Предыстория

Так произошло, что сервер был атакован вирусом шифровальщиком, который по "счастливой случайности", частично отставил нетронутыми файлы .ibd (файлы сырых данных innodb таблиц), но при этом полностью зашифровал файлы .fpm (файлы структур). При этом .idb можно было поделить на:

• подлежащие восстановлению через стандартные средства и гайды. Для таких случаев, есть отличная статья;
• частично зашифрованные таблицы. Преимущественно это большие таблицы, на которые (как я понял), злоумышленниками не хватило оперативной памяти на полное шифрование;
• ну и полностью зашифрованные таблицы, не подлежащие восстановлению.