Многие пользователи iPod под Linux рано или поздно сталкиваются с проблемой конвертирования видео под этот замечательный девайс. Стандартных средств для этого нет.
Для конвертации будем использовать скрипт mp4ize.

sudo apt-get install ruby ffmpeg liblame-dev libxvidcore4-dev
sudo apt-get install liba52-dev libdts-dev libgsm1-dev libvorbis-dev
sudo apt-get install libxvidcore4 libxvidcore-dev libdc1394-dev libfaac-dev
sudo apt-get install libx264-dev libfaac-dev libfaad2-dev build-essentials
sudo apt-get build-dep ffmpeg

Качаем скрипт отсюда. Сохраняем. Копируем в /bin. Делаем исполняемым.

sudo cp mp4ize /bin/mp4ize
sudo chmod +x /bin/mp4ize

После этого по идее все должно заработать командой

mp4ize file.avi

Однако у меня скрипт начал ругаться на xvid кодек. Пришлось перекомпилировать ffmpeg.

sudo apt-get build-dep ffmpeg
sudo env DEB_BUILD_OPTIONS=risky sudo apt-get -b source ffmpeg
cd 'ffmpeg-0.cvs20070307'
sudo ./configure --enable-gpl --enable-pp --enable-pthreads \
--enable-libvorbis --enable-libogg --enable-liba52 \
--enable-libdts --enable-libgsm --enable-dc1394 \
--disable-debug --enable-shared --enable-xvid \
--enable-libfaac --prefix=/usr/local
sudo make
sudo make install

После вышеперечисленных манипуляций и танцев у меня все заработало.
Сперто отсюда и отсюда.
Кросспост