Ученые из Стэнфордского университета создали ИИ-агента, который умеет самостоятельно проводить биологические исследования. CellVoyager получает набор данных о генной активности клеток, сам решает, как их анализировать, пишет код, запускает его и интерпретирует результаты — без участия человека. Работа опубликована в Nature Methods.
Современная биология активно использует одноклеточное РНК-секвенирование — технологию, которая показывает, какие гены включены в каждой отдельной клетке. Один эксперимент дает данные по тысячам клеток, и разобраться в них — задача на недели для квалифицированного биоинформатика. Нужно выбрать методы анализа, написать код, проверить результаты, выдвинуть гипотезы. CellVoyager делает все это автоматически: получает «сырые» данные и выдаёт готовые выводы с визуализациями в среде Jupyter.
Команда Джеймса Цзоу проверила агента на трех реальных задачах: анализе иммунного ответа при COVID-19, изучении межклеточной коммуникации и исследовании механизмов старения. В каждом случае CellVoyager обнаружил закономерности, которые подтверждались биологически, но не были описаны в оригинальных публикациях. Независимые эксперты оценили находки как креативные и научно обоснованные.
Для оценки масштабируемости авторы также создали бенчмарк CellBench из 76 опубликованных исследований: агент получал только вводную часть статьи и должен был предсказать, какие анализы авторы в итоге провели. CellVoyager справился с этим до 23% лучше, чем языковые модели вроде OpenAI o3.
Похожие ИИ-агенты уже появлялись для химии и материаловедения, но для одноклеточной геномики автономная система уровня публикации в Nature Methods — пока редкость. Если такие агенты окажутся достаточно надежными, они смогут взять на себя рутинную часть работы биоинформатиков — и, возможно, находить то, что человек просто не успевает заметить в потоке данных.
P.S. Поддержать меня можно подпиской на канал "сбежавшая нейросеть", где я рассказываю про ИИ с творческой стороны.
