Состояние спутника «Маяк»

Если используется контроллер с EEPROM памятью, то программа может быть повреждена/стёрта из-за, в частности, разрядов статического электричества.
Тут никакой WDT (сторожевой таймер) не поможет.
Так как у вас нет необходимости сохранять данные, был бы надёжнее использовать однократно программируемый (OTP) контроллер.

Если опубликуете схемы/топологию/алгоритмы можно было бы подробнее посмотреть.