Прекрасно было бы сортировать ветки комментариев не по времени, а по рейтингу.

Это бы избавило от поиска интересных веток обсуждения среди большого количества комментариев. Так же, исчез бы смысл оставлять комментарий самым первымнах. А на бред и флуд было бы достаточно потратить один минус, и для дела оставалось бы больше голосов.

Да, были бы мы в сказке, то комментарий с положительным рейтингом влиял бы на рейтинг и позицию родительских комментариев, а то и на рейтинг хабратопика. Но тогда бы появилась личная заинтересованность ставить плюсы комментариям и ответам адресованных к Вам. Так что учитывать общий вес положительных дочерних комментариев для сортировки не пойдёт.