Вместо боковой панели закладок использую замечательный аддон TagSifter. Позволяет отказаться от привычных папок с закладками в пользу меток.
При этом существенно облегчается поиск (можно использовать облако или обычный список тегов для фильтрации). А для быстрого добавления закладки с назначением меток есть tweez.
TagSifter ругается на несовместимость с 3.5, что легко поправимо в install.rdf. Глюков при этом не замечал.
5 способов занять боковую панель в Firefox