Рецепты этих белков, называемых генами, закодированы в нашей ДНК.
Что? Далеко не все гены являются «рецептами» белков.
За последние пять десятилетий ученые смогли распознать формы белков в лабораторных условиях с помощью экспериментальных методов, таких как криоэлектронная микроскопия, ядерный магнитный резонанс или рентгеноструктурный анализ, но каждый метод был выведен путем множества проб и ошибок, которые заняли годы и стоили десятки тысяч долларов.
Что выведено?
Наша команда сосредоточилась именно на задаче моделирования целевых форм с нуля, без использования ранее решенных белков в качестве шаблонов.
Во-первых не решенных белков, а решенных пространственных структур. Во-вторых либо авторы лукавят либо имеется ввиду, то что они напрямую не делали моделирование по гомологии первичной структуры. В данном варианте перевода можно понять так, что они не использовали экспериментальные структуры, хотя это не так — на чём то они обучали нейросеть.
Используя эти оценочные функции, мы смогли найти структуры, соответствующие нашим прогнозам.
Где найти? В RCSB PDB? Тогда подход странный. Видимо всё таки некорректный перевод.
Понимание процесса фолдинга белка также может помочь в разработке вида белка, который принесет существенный вклад в окружающую действительность.
А я не понимаю, как использование фактически чёрного ящика — нейросети поспособствует пониманию процесса фолдинга? Другое дело предсказание с целью драг-дизайна — здесь конечно есть прогресс.
Мы без конца проклинаем товарища Сталина, и, разумеется, за дело. И все же я хочу спросить — кто написал четыре миллиона доносов? Дзержинский? Ежов? Абакумов с Ягодой?
У Вас много фактических ошибок в утверждении:
1) Автоматия дыхательных движений обусловлена обратной связью, но не с хеморецепторами, а с механорецепторами альвеол.
2) Модулируется автоматия внешними сигналами от хеморецепторов и сигналами от других отделов мозга, но хеморецепторы гипоксии намного меньше принимают в этом участие, в основном рецепторы CO2 — поэтому так опасно понижение концентрации кислорода в воздухе, без увеличения концентрации CO2.
В заметке много фактических ошибок: фермент rubisco не по ошибке
захватывает кислород- это вторая функция фермента оксигеназная в результате неё осуществляется синтез ФГК и по-видимому эта функция важна для растений. Оксигеназная функция наоборот появилась у высших растений когда в атмосфере стало много свободного кислорода. У бурых водорослей фермент крайне специфичен к углекислому газу и работы по генной инженерии ведутся чтобы перенести фермент бурых водорослей к культурным растениям. Это должно якобы увеличить урожайность однако выключения оксигеназной активности может нарушить метаболические пути. В статье неплохо бы рассказать ещё о двух фазах фотосинтеза и о роли rubisco именно во второй стадии.
В любом случае мы или добьёмся того, чтобы закон был исполнен, или компания прекратит работать на территории Российской Федерации, как, к сожалению, произошло с Linkedin.
Эта карта получена методом РСА и используется лишь для решения структур этим методом. Во-первых для физически полностью достоверной карты плотности необходимо знать интенсивность расселения центрального пучка, что практически невыполнимо. Второе не индентифицируются атомы водорода
так как они требуют очень совершенных кристаллов способных сеять с разрешением выше 0.5 ангстрем. В третьих фазы структурных факторов в белковой кристаллогрвфмм находится косвенным методами. Принимая всё это и ещё нисколько приближений во внимание,
можно решать структуры белков, но вот делать какие то глубокие выводы по поводу устройства электронных оболочек атомов и молекул я бы не стал.
Это разве мало?
Что? Далеко не все гены являются «рецептами» белков.
Что выведено?
Во-первых не решенных белков, а решенных пространственных структур. Во-вторых либо авторы лукавят либо имеется ввиду, то что они напрямую не делали моделирование по гомологии первичной структуры. В данном варианте перевода можно понять так, что они не использовали экспериментальные структуры, хотя это не так — на чём то они обучали нейросеть.
Где найти? В RCSB PDB? Тогда подход странный. Видимо всё таки некорректный перевод.
А я не понимаю, как использование фактически чёрного ящика — нейросети поспособствует пониманию процесса фолдинга? Другое дело предсказание с целью драг-дизайна — здесь конечно есть прогресс.
С. Довлатов
1) Автоматия дыхательных движений обусловлена обратной связью, но не с хеморецепторами, а с механорецепторами альвеол.
2) Модулируется автоматия внешними сигналами от хеморецепторов и сигналами от других отделов мозга, но хеморецепторы гипоксии намного меньше принимают в этом участие, в основном рецепторы CO2 — поэтому так опасно понижение концентрации кислорода в воздухе, без увеличения концентрации CO2.
захватывает кислород- это вторая функция фермента оксигеназная в результате неё осуществляется синтез ФГК и по-видимому эта функция важна для растений. Оксигеназная функция наоборот появилась у высших растений когда в атмосфере стало много свободного кислорода. У бурых водорослей фермент крайне специфичен к углекислому газу и работы по генной инженерии ведутся чтобы перенести фермент бурых водорослей к культурным растениям. Это должно якобы увеличить урожайность однако выключения оксигеназной активности может нарушить метаболические пути. В статье неплохо бы рассказать ещё о двух фазах фотосинтеза и о роли rubisco именно во второй стадии.
Или Телеграмм… Упс…
Самое очевидное, что эти затраты никому не нужны, кроме некоторых чиновников и аффилированных с ними структур.
так как они требуют очень совершенных кристаллов способных сеять с разрешением выше 0.5 ангстрем. В третьих фазы структурных факторов в белковой кристаллогрвфмм находится косвенным методами. Принимая всё это и ещё нисколько приближений во внимание,
можно решать структуры белков, но вот делать какие то глубокие выводы по поводу устройства электронных оболочек атомов и молекул я бы не стал.