3) В «Параметры — Программы — Отладка» должна стоять галочка на «Отладка по USB»
То есть, если не был включён данный режим до того, как всё упало, то уже никак не восстановить?
Было бы отлично почитать статью о внутреннем составе прошивок из чего они состоят и какой файл за что отвечает. Возможно где-то есть даже исходники каких-то компонентов. В частности это многим могло бы выпилить какие-то встроенные приложения и игры зашитые в телефон.
Если андроид => 4.2 — то не все так просто. Кроме включения режима отладки в настройках, необходима как минимум одно успешное соединение именно с этим компьютером, при котором нужно будет подтвердить доступ тапом на экране.
Замена системных файлов Android с помощью adb