Как перестать бояться и полюбить системную биологию

[degs]

мы обсудим высокоэффективное секвенирование и его применение к анализу экспрессии, транскрипционных факторов, и эпигенетических модификаций. Будут рассмотрены вопросы интеграции транскрипционных профилей с метаболическими данными, и другие интегративные подходы, позволяющие привести многочисленные геномные эксперименты к интерпретируемому биологическому результату.

Написано интересно, но для тех кто от математики уже ушел, а к биологии еще не пришел, хотелось бы понять, о чем это вообще?

[apredeus]

Статья получилась и сама по себе спорная, и опубликовал я ее тут для совсем не целевой аудитории, потому если ничего не понятно и неинтересно — то, как говорится, it's not you, it's me. Тем не менее, возможных целей три — 1) развлечь читателя, 2) заинтересовать людей, умеющих программировать и знающих математику, и рассказать им о прогрессе в области, и 3) пригласить тех, кто уже заинтересован, на нашу школу в мае. Надеюсь хотя бы одна из трех достигнута :)

главный месседж — о том, как изменилась биология за последних 10 лет, и почему это круто.

[degs]

так интересно же, но… непонятно
и о прогрессе неочевидно, опять же потому что мало понятно
хотелось бы понять, но из самой статьи не получается, хотя бы список литературы приведите (Докинза читал, больше — ничего)

[apredeus]

ну, с одной стороны, как я и написал, статья очень сомнительных достоинств — больше чтобы посмеяться, и узнать, что такое вообще существует, и что в последние 10 лет произошел технологический прорыв в методах (высокоэффективное секвенирование, ака next-generation sequencing). Но в целом, это огромная отрасль, которая к тому же весьма эмпирическая (надо знать экспериментальные факты и историю того, как люди пытались их объяснить, что отличает такие науки от математики и более теоретических отраслей физики, например). Сходу понять что к чему, наверное, не получится никак.

в принципе, можно начать с публикаций, которые приведены под статьей как «похожие публикации» — там многие из упомянутых понятий рассматривается более последовательно и в деталях.

[chomper]

Интересно, уже можно делать выводы об удачности этой попытки заинтересовать техно-гиков изучением биологии, судя по количеству комментариев? :)

Ну раз такое дело, то, пользуясь случаем, хочу передать прив… ээээ… нет, хочу задать вопрос. Может быть даже по теме :)

Давно интересует тема механизма работы иммунной системы, прежде всего человека. А посему интересует существование книг по этой теме, доступных для понимания человеку, знающему биологию на уровне чуть лучше школьной программы (и то имхо :). А еще лучше книги об истории развития иммунных механизмов во времени. Анализируя историю становится понятным в каком направлении происходило развитие.

Добавлю, что, хоть и отношусь к техно-гикам, биология с годами развивает всё больший интерес. Возможно, я не один такой. С удовольствием прочитал такие книги как «От нейрона к мозгу» (Дж. Г. Николлс и др.) и «Биология сенсорных систем» К. Смит. Но в них преимущественно упор делается на нейробиологию. И надо заметить, только начав изучение нейробиологии, стало понятно в каком направлении надо развивать подходы к реализации ИИ. И хоть это было лишь отправной точкой, системное понимание всей карты развития ИИ пришло только поэтому.

Спасибо за незаурядную статью. Надеюсь, у вас появится больше единомышленников.

UPD. пока писал свой «первый» коммент к статье, degs уже опередил :)

[anka]

настольных, потому что такой кирпич можно читать только со стола))

[Vinchi]

Кстати да, отличная книга. И еще «генетика человека» в 2 томах

[chomper]

И, все таки, хотелось бы непосредственно об иммунной системе.

[apredeus]

Привет! Спасибо что прочитали. По поводу иммунной системы — к сожалению, не могу порекомендовать ничего доступного. Сам читаю сейчас последнее издание Janeway's Immunology, но его не порекомендую даже врагу, настолько свирепая книжка.

Я бы, наверное, почитал статьи на биомолекуле с тегом «иммунология». В плане истории — там очень забавно было, сначала Мечников очень давно (в начале 20го века вроде) открыл врожденную иммунную систему, потом про это все благополучно забыли, т.к. открыли адаптивный иммунитет и сильно им увлеклись, и только после открытия роли макрофагов и дендритных клеток в передаче иммунных сигналов, в котором, кстати, важную роль сыграл Руслан Меджитов (русский иммунолог, которому, по мнению многих, незаслуженно не дали Нобелевскую премию), люди снова бросились изучать врожденный иммунитет.

[evr1ka]

Для поста от 18 марта приглашение до 10 марта выглядят оригинально. Правда год не уточняется, да.
Сама статья интересная. С удовольствием бы изучил данную тему, при наличии на то времени.

[apredeus]

Год 2015й, спасибо что заметили. Регистрация была во-первых продлена до 22го марта, а во-вторых по каким-то причинам статья ожидала модерации недели две по-моему — так что получилось как получилось :)

спасибо что прочитали.

[apredeus]

пофиксил дату.