Зачем нужно соединять Java-программу на компьютере и Arduino?

[Serge78rus]

Для управления компьютером с помощью различных инфракрасных пультов ДУ есть же LIRC. Так же есть порт для Винды — WinLIRC.

[Teapot]

Кстати, можно взять Liberica JDK Embedded
https://bell-sw.com/pages/libericajdk-for-embedded/
и для операций с COM-портом использовать готовый UART из модуля DIO:
https://docs.oracle.com/javame/8.2/api/dio/api/jdk/dio/uart/UART.html