Да. К всеобщему удивлению, несмотря на многие вещи, Codeigniter продолжает существовать (так как действительно, жизнью это нельзя назвать). Однако, даже на фоне своих форков, он не умер.
Как бы странной не выглядела эта затея, она является вынужденной. В том виде, в котором фреймворк сейчас находится, он по большому счету никому не нужен.
Что касается обратной совместимости, то она будет не настолько жестокий, что нельзя будет перенести приложение с ветки 3x. Перенос будет возможен, но необходимо будет немного потрудиться :)
Не стоит уже что-либо разрабатывать на второй версии. Если не хотите использовать другой фреймворк, а нравится Codeigniter или умеете разрабатывать приложения только на его основе, то необходимо хотя бы обновиться до третьей версии, в которую входят исправления различных ошибок предыдущих версий фреймворка, в том числе исправления ошибок в системе безопасности.
Что касается обратной совместимости, то она будет не настолько жестокий, что нельзя будет перенести приложение с ветки 3x. Перенос будет возможен, но необходимо будет немного потрудиться :)