Попробуйте поиграться с настройками:
1. Уменьшите количество ядер и потоков, в которых NCrunch запускает тесты
2. Выберите режим запуска только impacted тестов. В NCrunch это пока экспериментальная фича, а вот в Continuous Tests она работает стабильно — можете попробовать перейти на Continuous Tests
Continuous Testing в .NET