Вирус SARS-​CoV-2 критически зависит от особого механизма, обеспечивающего синтез его белков. Коллаборация под руководством исследовательской группы из Высшей Технической Школы Цюриха (ETH Zurich) докопалась до молекулярного устройства этого процесса и показала, что его можно ингибировать специальными химическими соединениями, тем самым существенно подавляя репликацию вируса в инфицированных клетках. 


Видео: Said Sannuga, Cellscape.co.uk / ETH Zurich, The Ban Lab 

Вирусы используют ресурсы инфицированной клетки для репликации и дальнейшего заражения других клеток, и при помощи того же механизма болезнь перекидывается на других особей. Важнейший этап в жизненном цикле вируса – синтез новых вирусных белков, выстраиваемых на основе инструкций из вирусного РНК-генома. Клеточная фабрика белков, рибосома, начинает клепать вирусные белки по этим «чертежам». 

Когда клетка здорова, рибосома движется вдоль РНК в строго размеренном темпе, считывая три нуклеотида РНК за шаг. Такой трехбуквенный код определяет соответствующую аминокислоту, которая прикрепляется к наращиваемому белку. Почти не случается такого, чтобы рибосома сдвинула один или два нуклеотида РНК вперед или назад, отступив от этого правильного трехчастного паттерна. Если такой сдвиг в рибосоме (его называют «сдвиг рамки считывания») все-таки происходит, то он приводит к ошибкам в считывании генетического кода.

^{Фото: Intricate Explorer, Unsplash}

Сегодня я вспомнил один из любимых «программистских мифов», который вполне может быть городской легендой, и свою собственную версию «чёрного ящика», который требовал отладки.

Городская легенда повествует о радиоактивных железнодорожных вагонах из Украины, вызывавших баги в компьютерной системе, прочитать её можно здесь.

Разбираемся с «чёрными ящиками» и c тем, какими они бывают сегодня

«Чёрный ящик» — это популярная концепция программирования, предполагающая, что мы находимся снаружи системы или компонента, не имея прямого доступа к коду. Это может быть вызвано различными факторами:

• Вы работаете со сторонним ПО, разработчики которого просто не раскрывают код.
• Вы взаимодействуете с API, внутренняя логика которого абстрагирована.
• У вас нет необходимых полномочий для доступа к Git-репозиторию.
• Даже система с полным доступом может де-факто стать «чёрным ящиком» из-за своей сложности.
• Сотрудник, обладавший всеми ключами и знаниями, внезапно уволился/пропал/умер.
• Легаси-система состоит из .dll, которая «всегда работала» на сервере, и не была подключена к системе контроля версий. Чтобы просто посмотреть на код, её нужно декомпилировать, если это возможно, конечно.