Тут я с вами несоглашусь! :) Использую по возможности sftp. Это протокол для файловых операций специально написанный для ssh. И считаю, что есть есть выбор, то он падает в пользу sftp.
Хех, помню лицо админа нашей сети, когда он увидел как я переименовываю по FTP папку в что-то вроде "../../those/dir". Он сразу понял что я делаю, но сам до этого раньше не додумывался.
В коммандере кстати это делается проще.
1. Создается подкаталог old в каталоге, из которого надо перенести файлы.
2. Ctrl+A, далее зажимаем шифт и тащим все файлы в папку old. Они будут перемещены туда.
3. наводим курсор на old, жмем Shift+F6, пишем ../old
Вуаля!
Lifehack FTP: переносим папки и файлы