User-боты в Telegram: Простая автоматизация с Python (Pyrogram). Первые шаги

Юзерботами достаточно удобно парсить сообщения, так как обычные боты могут только пересылать сообщения из одного чата в другой.

Desktop приложение для хранения текстовой информации

Насчёт алгоритмов шифрования и опенсурса - современные алгоритмы шифрования позволяют и с наличием опенсурс вполне надёжно шифровать данные, WireGuard тому пример