Для создания переносимых многопоточных приложений предлагаю воспользоваться библиотекой Glib.
Glib — это достаточно большая кросс-платформенная библиотека, которая, кроме потоков, включает в себя поддержку интернационализации, работу со строками, массивами, файлами, таймерами, и много чего другого, вплоть до XML парсера и поддерки .ini конфигурационных файлов.
В тоже время эта библиотека достаточно маленькая и почти не имеет зависимостей, что позволяет без особых проблем включать её в Windows-проекты, а в unix-подобных системах Glib уже есть.