Во первых все находится в одном месте, получается некий менеджер заготовок, можно просмотреть, сгенерить.
Закидываем проект с шаблонами в vcs и получаем разные версии по шаблонам с коментариями, кто что добавил.
В файлах можно использовать различные параметры, если хранить конфиги внутри проекта например от нгинкс, то можно параметры подставить куда надо.
В итоге времени, не сказать чтобы кучу, но немного экономится.
Шаблоны проектов на основе PasteScript