Создание веб-приложения с использованием микрофронтендов и Module Federation

Так а о каких проблемах с юнит тестированием может идти речь?

Микрофронтенды должны реализовываться как полноценные мини проекты со своей собственной внутренней логикой, которая и будет тестировать в рамках этого мфе.

Все, что мфе могут делать между собой - всего лишь читать/изменять глобальное состояние приложения, находящееся в какой-нибудь ключевой библиотеке.

Если вдруг на вашем проекте встал вопрос об тестирование, значит вы где-то свернули не туда.