Чисто для понимания контекста — сам секвенатор в компактном варианте (Oxford nanopore MINion)[https://nanoporetech.com/products/minion-comparison] стоит порядка 500 евро за запуск и требует небольшой, но всё же лаборатории для пробоподготовки. И к тому же умеет анализировать данные только относительно большими пачками за относительно долгое время.
То есть до системы типа "ткнул мобилой в объект — получил ну хотя бы один-два целевых гена" всё ещё как до Берлина. Это в лучшем случае полезная приблуда для экспедиций в центральную Африку и прочие задницы мира, да и то не факт.
Попробуйте Cogmind, он практически Immersive Sim в шкуре рогалика. Миллион билдов, причём небоевые даже поинтереснее будут, вариативное прохождение, подробный лор (который на тебя не вываливается, а надо прям специально озаботиться его поиском). По сравнению с тем же ADOM, где макростратегия укладывается в две опции "фигачить данное подземелье до победного" и "пойти погриндить где-то ещё, а потом вернуться" прям глоток свежего воздуха.
Ну не совсем никакой, нужна ревертаза и флуоресцентные зонды. Плюс ПЦР-РВ (в реальном времени, который даёт оценку количества исходного материала) требует более сложного амплификатора, чем просто препаративный ПЦР (который для целей диагностики даёт один бит "есть/нету или крайне мало") Я потому и упомянул ДНК, что её ПЦР вообще копейки стоит, а с РНК чуть подороже и ощутимо посложнее. Но при наличии инфраструктуры для хоть какого-то ПЦР-РВ коронаспецифичными будут только праймеры и зонды, а производство праймеров — штука, грубо говоря, вроде 3d-печати: машина берёт файл на входе и производит что написано. Ей примерно пофигу, один раз печатать тот же самый файл или тысячу. Насколько я знаю, праймеры даже в промышленных масштабах не выращивают в трансгенных клетках (ну и зонды очевидно нельзя просто взять и вырастить, там же ещё флуорофор надо приделать).
С логистической точки зрения тоже пофиг, одну двадцатинуклеотидную молекулу фасовать или другую. Праймеры вообще прекрасно хранятся годами в растворе при +4; для ферментов сложнее, но сухого льда или морозилки обычно хватает.
С вакциной это не так. У них там модифицированный аденовирус в качестве вектора, а это какой-никакой живой организм. Его как раз надо выращивать в клетках хозяина, то есть нужен этот самый хозяин (понятия не имею, в ком они его растят, но рискну предположить, что культура животных клеток), и биореактор под него, и подбор условий (чтоб клетки росли, вирус рос и всё у них было хорошо), и методика выделения вируса из культуры, и потом убедиться, что вирионы не портятся в процессе хранения и транспортировки, и ещё сто миллиардов вещей.
Если что, я ни разу не хейтер российских производителей ПЦР-реагентики; что-то, а ферменты у того же Еврогена нормальные. И не говорю, что разработка хорошей ПЦР-системы под данный конкретный объект — это раз плюнуть. Я только говорю, что масштабирование до промышленных объёмов по завершении разработки для ПЦР-системы гораздо проще, чем для аденовирусной вакцины.
В ПЦР-системе специфичного для данной мишени только праймеры и зонды. Кастомные праймеры для ПЦР ДНК я регулярно заказываю мелкими партиями по цене порядка нескольких рублей на реакцию (и это самыми маленькими возможными партиями); флуоресцентные зонды дороже, но в разы, а не на порядки. Амплификаторы в лабораториях так и так стоят, если они хоть какой-то ПЦР делают, ревертазы и полимеразы с буферами тоже явно не специфически разрабатывались под эти тесты. То есть развёртывание производства ПЦР-системы требует по сути только развёртывания производства праймеров/зондов (реалистичнее — переориентировки производства каких-нибудь других праймеров на эти) и м.б. увеличения производства тех или иных ферментов.
Короче, это вообще не то же самое, что развернуть производство вакцины.
Мне в своё время нативный стим не зашёл вообще. Усилий на то, чтоб завести игру через bumblebee, нужно обычно больше, чем для сборок от GOG и пираток; видеокарты игра то видит, то нет; если таки не завелось, рефанд долгий и неудобный; и вообще стим должен быть такой кнопкой "сделайте мне хорошо", а на линуксе это ни фига не так. В итоге стал покупать лицензии DRM-free на GOG, а потом просто поставил Win10 дуалбутом и радуюсь.
Не согласен. Наукометрия — это скорее штука вроде тестов IQ. То есть да, каждый конкретный тест не идеален, но никто не сомневается, что измеряемая величина существует и нуждается в измерении.
Невозможно просто "собрать сотню топовых университетов" и заставить их сделать что бы то ни было. Довольно сложно даже один из них заставить сделать что-то, немножечко чуть-чуть дорогостоящее в смысле репутации и всяких популярных писькомерок/KPI (а число публикаций — самая очевидная и популярная метрика для сопоставления научных организаций). Настолько радикальная реформа системы публикаций — это однозначно "до основанья, а затем".
Да, получается, что в РАН сильно комфортнее ситуация. У нас ненаучные критерии (общественная работа, спорт и всё такое) вообще отсутствуют, а по научным нормативы пишет где сам институт, где РАН. Совсем уж бессмысленные указания от человека, не представляющего себе научную работу, не спускаются. "Отдела мониторинга эффективности" или аналога нет, требования Минобрнауки (а до того ФАНО) касаются скорее статистики института в целом, чем каждого учёного в отдельности.
Видимо, поэтому статья и ругает профессуру, а не (вряд ли более умных или честных) сотрудников НИИ.
В вузах критерии намного строже, чем в РАН? Потому что я работаю в академии наук (Лимнологический Институт СО РАН), и у нас требования что-то порядка 5-7 статей за 5 лет для нс. Первое авторство не обязательно; я, например, биоинформатик, и у меня куча публикаций, в которых я сделал для биологов какой-нибудь тривиальный анализ (PCA/NMDS там отрисовал, или посчитал пригоршню p-value, ну максимум прошёлся по данным уже имеющимся пайплайном) и получил за это соавторство. Получается, я требования по публикациям могу закрыть даже не своей работой, а парой копеечных расчётов в год. Знаю, что почти так же у наших гидрохимиков — сделал несколько рутинных анализов (концентрации того-сего в воде, например) и соавтор. Ну и своих одна-две статьи в год всё же получается. То есть у нас сложно даже вообразить такую ситуацию, что активно занимаешься наукой, а под формальные критерии не попадаешь.
Мне кажется или это перевод (ибо нет в русском слова "техночувак", а вот в английском techbro вполне себе есть; и синтаксис в нескольких местах откровенно английский)? Если таки да, то приложите ссылку на оригинал.
Очевидно, что вне numpy/scipy я тысячи чисел ворочать и не собираюсь. Плюс sklearn для всякого обучения (да даже для тривиальных визуализаций типа PCA). Проблема в том, что многие проблемы биоинформатики — это какая-нибудь история с обработкой строк, для которой в питоне я супербыстрых имплементаций не знаю.
Ну вот люди вроде меня используют. Я по образованию биолог, на питоне пишу прилично, а вот на C++ дальше хэлловорлда в десятом классе не забирался. Так что у меня есть по сути три опции:
а) Заведомо медленная имплементация на питоне. Раздражает, но если это научный код — то ему обычно достаточно отработать несколько раз и не очень важно, это 4 запуска по полчаса или 4 запуска по полсекунды
б) Учить плюсы. Не мешало бы, честно говоря, но как-то не так сильно надо, чтоб прям разбираться в довольно сложном языке и его экосистеме (а ведь там надо учиться не просто кодить, а оптимизировать, иначе смысла нет)
в) Нанять сишника. Тоже неплохая идея, но ему ж платить надо. Плюс скорость итерации падает, если не сам прям сел и заговнокодил идею, а надо ещё донести её до неспециалиста.
Парадоксов, которые свои глобальные стратегии издают ещё чуть ли не с восьмидесятых, сложно назвать инди. Если не определять инди как "все, кроме EA, Ubisoft и Valve", конечно.
Не ортогонален вовсе. Нынешнее наблюдение — про активно метаболизирующую жизнь. А таковая на современной Земле таки требует ДНК.
Но не достаточное чтобы делать утверждения о происхождении.
Факт наличия длинноцепочечной ДНК ещё нет, аналогичный механизм наследования мог и независимо возникнуть. А вот если её удастся отсеквенировать — то установить сходство или несходство с земной жизнью абсолютно тривиально. Но вообще согласен, последнее предложение моего поста должно бы содержать "жизни, аналогичной земной", а не "родственной"
У земных таки у всех. РНК-вирусы и прионы, хотя с некоторой натяжкой и могут считаться живыми, строго паразиты. Поэтому они для контаминации Венеры непригодны — за неимением совместимого хозяина это просто кучка молекул. Теоретически свободноживущий РНКовый организм возможен, но на практике не наблюдался. Так что наличие ДНК — необходимое условие для жизни, родственной земной, и достаточный аргумент для её наличия.
Давайте начнём с того, что большинство присутствующих всё-таки не в Южном Судане живёт. Многие даже не на Донбассе, так что тут можно немного умерить пыл.
Уолтер Уайт всё же средний класс. Он "средний" ни фига не в значении average даже для своего времени, а к тому же тот средний класс кончается. Сам в штатах не жил, но в англоязычных интернетах я регулярно вижу истории про то, что вполне себе взрослые профессионалы под тридцать (учителя, квалифицированные рабочие, мелкие инженеры, менеджеры — то есть как раз те, кто полтора поколения назад этот самый средний класс сформировали) снимают хату на двоих-троих вместо того, чтоб просто пойти и купить себе домик где-нибудь на окраине Сан-Франциско. Ну и вообще щас бы по сериалам десятилетней давности страну оценивать, честно говоря.
Верховенство закона работает во взаимоотношениях губернаторов и оппозиционеров, а вот с рядовыми гражданами (и полицейскими) как-то не очень. Посмотрите хоть на нынешние протесты BLM — ни перестать стрелять рандомных негров за здорово живёшь, ни подавить возникающие в результате этого бунты власть не может.
В России и СНГ очень много чего не так, но если уезжать — лично для меня Штаты даже не в топ-10.
Не из этого года, кажется, но не так давно на русском вышло "Идеальное несовершенство" Дукая. Его многие считают равным Лему, на мой вкус заслуженно.
Чисто для понимания контекста — сам секвенатор в компактном варианте (Oxford nanopore MINion)[https://nanoporetech.com/products/minion-comparison] стоит порядка 500 евро за запуск и требует небольшой, но всё же лаборатории для пробоподготовки. И к тому же умеет анализировать данные только относительно большими пачками за относительно долгое время.
То есть до системы типа "ткнул мобилой в объект — получил ну хотя бы один-два целевых гена" всё ещё как до Берлина. Это в лучшем случае полезная приблуда для экспедиций в центральную Африку и прочие задницы мира, да и то не факт.
Попробуйте Cogmind, он практически Immersive Sim в шкуре рогалика. Миллион билдов, причём небоевые даже поинтереснее будут, вариативное прохождение, подробный лор (который на тебя не вываливается, а надо прям специально озаботиться его поиском). По сравнению с тем же ADOM, где макростратегия укладывается в две опции "фигачить данное подземелье до победного" и "пойти погриндить где-то ещё, а потом вернуться" прям глоток свежего воздуха.
Как эволюционный биолог, не могу не одобрить ваше решение.
Ну не совсем никакой, нужна ревертаза и флуоресцентные зонды. Плюс ПЦР-РВ (в реальном времени, который даёт оценку количества исходного материала) требует более сложного амплификатора, чем просто препаративный ПЦР (который для целей диагностики даёт один бит "есть/нету или крайне мало") Я потому и упомянул ДНК, что её ПЦР вообще копейки стоит, а с РНК чуть подороже и ощутимо посложнее. Но при наличии инфраструктуры для хоть какого-то ПЦР-РВ коронаспецифичными будут только праймеры и зонды, а производство праймеров — штука, грубо говоря, вроде 3d-печати: машина берёт файл на входе и производит что написано. Ей примерно пофигу, один раз печатать тот же самый файл или тысячу. Насколько я знаю, праймеры даже в промышленных масштабах не выращивают в трансгенных клетках (ну и зонды очевидно нельзя просто взять и вырастить, там же ещё флуорофор надо приделать).
С логистической точки зрения тоже пофиг, одну двадцатинуклеотидную молекулу фасовать или другую. Праймеры вообще прекрасно хранятся годами в растворе при +4; для ферментов сложнее, но сухого льда или морозилки обычно хватает.
С вакциной это не так. У них там модифицированный аденовирус в качестве вектора, а это какой-никакой живой организм. Его как раз надо выращивать в клетках хозяина, то есть нужен этот самый хозяин (понятия не имею, в ком они его растят, но рискну предположить, что культура животных клеток), и биореактор под него, и подбор условий (чтоб клетки росли, вирус рос и всё у них было хорошо), и методика выделения вируса из культуры, и потом убедиться, что вирионы не портятся в процессе хранения и транспортировки, и ещё сто миллиардов вещей.
Если что, я ни разу не хейтер российских производителей ПЦР-реагентики; что-то, а ферменты у того же Еврогена нормальные. И не говорю, что разработка хорошей ПЦР-системы под данный конкретный объект — это раз плюнуть. Я только говорю, что масштабирование до промышленных объёмов по завершении разработки для ПЦР-системы гораздо проще, чем для аденовирусной вакцины.
В ПЦР-системе специфичного для данной мишени только праймеры и зонды. Кастомные праймеры для ПЦР ДНК я регулярно заказываю мелкими партиями по цене порядка нескольких рублей на реакцию (и это самыми маленькими возможными партиями); флуоресцентные зонды дороже, но в разы, а не на порядки. Амплификаторы в лабораториях так и так стоят, если они хоть какой-то ПЦР делают, ревертазы и полимеразы с буферами тоже явно не специфически разрабатывались под эти тесты. То есть развёртывание производства ПЦР-системы требует по сути только развёртывания производства праймеров/зондов (реалистичнее — переориентировки производства каких-нибудь других праймеров на эти) и м.б. увеличения производства тех или иных ферментов.
Короче, это вообще не то же самое, что развернуть производство вакцины.
Мне в своё время нативный стим не зашёл вообще. Усилий на то, чтоб завести игру через bumblebee, нужно обычно больше, чем для сборок от GOG и пираток; видеокарты игра то видит, то нет; если таки не завелось, рефанд долгий и неудобный; и вообще стим должен быть такой кнопкой "сделайте мне хорошо", а на линуксе это ни фига не так. В итоге стал покупать лицензии DRM-free на GOG, а потом просто поставил Win10 дуалбутом и радуюсь.
Не согласен. Наукометрия — это скорее штука вроде тестов IQ. То есть да, каждый конкретный тест не идеален, но никто не сомневается, что измеряемая величина существует и нуждается в измерении.
Невозможно просто "собрать сотню топовых университетов" и заставить их сделать что бы то ни было. Довольно сложно даже один из них заставить сделать что-то, немножечко чуть-чуть дорогостоящее в смысле репутации и всяких популярных писькомерок/KPI (а число публикаций — самая очевидная и популярная метрика для сопоставления научных организаций). Настолько радикальная реформа системы публикаций — это однозначно "до основанья, а затем".
Да, получается, что в РАН сильно комфортнее ситуация. У нас ненаучные критерии (общественная работа, спорт и всё такое) вообще отсутствуют, а по научным нормативы пишет где сам институт, где РАН. Совсем уж бессмысленные указания от человека, не представляющего себе научную работу, не спускаются. "Отдела мониторинга эффективности" или аналога нет, требования Минобрнауки (а до того ФАНО) касаются скорее статистики института в целом, чем каждого учёного в отдельности.
Видимо, поэтому статья и ругает профессуру, а не (вряд ли более умных или честных) сотрудников НИИ.
В вузах критерии намного строже, чем в РАН? Потому что я работаю в академии наук (Лимнологический Институт СО РАН), и у нас требования что-то порядка 5-7 статей за 5 лет для нс. Первое авторство не обязательно; я, например, биоинформатик, и у меня куча публикаций, в которых я сделал для биологов какой-нибудь тривиальный анализ (PCA/NMDS там отрисовал, или посчитал пригоршню p-value, ну максимум прошёлся по данным уже имеющимся пайплайном) и получил за это соавторство. Получается, я требования по публикациям могу закрыть даже не своей работой, а парой копеечных расчётов в год. Знаю, что почти так же у наших гидрохимиков — сделал несколько рутинных анализов (концентрации того-сего в воде, например) и соавтор. Ну и своих одна-две статьи в год всё же получается. То есть у нас сложно даже вообразить такую ситуацию, что активно занимаешься наукой, а под формальные критерии не попадаешь.
Как это всё у вас выглядит количественно?
Мне кажется или это перевод (ибо нет в русском слова "техночувак", а вот в английском techbro вполне себе есть; и синтаксис в нескольких местах откровенно английский)? Если таки да, то приложите ссылку на оригинал.
Очевидно, что вне numpy/scipy я тысячи чисел ворочать и не собираюсь. Плюс sklearn для всякого обучения (да даже для тривиальных визуализаций типа PCA). Проблема в том, что многие проблемы биоинформатики — это какая-нибудь история с обработкой строк, для которой в питоне я супербыстрых имплементаций не знаю.
Ну вот люди вроде меня используют. Я по образованию биолог, на питоне пишу прилично, а вот на C++ дальше хэлловорлда в десятом классе не забирался. Так что у меня есть по сути три опции:
а) Заведомо медленная имплементация на питоне. Раздражает, но если это научный код — то ему обычно достаточно отработать несколько раз и не очень важно, это 4 запуска по полчаса или 4 запуска по полсекунды
б) Учить плюсы. Не мешало бы, честно говоря, но как-то не так сильно надо, чтоб прям разбираться в довольно сложном языке и его экосистеме (а ведь там надо учиться не просто кодить, а оптимизировать, иначе смысла нет)
в) Нанять сишника. Тоже неплохая идея, но ему ж платить надо. Плюс скорость итерации падает, если не сам прям сел и заговнокодил идею, а надо ещё донести её до неспециалиста.
Парадоксов, которые свои глобальные стратегии издают ещё чуть ли не с восьмидесятых, сложно назвать инди. Если не определять инди как "все, кроме EA, Ubisoft и Valve", конечно.
Назовите мне хоть одно инди (именно инди, не фортнайт с рокет-лигой), которое перешло на f2p-модель. Дота во времена царя Гороха?
Не ортогонален вовсе. Нынешнее наблюдение — про активно метаболизирующую жизнь. А таковая на современной Земле таки требует ДНК.
У земных таки у всех. РНК-вирусы и прионы, хотя с некоторой натяжкой и могут считаться живыми, строго паразиты. Поэтому они для контаминации Венеры непригодны — за неимением совместимого хозяина это просто кучка молекул. Теоретически свободноживущий РНКовый организм возможен, но на практике не наблюдался. Так что наличие ДНК — необходимое условие для жизни, родственной земной, и достаточный аргумент для её наличия.
Давайте начнём с того, что большинство присутствующих всё-таки не в Южном Судане живёт. Многие даже не на Донбассе, так что тут можно немного умерить пыл.
Уолтер Уайт всё же средний класс. Он "средний" ни фига не в значении average даже для своего времени, а к тому же тот средний класс кончается. Сам в штатах не жил, но в англоязычных интернетах я регулярно вижу истории про то, что вполне себе взрослые профессионалы под тридцать (учителя, квалифицированные рабочие, мелкие инженеры, менеджеры — то есть как раз те, кто полтора поколения назад этот самый средний класс сформировали) снимают хату на двоих-троих вместо того, чтоб просто пойти и купить себе домик где-нибудь на окраине Сан-Франциско. Ну и вообще щас бы по сериалам десятилетней давности страну оценивать, честно говоря.
Верховенство закона работает во взаимоотношениях губернаторов и оппозиционеров, а вот с рядовыми гражданами (и полицейскими) как-то не очень. Посмотрите хоть на нынешние протесты BLM — ни перестать стрелять рандомных негров за здорово живёшь, ни подавить возникающие в результате этого бунты власть не может.
В России и СНГ очень много чего не так, но если уезжать — лично для меня Штаты даже не в топ-10.
Пруфов бы, а то фраза не гуглится (за исключением данной страницы).