Страхи то какие (-:
>> Т.е. приходится держать постоянно ненужную «верхнюю» панель.
Я обычно называю ненужной нижнюю панель, убиваю ее и ставлю gnome-do в режим Docky: itmages.ru/image/view/15997/857af2
Ну я например не стал париться, и одну панель убрал, а вторую просто заставил скрываться. В конфигах гнома можно и прибить по-настоящему, но смысла большого нет.
Как подружить Skype и AWN