Что общего между раком крови, лазерами и нейронными сетями?

[Denisdrus]

Спасибо, Николай, очень давно наблюдаю и пользуюсь вашими статьями, добра вам

[Viroslav_Venskii]

Спасибо и Вам! А как Вы ими пользуетесь?)

[desperadoo95]

Понравилась статья, очень большая работа была проделана, видео сразу ! Пишите чаще, будем наблюдать

[Viroslav_Venskii]

Спасибо за прочтение! Ну как только так сразу) Исследования требуют достаточно продолжительного времени)

[CrazyElf]

PCA не пробовали? Возможно, после PCA кластеры лучше будут разделяться. Или чем вы 13 колонок к 2D виду приводили, было же какое-то преобразование 13 колонок в 2 координаты? ) Сходу вообще не очень понимаю, где там координаты у вас получаются )

[Viroslav_Venskii]

PCA пробовали, но тут дело в другом. Мы брали 13 мерное пространство и там делали кластеризацию. После этого мы запоминали положения центроидов => можно осуществить классификацию каждой клетки, а уже потом рисовать в двумерном пространстве. PCA интересных и вменяемых результатов не дал(

[CrazyElf]

Понятно. Да, возможно в многомерном пространстве кластеризовать действительно лучше. Но тогда я бы попробовал разные методы кластеризации, их же много: https://scikit-learn.org/stable/modules/clustering.html Или там уже в скорость/количество данных упиралось и не всякий метод бы справился? Просто разные методы могут давать довольно разные результаты.

[Viroslav_Venskii]

Да, прям в точку, самые быстрые методы и те работают достаточно долго (около часа для пациентов). Была ещё интересная идея использовать количество кластеров (для unsupervised методов) как ФИЧУ!!! И это работает тоже неплохо. То есть мы делали несколько раз DBSCAN, но с разными параметрами и получали табличку: типо DBSCAN(30, 300) - 20 кластеров. И на удивление такой подход для большого количества кластеров дал хорошие метрики, но хуже чем наши более умные подходы, да и объяснить это достаточно непросто для врачей)

[katerina29]

А зачем вы нарисовали карты активации для CNN? что они значат, тут вообще не сильно понятно, что и как сетка сочла важным..

[Viroslav_Venskii]

Доброго времени суток, ну вот тут я и хотел указать, что не совсем понятно, как она смотрит, похоже на то, что она просто находит координаты центров, но опять же, на вход 78 картинок, на выходе 32 канала, видимо тут и происходит затык. Разберёмся!