Да, есть такая грубость. В banner-friendly версии я это исправил, а вам могу посоветовать открыть стиль для редактирования и убыть строчку: #footer {display:none !important;}
Ещё имеет значение, какой из стилей (основной стиль скина или патч) вступают в силу позднее, так как имеет место перекрытие стилей. Нужно, чтобы патч вступал в силу последним.
#footer {display:none !important;}
.panel-search {left:457px;}
Только что доработал юзер-стиль и опубликовал топик:
Ре-редизайн Хабра продолжается (user style «Inversion compact skin v1.1»)