alizar 12 мая 2008 в 05:16

Фолдинг белков превратили в компьютерную игру

2 мин

16K

Биотехнологии

+37

Комментарии 36

EtherCrow 12 мая 2008 в 07:50

В самом деле, все геймеры нашего мира тратят миллиарды человеко-часов на бесполезные для человечества игры типа WoW, Counter-Strike или пасьянса «Косынка». В то же время они могли бы использовать интеллект более эффективно: например, воспроизводя убийство Кеннеди.
http://en.wikipedia.org/wiki/JFK_Reloade…

Ferencbaki 12 мая 2008 в 07:57

Наступила эра полезных игр?

propulsivo 4 авг 2008 в 11:40

никуда не уходила - все дело в том, что ты выбираешь.

XaocCPS 12 мая 2008 в 08:28

Про игроков: вы думаете, что в игры играют ради пользы чтоли? Игроки с таким же успехом могли отвлечься не на сомнительные поиски протеинов, а на семью, работу, учебу. Призыв к игроками сменить WoW на сворачивание белков - это просто крик в воздух.

Davidov 12 мая 2008 в 15:29

Мне кажется, некоторых игроков в «Косынку» вполне можно переманить.

BuriK666 12 мая 2008 в 09:24

Если будет интересно, можно и поиграть с пользой для других...

Frosty 12 мая 2008 в 13:47

А вот не выпустить линушную версию-большая ошибка, игра пришлась бы к стати, т.к. я думаю 99.99999% вендо-юзеров не променяют кс и вов на простенькую игру, которые как раз любят в мире linux.

uranik 12 мая 2008 в 15:42

Ты недооценил количество играющих в косынку.

Marsikus 13 мая 2008 в 00:52

А некоторые виндоюзеры, так между делом, запускают клиент BOINC и предоставляют свой комп в сети распределенных вычислений.

Frosty 13 мая 2008 в 01:11

Вот в данный момент крутится BOINC, ищет пульсары.

4twilight 12 мая 2008 в 14:46

//Один из разработчиков игры, профессор биохимии Дэвид Бейкер, искренне верит, что где-то в мире живут таланты, у которых есть врождённая способность просчитывать в уме 3D-модели протеинов.

Спешу разочаровать товарища профессора, таких людей можно по пальцам просчитать: Чак Норрис, Брюс Виллис и Анатолий Вассерман (прощай карма).

+11

avenu 12 мая 2008 в 14:59

Судя по скриншоту, программа все же направляет человека к наиболее вероятным решениям.

ESQUELETO 12 мая 2008 в 20:01

Брюс Уиллис прилетел и насрал в карму здесь. За «Виллис».

grokinn 12 мая 2008 в 15:01

не совсем понял как ручной перебор сокращает моделирование на порядок. То как люди руками свернут белок тоже в общем то случайно, люди ведь даже приблизительно не понимают как его надо сворачивать. А если считать что люди просто отбросят ряд нереальных вариантов по какому либо признаку, почему нельзя это алгоритмизировать в folding@home?

yvanko 12 мая 2008 в 18:16

А почему в шаматы компьютер обыграл человека не так давно, а в го вообще не может даже приблизиться к чемпионству?

grokinn 12 мая 2008 в 18:59

компьютер и двадцать лет назад обыгрывал меня в шахматы и в го. Мы ведь говорим о конкретном человеке (мне) а не об абстрактном человеке. Понятное дело что этот профессор может свернуть белок гораздо хитрее компьютера но игра то сделана для миллионов людей вообще ничего не понимающих в белках в этом смысле не вижу принципиального отличия их от компьютера который просто перебирает варианты.

yvanko 12 мая 2008 в 23:08

"Один из разработчиков игры, профессор биохимии Дэвид Бейкер, искренне верит, что где-то в мире живут таланты, у которых есть врождённая способность просчитывать в уме 3D-модели протеинов" - на нас с вами автор и не рассчитывает

fuck_u 12 мая 2008 в 23:56

Потому что компьютер перебирает либо в полном рандоме, либо по порядку, а человек существо хитрожопое и его рандом однозначно круче, ведь есть счастливчики которые миллионы выигрывают, а вот компьютеров таких нет.

Rational_Yurij 13 мая 2008 в 02:34

Функция потенциальной энергии белка от взаимного расположения его "жестких" частей - функция многоэкстремальная, а переменных несколько десятков-сотен, поэтому компьютер может проваливаться в "потенциальные ямы" - находить неминимальные минимумы и топтаться вокруг них, а человек интуитивно может задать форму, которая укажет компьютеру на нужную "чашу экстремума", до дна которой он уже уверенно доберется с помощью точной математики.
(Это я говорю с полчаса поигравшись с этой программой и вроде бы поняв что там к чему)

alexzzam 12 мая 2008 в 15:58

Ну и правильно! Если игра подходит для "детей и секретарш", значит огромная армия casual-геймеров тоже может заинтересоваться. Ну и плюс осознание, что занят полезным делом... Может набрать достаточно народу, чтобы получилась достойная "вычислительная мощность"...
Вот не факт, что такие ручные свёртки окажутся действительно полезны для дела. Но им виднее, да.

rimmer333 12 мая 2008 в 16:30

Некоторые тратят часы на такие интересные игры, как С++, Java или HTML - число попыток в этом классе игр обычно бесконечно, программы для участия в игре можно раздобыть и использовать бесплатно, сюжет нелинеен и находится в тесном взаимодействии с реальным миром и игроками, а число концовок не представляется вохможным назвать :)

hellraiser09 12 мая 2008 в 17:12

С++, Java или HTML

это для казуальщиков, труЪ-геймеры играют в Assembler и Brainfuck

-3

calculator 12 мая 2008 в 18:01

...ну или так от нечего делать собрать новое мегооружье, просто потому что ты вот немножечко не так на вещи смотришь...

Mainer 12 мая 2008 в 18:12

а мультиплеер будет? ))

Catalyst 12 мая 2008 в 21:38

А зарплата МНСа будет?)

fuck_u 12 мая 2008 в 21:53

Оооо! Всё! Мы пошли фул пати, рэйд босса рашить! :)

Marsikus 13 мая 2008 в 00:55

Но ведь такой метод позволит выполнять сворачивание, форма которого будет просто навеянна юзеру уже имеющейся геометрической формой. А как быть с воздействием температуры, электрического тока, химических веществ?

Rational_Yurij 13 мая 2008 в 02:21

Под воздействием этих факторов белок наоборот "расфоливается". Такая задача совсем не стоит =)

VovixLDR 13 мая 2008 в 05:47

Блин... digg-эффект в действии. Скачал это чудо, пробую зарегиться на сайте - ответа ноль и сайт вообще грузится с трудом:(. Похоже, до него добралась армия американских секретарш... Срочно требуется вмешательство Google. В рейтинге пока не видно ни одной русскоязычной команды, тема действительно свежая. Однако можно для начала поиграть в оффлайне.

Сама игрушка весьма головоломная, это вам не тетрис:) Тут особое мышление нужно, как в шахматах или бильярде. Потенциально может стать новым видом киберспорта:) Если бы еще интерфейс оптимизировать... сводить мышью две спиральки друг к другу сложновато. Застрял на некоторое время на уровне 3-3. В общем, там оранжевые (гидрофобные) отростки надо прятать за синими, что ли... 8934 из 8935... YES!!!11111 53 мин 09 сек... Нехилый такой убийца времени. Дальше несколько сравнительно легких уровней (особо примечателен 4-2), но затем идет коварное западло 5-1 с выносом мозга. Вот и 5-3 Final Challenge, тоже довольно легкий. Возможно потому, что под конец обучения начинаешь понимать, как этот трехмерный пазл складывается, на более высоком уровне.

А вот в онлайне уже начинается серьезный фолдинг. Мало собрать все в единое целое, надо минимизировать "хвосты", которые мешают занять первое место в рейтинге. Пока добрался до 338 из нескольких тысяч. На сегодня все, время пожирать эта игрушка умеет:)

VovixLDR 13 мая 2008 в 06:31

Теперь отбросим игровой азарт и подумаем об экономической ценности создаваемых решений.

Фактически игра (когда в ней начнется дизайн молекул под определенную задачу) может стать мощным инструментом разработки биохимических структур - тем же, чем для промышленного 3D-моделирования является AutoCAD. Говорят, первые программисты тоже "игрались" с кодом. Фактически мы с вами присутствуем при зарождении новой профессии или даже целой индустрии. Пускай это всего лишь аналог Basic, рано или поздно из спортивного такое творчество превратится в профессиональное, а его продукты будут лицензироваться и выполняться на заказ, как сегодня обычный софт. До сих пор фолдинг был наукой, сегодня он превращается в искусство. Добро пожаловать в эпоху биодизайна. Кто поставит его на коммерческие рельсы, тот станет... если не Гейтсом, то как минимум Джобсом нового времени.

mightymind 7 июл 2008 в 22:13

Такое творчество стало профессиональным у нас в России лет 10 назад. Есть знакомые, которые именно тем и зарабатывают, что решают нетривиальные задачи химии и биотехнологии. Про Запад вообще молчу.