Выравнивание в blast ncbi, который по сути и есть blast происходит след. образом: загружается файл fasta и далее можно произвести множественное выравнивание. Выравнивание в ugene— загружается файл fasta и производится множественное выравнивание.
Вы сравниваете не сравниваемое и не понимаете этого. Это как сравнивать IDE и библиотеку из какого-нибудь языка.
Вы осознаете отличие между бластом и веб интерфейсом к нему на ncbi?
И аппеляция прежде всего к Вашей квалификации и качеству статьи. Нужно разбираться в области прежде чем писать обзорные статьи, пусть и научпоп.
Веб интерфейс бласта представлен для удобства работы с алгоритмом бласт, по сути на ncbi работают на алгоритме blast, при помощи интерфейса. Об этом написано и в списке литературы.
P.S. Мы разбираемся в области в которой пишем. Мы считаем, что ответили максимально развернуто, на абстрактные претензии и мы так и не увидели от Вас компетентных комментариев без переходов на личности. Поэтому мы справедливо считаем, что этот вопрос закрыт. Если же вы хотите поспорить, то напишите опровержение данной статьи. Далее мы не будем кормить вас нашим временем. Всего доброго.
С десятками не работал, но работал с тысячей. Сложно, долго, мучительно, но возможно. Работал с десятком тысяч в mega 10 при нажатии ncbi blast. Там есть эта функция. Комп при этом работает сутками.
будете работать с десятком тысяч генов "в визуализации на странице ncbi".
К туче таких же как и blast
Blast - это лишь один сравнительно небольшой, но популярный пакет тулов. Ugene - это по сути обертка и графический интерфейс к куче тулов. Не только к blast.
И? Работают многими способами, где это отрицалось? Вопрос риторический— нигде не отрицалось, это был пример.
С генами работают многими способами. И не только используя выравнивания. И не только на ncbi. И не только с деятком-другим генов.
С бластом никто не запрещал сравнивать. Мы могли сравнить и с Genious, но решили сравнить с Blast, как и ученые в списках использованной литературы тоже сравнивали. И ничего страшного не произошло.
Ugene корректно сравнивать, например, с Genious. Но никак не с бластом.
Аппеляция к личности.
От этой статьи откровенно бомбит. Мои студенты отчеты лучше пишут.
P.S. Не бомбите в комментариях. Напишите опровержение этой статьи на хабре.
Текст был написан при консультации с биоинформатиками. Касаемо обертки, дык с генами работают в визуализации на странице ncbi. В Ugene есть куча всего того, что и есть в blast.
Например, пишете про blast как алгоритм, потом внезапно даете скрин страницы ncbi blast, который есть лишь веб обертка над бластом.
Очень хороший комикс. Все картинки по теме. Хотя не удивлюсь прибежит токсоплазма с врзгласами "проплачено". Главное, что не потрачено, как в одноименной игре! Все еще надеюсь, что пойдете в команду Фанерозоя как художник.
@TheRaven1) все же прошу прощения, если Вас обидел чем-то, я иногда бываю кажусь слишком резким. Тем не менее во многих лицензиях написано, что скан модели в готовом виде– измененная модель, на которую надо тоже делать лицензию, еще и автору модели доплачивать. А зачем нам этот геморой нужен? И даже если можно сделать скан с изделия, не отрицаю и такое некоторые делают, то это выглядит так: "я купил пачку айфонов, научился делать их копии и раздаю бесплатно,то за что я заплатил деньги, при этом возможно также нарушая авторское право". Мы не относим себя к студии бесплатных репаков аля " механики".
2) Поэтому прошу поймите и нас. В этом плане абсолютно солидарен с Николаем.
3) Все же есть сувениры некоторые мы продаем, например брелок тираннозавра.Модель распространяется по бесплатной лицензии здесь. Однако, у нас с обработкой и с покрасом. И недорого. Также будут авторские фигурки и брелоки, модели которых опять же нигде выкладывать не будем.
Во-первых, я не завожусь, это называется критика, и обижать никого не хочу.
Во-вторых, касаемо доводки слои все-равно видны, но согласен обычному человеку, это действительно зайдет, но мы были ориентированы изначально для ученых и в ВУЗы для которых делали бесплатно, а потом стали делать и для других пользователей за деньги, но по качеству, как в вуз. Поэтому у нас это дело уже налажено. И мы не ориентированы на массы. Делаем на заказ. Наши клиенты— это те, которые хотят прикоснуться к качеству.
В-третьих, да у нас есть модели намного качественнее большинства представленного по ссылке, но эти модели мы покупали, на которых распространена лицензия. На модели были потрачены свои кровные, а пиратство мы не поддерживаем. Если Вас интересует скан, или модель, то сканы можно получить по согласованию с институтами, либо купить модели у продавца. Купить модель тоже не составляет труда. Кончено это чуть сложнее чем просто скачать, тут надо потратиться, но в остальном тоже самое.
1)Я бы не сказал, что модель черепа велоцираптора хорошая, Вы обратите внимание на строение скул и носовой пазуи модели и нашего изделия. Модель по Вашей ссылке будто делалась для 3D игр. Тоже касается скелетов тираннозавра и трицератопса. У нас например, есть реальные сканы Стэна с реальных образцов скелета, со всеми анатомическими подробностями. Многие наши модели это настоящие сканы купленные за дорого. Есть конечно и бесплатные модели, но и они удовлетворяют научной мысли. У нас нет ненаучных моделей и шелуху мы не делаем.
2) С моделями разобрались, теперь что касается фирм. Черепа в натуральную величину они Вам распечатают спору нет, но без ручной обработки и тем более без покраса. При этом возьмут с вас столько, сколько мы берем за изделие, которое выглядит внешне, как реальный объект.
3) Конечно, если у вас нет денег и вас устраивает качество китайской подделки, то почему бы не скачать череп "аля, я делал для игры", или спиратить из телеграмма и отдать в фирму, которая вам и распечатает бутлег. Однако мы ориентированы на качество и научность. Далее сравните также по стоимости реплик подобного качества как у нас с репликами иностранного производства и посмотрите как цена может вырастать до нескольких тысяч долларов. Мы делаем намного ниже европейских цен. Поэтому мнение в духе "пффф, да я проще скачаю и распечатаю в студии"— мнение обывателя в этом вопросе, который просто "мимо проходил"
Они обработаны эпоксидкой, покрашены и залакированны и на ощупь совсем не ощущаются как пластик. Флоренса в продажах пока нет, ибо Kesh Corvus делал его Дробышевскому в подарок, но цену мы можем посчитать на основе потраченных материалов и часов работы. Цены трицератопса и флоренса мы сообщим в ЛС.
У нас есть черепа стоимостью ниже десяти тысяч. Я не уверен можно ли в комментариях писать стоимость, но если хотите узнать подробнее, то напишите в личные сообщения.
Очень интересная статья и с биологической стороны все описано довольно хорошо. Кстати я также предпочитаю бумажную литературу, ибо она действительно дает некоторое чувство контроля. Особенно полезно в определении вида. Гораздо удобнее смотреть в микроскоп, а потом в бумажную книгу, нежели в электронную книгу.
Google scholar, или pubmed зайдите и поищите случаи отравления люпином вследствие поедания животными зеленой части растения, да и семена едят тоже. Ну а в принципе докажите, что не едят, можно научную статью пожалуйста?
Выравнивание в blast ncbi, который по сути и есть blast происходит след. образом: загружается файл fasta и далее можно произвести множественное выравнивание. Выравнивание в ugene— загружается файл fasta и производится множественное выравнивание.
Веб интерфейс бласта представлен для удобства работы с алгоритмом бласт, по сути на ncbi работают на алгоритме blast, при помощи интерфейса. Об этом написано и в списке литературы.
P.S. Мы разбираемся в области в которой пишем. Мы считаем, что ответили максимально развернуто, на абстрактные претензии и мы так и не увидели от Вас компетентных комментариев без переходов на личности. Поэтому мы справедливо считаем, что этот вопрос закрыт. Если же вы хотите поспорить, то напишите опровержение данной статьи. Далее мы не будем кормить вас нашим временем. Всего доброго.
С десятками не работал, но работал с тысячей. Сложно, долго, мучительно, но возможно. Работал с десятком тысяч в mega 10 при нажатии ncbi blast. Там есть эта функция. Комп при этом работает сутками.
К туче таких же как и blast
И? Работают многими способами, где это отрицалось? Вопрос риторический— нигде не отрицалось, это был пример.
С бластом никто не запрещал сравнивать. Мы могли сравнить и с Genious, но решили сравнить с Blast, как и ученые в списках использованной литературы тоже сравнивали. И ничего страшного не произошло.
Аппеляция к личности.
P.S. Не бомбите в комментариях. Напишите опровержение этой статьи на хабре.
Текст был написан при консультации с биоинформатиками. Касаемо обертки, дык с генами работают в визуализации на странице ncbi. В Ugene есть куча всего того, что и есть в blast.
Аппеляция к личности....
Очень хороший комикс. Все картинки по теме. Хотя не удивлюсь прибежит токсоплазма с врзгласами "проплачено". Главное, что не потрачено, как в одноименной игре! Все еще надеюсь, что пойдете в команду Фанерозоя как художник.
16.000 тысяч трицератопс.
Спросил администрацию и цену в я пиарюсь можно называть. Череп велоцираптора у нас стоит 7.000 рублей
@TheRaven1) все же прошу прощения, если Вас обидел чем-то, я иногда бываю кажусь слишком резким. Тем не менее во многих лицензиях написано, что скан модели в готовом виде– измененная модель, на которую надо тоже делать лицензию, еще и автору модели доплачивать. А зачем нам этот геморой нужен? И даже если можно сделать скан с изделия, не отрицаю и такое некоторые делают, то это выглядит так: "я купил пачку айфонов, научился делать их копии и раздаю бесплатно,то за что я заплатил деньги, при этом возможно также нарушая авторское право". Мы не относим себя к студии бесплатных репаков аля " механики".
2) Поэтому прошу поймите и нас. В этом плане абсолютно солидарен с Николаем.
3) Все же есть сувениры некоторые мы продаем, например брелок тираннозавра.Модель распространяется по бесплатной лицензии здесь. Однако, у нас с обработкой и с покрасом. И недорого. Также будут авторские фигурки и брелоки, модели которых опять же нигде выкладывать не будем.
Во-первых, я не завожусь, это называется критика, и обижать никого не хочу.
Во-вторых, касаемо доводки слои все-равно видны, но согласен обычному человеку, это действительно зайдет, но мы были ориентированы изначально для ученых и в ВУЗы для которых делали бесплатно, а потом стали делать и для других пользователей за деньги, но по качеству, как в вуз. Поэтому у нас это дело уже налажено. И мы не ориентированы на массы. Делаем на заказ. Наши клиенты— это те, которые хотят прикоснуться к качеству.
В-третьих, да у нас есть модели намного качественнее большинства представленного по ссылке, но эти модели мы покупали, на которых распространена лицензия. На модели были потрачены свои кровные, а пиратство мы не поддерживаем. Если Вас интересует скан, или модель, то сканы можно получить по согласованию с институтами, либо купить модели у продавца. Купить модель тоже не составляет труда. Кончено это чуть сложнее чем просто скачать, тут надо потратиться, но в остальном тоже самое.
1)Я бы не сказал, что модель черепа велоцираптора хорошая, Вы обратите внимание на строение скул и носовой пазуи модели и нашего изделия. Модель по Вашей ссылке будто делалась для 3D игр. Тоже касается скелетов тираннозавра и трицератопса. У нас например, есть реальные сканы Стэна с реальных образцов скелета, со всеми анатомическими подробностями. Многие наши модели это настоящие сканы купленные за дорого. Есть конечно и бесплатные модели, но и они удовлетворяют научной мысли. У нас нет ненаучных моделей и шелуху мы не делаем.
2) С моделями разобрались, теперь что касается фирм. Черепа в натуральную величину они Вам распечатают спору нет, но без ручной обработки и тем более без покраса. При этом возьмут с вас столько, сколько мы берем за изделие, которое выглядит внешне, как реальный объект.
3) Конечно, если у вас нет денег и вас устраивает качество китайской подделки, то почему бы не скачать череп "аля, я делал для игры", или спиратить из телеграмма и отдать в фирму, которая вам и распечатает бутлег. Однако мы ориентированы на качество и научность. Далее сравните также по стоимости реплик подобного качества как у нас с репликами иностранного производства и посмотрите как цена может вырастать до нескольких тысяч долларов. Мы делаем намного ниже европейских цен. Поэтому мнение в духе "пффф, да я проще скачаю и распечатаю в студии"— мнение обывателя в этом вопросе, который просто "мимо проходил"
Они обработаны эпоксидкой, покрашены и залакированны и на ощупь совсем не ощущаются как пластик. Флоренса в продажах пока нет, ибо Kesh Corvus делал его Дробышевскому в подарок, но цену мы можем посчитать на основе потраченных материалов и часов работы. Цены трицератопса и флоренса мы сообщим в ЛС.
У нас есть черепа стоимостью ниже десяти тысяч. Я не уверен можно ли в комментариях писать стоимость, но если хотите узнать подробнее, то напишите в личные сообщения.
Ждем еще!
Очень интересная статья и с биологической стороны все описано довольно хорошо. Кстати я также предпочитаю бумажную литературу, ибо она действительно дает некоторое чувство контроля. Особенно полезно в определении вида. Гораздо удобнее смотреть в микроскоп, а потом в бумажную книгу, нежели в электронную книгу.
Google scholar, или pubmed зайдите и поищите случаи отравления люпином вследствие поедания животными зеленой части растения, да и семена едят тоже. Ну а в принципе докажите, что не едят, можно научную статью пожалуйста?
Спасибо за замечательный комментарий
Сейчас открыт
для кормления скота используют специальные сорта люпинов с пониженным содержанием алкалоидов
Позабавил рассказик