Просто в апаче уже есть mod_php. Обычно php_fpm используют в связке с nginx. Я вот и пытаюсь понять, в чем преимущество апача над nginx в данной схеме?
Как и любой другой парадокс этот основан на смешении мета-языка и языка-объекта. Об этом давно еще писал Альфред Тарский, — нельзя в фразе (язык-объект) говорить о ней самой (мета-язык).
Чтобы не тащить доктрину в сущность можно вынести ее аннотации, например, в xml.
Более того, если вдруг потребуются разные реализации, например, для разных сред, то приколоченную гвоздями реализацию легко можно забыть в конфиге.