Ага, спасибо. Вы не могли бы предоставить информацию с About RubyMine (можно скриншот), подсказать вашу операционную систему, а также название используемого шрифта? Нашли похожее issue, можно туда все отправить.
IDE покажет все запущенные рубийные процессы, соответственно, все процессы passenger будут видны, надо только знать, к какому именно присоединиться. Ответил на ваш вопрос? Или не так понял?
Спасибо за P.S., завели баг. Вот здесь можно отслеживать задачку (а еще можно поставить "+").