В чем разница и когда что использовать? Это был один из вопросов, на которые я пытался получить ответ.

Попытаюсь тут описать ту практику, которую считаю не плохой. С примерами на PHP. Постараюсь описывать на простом языке - без использования сложной терминологии.

Лучше всего это два подхода понимаются в слоистой архитектуре(слой презентации, доменный, инфраструктура, приложение - те, которые на текущий момент я использую в итоговом примере).