Библиотека полнотекстового поиска Lucene предоставляет возможность организовать поиск по текстовым документам. Существуют так же средства, с помощью которых можно организовать поиск «похожих» химических структур, например, OpenBabel. Иногда может возникнуть потребность объединить эти два вида поиска в единой «канве». Например, если нужно создать систему, которая может отвечать на такие запросы: найти вещество, в текстовом описании которого есть слово «аминокислота», структурно похожее на индол (ожидается, что мы найдём аминокислоту триптофан). В этой статье описано решение данной задачи на основе полнотекстового движка Lucene.