Я совершенно с вами согласен в том, что биндинг к математическим пакетам ведет к каким-то накладным расходам и выглядит немного странно. Тем не менее, я считаю, что это отличный вариант для прототипирования приложений, в которых математическая подоплека составляет только часть функционала.
Сервер вычислений как замена линковке библиотек. Интересное решение. Это ведь можно использовать и для распараллеливания вычислений, запустив Rserve на нескольких компьютерах.
Как воспользоваться возможностями R в C++