CPython vs. IronPython: вычисление MD5-хеша

output += Path.GetFileName(fname) + ':' + md5sum + '\n'
не подойдёт, так как возвращает только имя файла, тут же нужно относительный путь от корневой директории исключая её саму. То есть, если файл лежит где-то в /home/username/project/app/lib/file.py должно вернуться /lib/file.py чтобы удобно можно было потом на стороне клиента сравнить с таким же файлом не затрагивая текущую директорию, которая потенциально может отличаться.

В целом, благодарю за советы, пожалуй, так правильнее, хоть и не влияет на скорость.

CPython vs. IronPython: вычисление MD5-хеша

так же мало повлияло на результат:
0:00:00.161000
0:00:00.091000
0:00:00.094000
0:00:00.098000
0:00:00.096000
0:00:00.096000
0:00:00.098000
0:00:00.097000
0:00:00.100000
0:00:00.096000

CPython vs. IronPython: вычисление MD5-хеша

Совершенно не влияет. По крайней мере в таком масштабе. Хотя, понятно, что в теории должно.
Тот же замер, во второй колонке md5 = MD5CryptoServiceProvider() вынесена в глобальную область
0:00:00.174000 vs 0:00:00.172000
0:00:00.092000 vs 0:00:00.100000
0:00:00.097000 vs 0:00:00.100000
0:00:00.096000 vs 0:00:00.094000
0:00:00.103000 vs 0:00:00.096000
0:00:00.102000 vs 0:00:00.102000
0:00:00.104000 vs 0:00:00.097000
0:00:00.098000 vs 0:00:00.097000
0:00:00.095000 vs 0:00:00.095000
0:00:00.096000 vs 0:00:00.095000