Комментарии 13
Откуда 81? 4 разных нуклеотида — 2 бита, триплет — 6 битов, 64 комбинации. Из них для кодирования аминокислот используется порядка 20, но при кодировании информации, видимо, можно этим не ограничиваться и использовать все 64 комбинации
Меня всегда удивляло, что при таком подсчёте человеческий геном занимает 800Мб, 1CD, обидно как-то
Какую-то мета информацию удалось обнаружить, если можно так трактовать метилирование, да только сильно ли больше информации получается даже с учётом этого?
Метилирование не очень хороший пример, в этой ветке речь пошла о некодирующей (белки) днк, а не в целом существующей метаинформации (есть еще модификация гистонов, также метилирование аденина рнк и тд)
Под мусорной(junk dna) днк раньше подразумевалась часть днк, которая не кодирует белки. У человека белки кодируются 1-2% днк, остальное или не в генах или вырезается при процессинге рнк. В некодирующей части по даннным encode до 70% днк экспрессируется. Т.н она кодирует не белки, а другие вещи. Например, microRna, влияющие на управление транскрипцией других генов. Классификация некодирующей днк довольно обширная, но в целом это плохо изучено.
Под мусорной(junk dna) днк раньше подразумевалась часть днк, которая не кодирует белки. У человека белки кодируются 1-2% днк, остальное или не в генах или вырезается при процессинге рнк. В некодирующей части по даннным encode до 70% днк экспрессируется. Т.н она кодирует не белки, а другие вещи. Например, microRna, влияющие на управление транскрипцией других генов. Классификация некодирующей днк довольно обширная, но в целом это плохо изучено.
Просто это был комментарий на последнюю фразу про мета-информацию. Говорить о "мусорной" ДНК я не стал, так как слишком много есть чего сказать на эту тему, чтобы это было можно оформить в виде комментария разумной длины
P.S. В тех 800Мб учитывается вся ДНК, включая "мусорную", так что я изначально её не откидывал, когда ставил вопрос, почему так "мало" информации формально получается при прямом подсчёте (если например сравнить с размером полного дистрибутива Debian).
Возможно масс-спектрометр упоминался в контексте кодирования аминокислотами, а не нуклеотидами. Вы правы, конечно же ДНК читается не масс-спектрометром, а секвенатором.
Готов предоставить пару грамм ДНК для ЦХД за умеренную плату.
http://bigbangtv.ru/video/s1e1.php — баянишь, че.
Зарегистрируйтесь на Хабре, чтобы оставить комментарий
Пятничный формат: ДНК и решение проблемы хранения данных