Простите, но в статье по вашей ссылке автор наоборот, не рекомендует копировать раннеры в директорию вашего проекта, а предлагает скопировать код вашего проекта (папку lib) внутрь примера из flutter-desktop-embedding.
Я полагаю, что тут та же ситуация, что и при сборке для мобилок — в дебаге Flutter довольно прожорлив, но в релизной сборке очень компактен (по сравнению с другими кроссплатформенными решениями)
А я правильно понимаю что это не совсем релизная фишка для Flutter? Какое сейчас состояние у Flutter для desktop (alpha? beta? RC?) и где его можно отслеживать?
Собираем Flutter приложение для десктопа