Уже замечено несколькими людьми, что бывают проблемы: svn забирает последнюю версию из репозитория, а файлы забираются не все. Видно что в рабочей папке файлов не хватает, а в репозитории они лежат, повторный update не помогает. Спасает удаление всей «больной папки» и update внешней содержащей. В общем будьте внимательны — версии 1.6.x (такое было на нескольких версиях).