систему редактирования, они это сделали при помощи аденоассоциированного вируса. Результаты исследований опубликованы в журнале «Theriogenology». 

Читать далее
Всего голосов 10: ↑6 и ↓4+2
Комментарии6
1
23 ...