Как стать автором
Обновить
59
0
Андрей Кочетков @andreykochetkov

Эксперт

Отправить сообщение

Что такое Т клеточный иммунитет?

Время на прочтение3 мин
Количество просмотров15K

Кроме гуморального иммунитета в защите от заражения играет роль и Т клеточный иммунитет. Ключевым игроком этого пути защиты являются цитотоксические Т-лимфоциты (CD8+, Т киллеры), которые убивают уже зараженные вирусом клетки, распознавая на их поверхности «вражеские антигены». Т-хелперы (СD4+) также важны и стимулируют работу других иммунных клеток, высвобождая цитокины. Эпитопами для Т клеточного иммунитета могут выступать участки спайк-белка и других белков, включая N, M, nsp3, nsp4, ORF3a и ORF8. Однако роль Т клеточного иммунитета в защите от covid-2019 мало изучена.

https://immunology.sciencemag.org/content/5/48/eabd2071

https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2770758

Кроме гуморального иммунитета в защите от заражения играет роль и Т клеточный иммунитет. Ключевым игроком этого пути защиты являются цитотоксические Т-лимфоциты (CD8+, Т киллеры), которые убивают уже зараженные вирусом клетки, распознавая на их поверхности «вражеские антигены». Т-хелперы (СD4+) также важны и стимулируют работу других иммунных клеток, высвобождая цитокины. Эпитопами для Т клеточного иммунитета могут выступать участки спайк-белка и других белков, включая N, M, nsp3, nsp4, ORF3a и ORF8. Однако роль Т клеточного иммунитета в защите от covid-2019 мало изучена.

https://immunology.sciencemag.org/content/5/48/eabd2071

https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2770758

У некоторых людей, никогда не болевших covid-2019, обнаруживается Т клеточный иммунитет к SARS-CoV-2. Это перекрестный иммунитет к сезонным коронавирусам, с которыми человек встречался в прошлом. Такая кросс-реактивность возможна, поскольку Т клеточный иммунитет длительный, и эпитопы Т клеток «короткие».

https://habr.com/ru/post/569292/
Всего голосов 30: ↑22 и ↓8+14
Комментарии57

Что такое гуморальный иммунитет?

Время на прочтение4 мин
Количество просмотров25K

Привет, я молекулярный биолог и волонтер чатов по вакцинации V1V2. Сегодня я начну писать об иммунитете и вакцинации. Эпидемия covid-2019 не закончится пока не будет сформирован коллективный иммунитет. Большинство из нас иммунитет приобретет. У нас есть выбор между иммунитетом после вакцины и иммунитетом после болезни с летальностью 1.5 - 3% и непредсказуемыми осложнениями. К сожалению, информации не хватает. Важно, чтобы об исследованиях вакцин узнало как можно больше людей.

Начнем серию статей с разбора гуморального иммунитета, который защищает нас с помощью антител.

После вакцинации, как и после болезни covid-2019, сначала образуются ранние антитела IgM и IgA (сывороточные) (с 7-14 суток), которые держатся несколько недель, а затем – IgG (с 14-30 суток), которые держатся несколько месяцев. На 30-60 сутки после вакцинации наблюдаются максимальные значения IgG.

Динамика образования антител после болезни, аденовирусных и мРНК вакцин описана в научных статьях.

https://www.nature.com/articles/s41564-020-00813-8

https://immunology.sciencemag.org/content/5/52/eabe0367

https://www.thelancet.com/journals/eclinm/article/PIIS2589-5370(21)00014-6/fulltext

https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2770758

https://www.cell.com/med/fulltext/S2666-6340(21)00038-6?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS2666634021000386%3Fshowall%3Dtrue

Антитела распознают эпитопы – уникальные участки чужеродных белков (антигенов). Часть антитела, распознающая эпитоп, называется паратопом. К некоторым эпитопам антитела образуются чаще, чем к другим. Антитела синтезируются В-лимфоцитами. «Наивные» В-лимфоциты (в лимфоузлах и селезенке) при первой встрече с антигеном активируются, начинают делиться, проходят селекцию на прочное связывание антигена и «превращаться» в плазматические клетки, которые секретируют антитела. Часть клонов В-лимфоцитов становятся В-клетками памяти – долгоживущими В-лимфоцитами, которые обеспечат быструю выработку большого количества IgG антител (минуя IgM) при повторной встрече организма с антигеном. Большинство плазматических клеток погибает после исчезновения антигена в организме, но около 10-20% плазматических клеток живет дольше и также вносит вклад в долговременный иммунитет.

https://habr.com/ru/post/569316/
Всего голосов 51: ↑40 и ↓11+29
Комментарии366

Визуализация и анализ белков в Biopython

Время на прочтение9 мин
Количество просмотров7.6K

Биология человека – невероятно сложная наука. Даже учитывая, что с каждым годом мы открываем всё больше секретов человеческого тела, получаемые нами ответы порождают всё большее количество вопросов. Завершение проекта "Геном человека" придало многим учёным уверенность в том, что с помощью геномики человечество сможет решить важные биологические проблемы. Однако, чем больше биологических тайн мы раскрываем, тем более отчётливо понимаем, что на использование генома организма влияют другие факторы. Соответственно, для решения задач в этих взаимосвязанных областях, в том числе транскриптомике (изучение мРНК) и протеомике (изучение белков) были созданы новые направления научных исследований, в которых начали использовать Python.

Сегодня, специально к старту новых потоков на курсы Python для анализа данных, Fullstack-разработчик на Python и Python для веб-разработки в этой статье расскажем вам про еще одно применение этого прекрасного языка — в научных исследованиях.

Приятного чтения!
Всего голосов 12: ↑11 и ↓1+10
Комментарии0

Реверс-инжиниринг исходного кода коронавирусной вакцины от компаний BioNTech/Pfizer

Время на прочтение11 мин
Количество просмотров104K
Добро пожаловать. В данном посте мы посимвольно разберём исходный код вакцины BioNTech/Pfizer SARS-CoV-2 мРНК.

Да, такое заявление может вас удивить. Вакцина – это ведь жидкость, которую вводят человеку в руку. При чём тут какой-то исходный код?

Хороший вопрос. Начнём мы с небольшой части того самого исходного кода вакцины BioNTech/Pfizer, также известной, как BNT162b2, также известной, как Tozinameran, также известной, как Comirnaty.


Первые 500 символов мРНК BNT162b2.

В сердце вакцины находится вот такой цифровой код. Его длина составляет 4284 символа, так что его вполне можно уместить в несколько твитов. В самом начале процесса производства вакцины кто-то закачал этот код в ДНК-принтер (ага), который, в свою очередь, превратил байты с накопителя в реальные молекулы ДНК.
Всего голосов 316: ↑310 и ↓6+304
Комментарии359

COVID-19: чем пробуют лечить, чем можно лечить и немного теорий заговора

Время на прочтение6 мин
Количество просмотров37K

Тема COVID-19 сейчас звучит из каждого утюга, и каждый, кто был военным аналитиком в январе, экономистом в нефтяной отрасли в феврале, сейчас внезапно превратился в вирусолога. Тем не менее из информационного потока можно выделить весьма достойные заметки. Нам хотелось бы рассказать немного о некоторых препаратах – и параллельно затронуть всплывающую тему сходства с ВИЧ (сходства, которого нет), а также то, что якобы „препараты против ВИЧ работают и против коронавируса SARS-CoV-2“ (НЕТ, или как минимум не совсем так).


Даже небезызвестный Люк Монтанье (Нобелевская премия за открытие ВИЧ) недавно высказал своё мнение по поводу того, что коронавирус SARS-CoV-2 был сделан искусственно, причём были использованы части генома ВИЧ. Скорее всего, он сделал это заявление потому, что предположительно SARS-CoV-2 может проникать в T-клетки иммунной системы, однако исследования показывают, что между геномами этих двух вирусов нет ничего общего.

Читать дальше →
Всего голосов 59: ↑50 и ↓9+41
Комментарии112

Коронавирус: мы все умрём?

Время на прочтение17 мин
Количество просмотров55K
Что мы говорим Богу смерти? — Не сегодня.
Сирио Форель, сериал «Игра престолов».


Насколько действительно опасен коронавирус COVID-19? Сколько людей умрёт от коронавируса в мире? А сколько – в России? Так ли необходимы жесткие меры, принимаемые для борьбы с коронавирусом в большинстве стран мира? Что принесет больше ущерба: смерть людей от коронавируса или падение экономики, вызванное ограничительными мерами?

Чтобы ответить на эти актуальные вопросы, необходимо провести математическое моделирование и спрогнозировать ущерб от коронавируса для отдельных стран и для мира в целом. Построению таких прогнозов посвящена данная статья.

Чтобы сделать материал доступным для всех читателей, в начале статьи мы сконцентрируемся на качественном анализе, и красивых картинках. А в самом конце для интересующихся приведем исходный код для расчетов, выполненных на языке Python.
Читать дальше →
Всего голосов 175: ↑126 и ↓49+77
Комментарии601

Внезапно: кавычки против мракобесия. Что бы это ни значило

Время на прочтение6 мин
Количество просмотров29K
Есть на свете вещи действительно важные. Наверное, есть. Должны быть. Да по любому есть.
А есть на свете вещи «важные». Чувствуете разницу? «Важных» вещей полно на работе, в политике, в телевизоре и интернете. Сегодня поговорим только про работу.

Итак, есть у нас (а может, и у вас) на работе личности, которые любят придать важности тому, что делают и говорят. Со стороны это выглядит и забавно, и комично, и нелепо. Хотя, если не обращать на важность внимание, то происходит чудо: перестаешь ее замечать и начинаешь верить. И все вокруг начинают верить.

Так исчезают вещи «важные», и появляются важные, Важные, ВАЖНЫЕ и СУПЕРВАЖНЫЕ!!! Я за то, чтобы такого не было. Всё должно быть адекватно реальности. Поэтому я, читая письма и слушая речи, всегда применяю к ним фильтр. Он уже автоматом срабатывает, как предустановленное сглаживание и размывание фона в камере смартфона.

Главный фильтр, конечно, кавычки.
Читать дальше →
Всего голосов 105: ↑82 и ↓23+59
Комментарии67

Клещевой энцефалит: опасность, которой пренебрегают

Время на прочтение4 мин
Количество просмотров27K

О клещевом энцефалите слышали, пожалуй, все, однако и сегодня можно услышать множество мифов касательно этой болезни. Так, например, в Сибири люди массово покупают страховки от укуса клеща, в которую входит инъекция иммуноглобулина; применяют такие средства, как йодантипирин или анаферон; в конце концов, решают, что достаточно просто достать клеща и прижечь место укуса.


Эта статья – не руководство по профилактике и лечению клещевого энцефалита. В том случае, если вас укусил клещ, необходимо в первую очередь обратиться к врачу.

Читать дальше →
Всего голосов 51: ↑40 и ↓11+29
Комментарии81

Гепатит С: «ласковый убийца»

Время на прочтение4 мин
Количество просмотров34K

Когда мы говорим о тяжёлых инфекционных заболеваниях, приводящих к смерти и подвергающихся наибольшей стигматизации, обычно имеется в виду ВИЧ. Среди других же заболеваний особенно выделяется гепатит C. Большая часть людей, инфицированных вирусом гепатита C, приобретают хроническую инфекцию, протекающую бессимптомно и приводящую к циррозу и раку печени, а впоследствии, соответственно, смерти. Из-за этих своих особенностей гепатит C получил прозвище „ласковый убийца“.


Гепатит C и ВИЧ часто упоминаются вместе, и это не случайность: сегодня они являются наиболее опасными стремительно распространяющимися инфекционными заболеваниями. Оба этих заболевания передаются через контакт крови; однако заражение гепатитом C через половой контакт гораздо менее вероятно.

Читать дальше →
Всего голосов 59: ↑57 и ↓2+55
Комментарии37

ВИЧ – методы лечения от первых лекарств до сегодняшнего дня

Время на прочтение10 мин
Количество просмотров32K

Прежде, чем приступить к изложению материала, хотелось бы сказать несколько слов о себе: участник сообществ по борьбе с отрицанием ВИЧ („ВИЧ/СПИД диссидентством“): в 2016-2018 годах „ВИЧ/СПИД диссиденты и их дети“, с 2018 года – „ВИЧ/СПИД отрицание и альтернативная медицина“.


Моё – и далеко не только моё – мнение состоит в том, что большинство случаев отказа от лечения ВИЧ-инфекции вызвано банальным непониманием того, что это контролируемая хроническая инфекция, а также стигматизацией людей, живущих с ВИЧ – применением к ним распространённого клише, что ВИЧ – болезнь низших слоёв общества либо же наоборот, „культурной элиты“. Это давно не так – в России примерно 1% населения живёт с ВИЧ, и ситуация не планирует становиться лучше.


Около года назад несколько статей на этом ресурсе сподвигли меня на написание пяти заметок об истории борьбы с вирусами. Целью этих статей было описание принципов работы различных типов лекарств от ВИЧ (консультантами выступали микробиолог и врач-инфекционист). Надеюсь, переложение этих заметок вам понравится.

Читать дальше →
Всего голосов 88: ↑87 и ↓1+86
Комментарии110

Информация

В рейтинге
Не участвует
Откуда
Германия
Зарегистрирован
Активность