А зачем 2?
Это ж ссылка на один и тот же файл по нормальному.
Я не специалист по Apparmor — у меня заработало так, можете поэкспериментировать.
А если размер БД таблиц порядка ТБ? Сервер не ляжет?
Думаю, ляжет. По крайней мере, нужно не надеяться на нормальную работу сервера в это время. Время апгрейда таблиц будет зависеть от количества изменений для каждой таблицы.
Не уверен что 5.7 (в том числе перкона) готов к продакшену. У нас тесты нашли две проблемы: одну с неадекватным поведением полнотестового индекса и одну с проблемами в парсере запросов.
Обновление Percona Server до 5.7 на Ubuntu 14.04