хм. меня жестко смутила запись diff -r ZendFramework-1.5.0/library/Zend/Cache/Core.php ZendFramework-1.5.0RC3/library/Zend/Cache/Core.php
сначала подумал что это один файл проверяли.
извиняйте за не внимательность =)
Вообще команда вот такая.
diff -r ZendFramework-1.5.0/library/Zend/ ZendFramework-1.5.0RC3/library/Zend/ > zend_diff
Как-то странно сравнивать только один файл.
Скачайте,распакуйте, запустите и сами все посмотрите.
Zend Framework 1.5.0 Release отличия от RC3