Почему не стоит использовать LocalStorage

поскольку поставщики этих скриптов частенько их меняют для расширения функционала и прочих вещей

Все адекватные поставщики скриптов указывают версию скрипта. И если я поставил версию 2.3.456 с указанием Integrity, ссылка на неё должна оставаться неизменной. Тут больше вопрос использования адекватных библиотек.